Page 25 - 《广西植物》2020年第5期
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5 期                           徐祥林等: 罗汉果内生真菌多样性研究                                           6 2 1

   法(Neighbor ̄JoiningꎬNJ)对供试菌株进行 ITS 碱基              种不同组织的内生真菌总定殖率为叶片(40%) >
   序列 系 统 发 育 分 析ꎮ Bootstrap 进 行 自 展 次 数 为           茎( 30%) > 根 ( 10%)ꎬ 分 离 率 的 变 化 规 律 为 叶
   1 000的置信度检测ꎬ根据系统发育树中的组群关                          (0.83) >茎(0.67) >根(0.3)ꎮ
   系对菌株进行分类ꎮ                                             罗汉果雌雄两种植株中不同组织内生真菌的
   1.4 内生真菌的多样性指数统计分析方法                              定殖率及分离率的变化规律均有很大差异ꎮ 在雌
   1.4.1 定殖率( colonization rateꎬCR)   指生长内生          株中ꎬ以根中内生真菌的定殖率和分离率最高ꎬ叶
   真菌的组织块数量与全部样本组织块数量百分                              片中的最低ꎻ在雄株中ꎬ以叶片中的定殖率和分离
   比ꎬ即 CR(%)= ( 生长内生真菌的组织块数 / 分离                     率最高ꎬ根中的最低ꎮ

   的组织块总数) ×100ꎮ                                     2.2 内生真菌的组成
   1.4.2 分离率(isolation rateꎬIR)   指从样本组织块                采用不同培养基( PDA、CMA、NGA) 培养内生
   中得到的菌株数量与全部样本组织块数量的比                              真菌ꎬ通过形态学鉴定ꎬ利用五界分类系统ꎬ根据
   值ꎬ即 IR = 分离得到的内生真菌菌株数量 / 分离的                      «真菌词典»第 10 版分类系统ꎬ将 122 株菌株鉴定

   组织块总数ꎮ                                            为 9 个 属ꎬ 均 归 属 于 子 囊 菌 门 ( Ascomycota )
   1.4.3 相对频率(relative frequencyꎬRF)  分离到某           (表 2)ꎬ包含座囊菌纲( Dothideomycetes) 和子囊菌
   种属内生真菌的菌株数量占分离到的所有总菌株                             纲( Sordariomycetes)ꎮ 其中ꎬ座囊菌纲真菌包含 3
   数量的百分数ꎬ即 RF(%) = ( 某种属内生真菌菌                       科、3 属ꎬ子囊菌纲真菌包含 6 科、6 属ꎮ 从 150 株

   株数量 / 分离到的所有内生真菌总菌株数) ×100ꎮ                       菌株中挑选 23 株代表性菌株进行分子鉴定ꎬ将测
   1.4.4 多样性指数( H′)   根据 Shannon ̄Weiner 指            序成功的 16 株菌株的 ITS 序列在 GenBank 数据库
                          k
   数公式计算ꎬ即 H′ = -         Pi × lnPiꎮ 式中:k 指某       中进行 BLAST 比对ꎬ相关结果及 16 株菌株的 Gen ̄
                          i = 1
   种植物或组织中内生真菌种类的总数ꎻPi 某种属                           Bank 序列号见表 3ꎮ 在 GenBank 数据库中选取相
   内生真菌的菌株数量占分离到的所有总菌株数量                             似性较高且已知种属名的序列ꎬ采用 MEGA Ⅹ以
   的百分数ꎮ                                             NJ 法构建系统进化树(图 1) 分析其同源性ꎮ 基于
   1.4.5 相似性系数( CS)   根据 Sorenson 系数公式               ITS 序列的 BLAST 比对结果和系统进化聚类分析ꎬ
   计算ꎬ即 CS = 2j/ (a+b)ꎮ 式中: j 是两种组织中具                并结合形态学特征ꎬ将 16 株菌株 CJ ̄3 ̄2 ̄2、CJ ̄10 ̄
   有的相同内生真菌种类数ꎻa 是一种组织中内生真                           2 ̄2、 CG ̄6、 CG ̄6 ̄1 ̄2 ̄2、 CG ̄10 ̄1 ̄2 ̄4、 CG ̄12 ̄1 ̄1、

   菌的种类数ꎻb 是另一组织中内生真菌的种类数ꎮ                           CG ̄14 ̄2 ̄1、 CF ̄1、 CF ̄1 ̄1 ̄2、 CF ̄2 ̄1、 CF ̄6、 CF ̄7 ̄1、
   相似性系数可以比较两种组织之间内生真菌种类                             XJ ̄1、 XJ ̄1 ̄3、 XJ ̄1 ̄4 和 XY ̄11 ̄3 ̄1 分 别 鉴 定 为
   组成的相似程度ꎮ                                          Colletotrichum fructicola、Colletotrichum gloeosporioides、
                                                     Acrocalymma vagum、Diaporthe sp.、Colletotrichum trun ̄
   2  结果与分析                                          catum、Diaporthe phaseolorum、Fusarium equiseti、Colle ̄
                                                     totrichum fructicola、Sarocladium terricola、Colletotrichum
   2.1 内生真菌定殖率和分离率                                   truncatum、 Cladosporium cladosporioides、 Xylariaceae

       从罗汉果的 210 个组织块中共分离得到 150                      sp.、 Fusarium proliferatum、 Phoma sp.、 Colletotrichum
   株内生真菌( 表 1)ꎮ 其中ꎬ罗汉果雌株分离得到                         fructicola 和 Nigrospora sp.ꎮ

   内生真菌 96 株ꎬ包括根 43 株、茎 27 株、叶片 9 株、                     分子鉴定结果与形态学鉴定结果一致ꎮ 刺盘
   果实 17 株ꎬ四种不同组织中的内生真菌总定殖率                          孢属( Colletotrichum) 真菌的特征:在 PDA 培养基
   为根 ( 100%) > 茎 ( 57%) > 果 实 ( 30%) > 叶 片          上ꎬ菌落主要呈棉絮状ꎬ表面为墨绿色ꎬ背面为褐
   (13%)ꎬ分离率的变化规律为根(1.43) >茎(0.9) >                  色ꎻ气生菌丝为白色ꎬ常带有黑色的分生孢子器和
   果实(0.57) >叶片(0.3)ꎮ 罗汉果雄株分离得到内                     棕色的孢子液ꎻ菌落生长十分迅速ꎬ25 ℃ 恒温培养
   生真菌 54 株ꎬ包括根 9 株、茎 20 株、叶片 25 株ꎬ三                 7 d时ꎬ 菌落直径可达 9 cmꎻ 分生孢子器的数量多ꎬ
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