Page 61 - 《广西植物》2020年第9期
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图 5 差异表达基因聚类热图
Fig. 5 Heatmap of DEGs
表 8 注释的差异表达基因数量统计表
Table 8 Annotation of DEGs in database
差异表达 总和 注释数据库 Annotated databases
基因集
Total
DEGs set
COG GO KEGG KOG NR Pfam Swiss ̄Prot eggNOG
叶 VS 茎 5 444 2 476 3 019 1 972 2 738 5 381 4 662 4 520 5 337
Leaf VS Stem
叶 VS 根 9 331 4 255 4 966 3 357 4 897 9 199 7 900 7 654 9 083
Leaf VS Root
茎 VS 根 5 454 2 633 2 876 1 899 2 768 5 363 4 780 4 629 5 298
Stem VS Root
2.5 DEU 分析 因组杂合度高ꎬ具有优良的发芽率、抗寒性和耐旱
本文应用 DEXSeq( Anders et al.ꎬ 2012) 进行 性(刘本英等ꎬ2008)ꎮ 本研究对都匀地区福鼎大
外显子水平的差异分析ꎬ即 DEU( differential exon 白种茶根茎叶进行了转录组测序ꎬQ30 碱基百分
usage)分析ꎬ设置 FDR<0.01ꎬ该文列出了叶和茎的 比不小于 93.22%ꎬ样品与参考基因组的比对效率
部分 DEU(表 9)ꎮ 在 87.83% ~ 91.14% 之间ꎮ 李明玺等(2018) 对静
安白 茶 芽 和 叶 的 转 录 组 研 究 中ꎬ Q30 值 都 为
3 讨论 87.32%ꎬLiu et al.(2017)对瑞雪的转录组研究中ꎬ
Q20 为 97%左右ꎬWei et al.(2018) 对龙井 43 的转
福鼎大白种茶树是异花授粉的经济作物ꎬ基 录组研究中ꎬ Q30 为 90%左右ꎬ 因此ꎬ 福鼎大白种