Page 140 - 《广西植物》2021年第4期

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原晓龙ᖔ 李云琴ᖔ 张劲峰ᖔ 等঎ 降香黄檀叶绿体基因组密码子偏好性分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ ԰ԡ԰ϟᖔ ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥ ᤃ԰԰ͱᤃሕԡ঎
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降香黄檀叶绿体基因组密码子偏好性分析

原晓龙ᕷ 李云琴ᕷ 张劲峰ᕷ 王জ 毅 ᥍

ྉ 云南省林业和草原科学院ᖔ 云南省森林植物培育与开发利用重点实验室ᖔ 国家林业和
草原局云南珍稀濒特森林植物保护和繁育重点实验室ᖔ 昆明 ᤃጢԡ԰ԡϟ ɯ

摘জ 要ᧅ 为了解降香黄檀叶绿体基因组密码子使用模式ᖔ该文利用 ऊᆍʛᆍႿ ۼ ϟ঎࿗঎԰ 和在线软件 ऊВ୩۪ 对降香
黄檀叶绿体基因组中的 ጢ԰ 条基因编码序列密码子进行中性绘图ܦጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 和 ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 分析ᤥ 结果表明᧥降

香黄檀叶绿体基因组密码子的 ሕ 个位置上 ᥈ऊ 含量依次为 ᥈ऊϟྉ࿗ᤃ঎ԡϟᠮɯ ᢦ᥈ऊ԰ྉሕऐ঎ँऐᠮɯ ᢦ᥈ऊሕྉ԰Ꭾ঎ऐԡᠮɯᤥ
有效密码子数ྉጶશऊɯ范围为 ሕᎮ঎ᤃᤃጲ ጢ࿗঎࿗ሕᖔ及 ጶશऊ 值ᢦ࿗ጢ 的有 ሕᎮ 个ଫ኏୩ऊВᢦϟ 的密码子有 ԰ँ 个ᖔ其中 ϟᤃ 个

以 В 结尾ܦϟ԰ 个以 ዶ 结尾ᤥ 这些说明其偏好以 ዶ 和 В 结尾ᖔ且偏性较弱ᤥ 中性绘图分析显示 ᥈ऊϟ԰ 与 ᥈ऊሕ
的相关系数为 ԡ঎԰ጢԡᖔ相关性不显著ᖔ回归系数为 ԡ঎ሕँ࿗ଫጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 分析显示 ጶશऊ 比值位于ͱԡ঎ԡጢ ጲ ԡ঎ԡጢ 区间
外的基因有 ሕऐ 个ଫ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 分析说明在碱基的使用频率方面ᖔВᢦዶܦ᥈ᢦऊᖔ说明降香黄檀叶绿体基因组密码
子偏好性主要受选择的影响ଫϟँ 个密码子被确定为最优密码子ᤥ 该研究为降香黄檀叶绿体基因工程ܦ遗传

多样性分析等研究提供了科学参考依据ᤥ
关键词ᧅ 降香黄檀ᖔ 叶绿体基因组ᖔ 密码子偏好性ᖔ 选择

中图分类号ᧅ ͐Ꭾጢጢজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰ϟɯԡ࿗᥋ԡᤃ԰԰᥋ԡँ

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收稿日期ᧅ ԰ԡϟँͱԡँͱϟԡ
基金项目ᧅ 国家自然科学基金 ྉ ሕϟऐᤃԡϟᎮᎮɯଫ云 南 省 林 业 科 学 院 热带亚热带珍贵用材树种研发省创新团队 ྉ ԰ԡϟᎮ̀ऊԡ԰࿗ɯ
Џ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ᡷၤᔀ શᑕᡷᔽᆍႿᑕ᤟ શᑕᡷࣼʢᑕ᤟ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ऊၤᔽႿᑕྉሕϟऐᤃԡϟᎮᎮɯଫ ۪ʢᆍ׹ᔽႿዹᔽᑕ᤟ ᧧ႿႿᆍ׹ᑕᡷᔽᆍႿ ᥈ʢᆍࣼᡱ ᆍ஦ ኏ ᪲ ᧕ ᆍ஦ ۪ʢᔀዹᔽᆍࣼ༁ ఋʢᆍᡱᔽዹᑕ᤟
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作者简介ᧅ 原晓龙ྉϟँऐᤃͱɯᖔ硕士ᖔ助理研究员ᖔ主要从事林木分子生物学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ଴ᔽᑕᆍ᤟ᆍႿᢃ݀ ϟ԰ᤃ঎ዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 王毅ᖔ博士ᖔ副研究员ᖔ主要从事植物学和分子生物学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ԰԰ऐ԰ጢऐϟऐ݀ ीी঎ዹᆍቝᤥ