Page 141 - 《广西植物》2021年第4期
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࿗ 期                     原  晓  龙  等  ᧥ 降香黄檀叶绿体基因组密码子偏好性分析                                   ᤃ ԰ ሕ
                 औᑕ༁ ੫ʢᔀᑕᡷᔀʢ ᡷၤᑕႿ ࿗ጢᖔ ᑕႿʛ ᡷၤᔀʢᔀ औᔀʢᔀ ԰ँ ੫ᔀႿᔀ༁ औၤᔀႿ ኏୩ऊВ ׹ᑕ᤟ࣼᔀ औᑕ༁ ੫ʢᔀᑕᡷᔀʢ ᡷၤᑕႿ ϟᖔ ᔽႿዹ᤟ࣼʛᔽႿ੫ ϟᤃ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔀႿʛᔽႿ੫ औᔽᡷၤ В
                 ᑕႿʛ ϟ԰ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔀႿʛᔽႿ੫ औᔽᡷၤ ዶ঎ ఋၤᔀ༁ᔀ ༁ࣼ੫੫ᔀ༁ᡷ ᡷၤᑕᡷ ᡷၤᔀ ዹᆍʛᆍႿ༁ ᡱʢᔀ஦ᔀʢ ᔀႿʛ༁ औᔽᡷၤ ዶ ᑕႿʛ Вᖔ ᑕႿʛ ၤᑕ׹ᔀ ᑕ औᔀᑕҴ ᤦᔽᑕ༁঎ ఋၤᔀ
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                 ԡ঎԰ጢԡᖔ ᑕႿʛ ᡷၤᔀ ʢᔀ੫ʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ዹᆍᔀ஦஦ᔽዹᔽᔀႿᡷ औᑕ༁ ԡ঎ሕँ࿗ଫ ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ʢᔀ׹ᔀᑕ᤟ᔀʛ ᡷၤᑕᡷ ᡷၤᔀʢᔀ औᔀʢᔀ ሕऐ ੫ᔀႿᔀ༁ औၤᔽዹၤ ጶશऊ ʢᑕᡷᔽᆍ
                 ᤟ᆍዹᑕᡷᔀʛ ᤦᔀᢃᆍႿʛ ᡷၤᔀ ༁ᔀዹᡷᔽᆍႿ ஦ʢᆍቝ ͱ ԡ঎ԡጢ ᡷᆍ ԡ঎ԡጢଫ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ༁ၤᆍऔᔀʛ ᡷၤᑕᡷ В ᢦዶ ᑕႿʛ ᥈ ᢦ ऊ ᔽႿ ᡷၤᔀ ᤦᑕ༁ᔀ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ
                 ஦ʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ঎ ఋၤᔀ༁ᔀ ᑕ᤟᤟ ᔽ᤟᤟ࣼ༁ᡷʢᑕᡷᔀʛ ᡷၤᑕᡷ ᡷၤᔀ ዹᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ᤦᔽᑕ༁ ᔽႿ ᡷၤᔀ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᆍ஦ ᦵॹ ᅳʐᅳʗᔠஏᓣʗᐹ औᑕ༁ ቝᑕᔽႿ᤟ᢃ ᑕ஦஦ᔀዹᡷᔀʛ ᤦᢃ
                 ቝࣼᡷᑕᡷᔽᆍႿଫ ϟँ ዹᆍʛᆍႿ༁ औᔀʢᔀ ᔽʛᔀႿᡷᔽ஦ᔽᔀʛ ᑕ༁ ᡷၤᔀ ᆍᡱᡷᔽቝᑕ᤟ ዹᆍʛᆍႿ঎ ఋၤᔀ ᡱʢᔀ༁ᔀႿᡷ ༁ᡷࣼʛᢃ ዹᆍࣼ᤟ʛ ᤦᔀ ࣼ༁ᔀ஦ࣼ᤟ ᔽႿ ᡷၤᔀ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ
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            জজ 在生物体传递遗传信息的过程中ᖔ作为联结                             ԰ԡϟँଫ 王玥琳等ᖔ ԰ԡϟँଫ 张丽佳等ᖔ ԰ԡϟँɯᖔ本研究
            核酸和蛋白质的密码子扮演着重要的角色ྉԻၤᑕႿ੫                           已完成对降香黄檀叶绿体基因组的高通量测序ᖔ通
            ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᖔ构成基因组的 ࿗ 种核苷酸可形成 ᤃ࿗                  过分析降香黄檀叶绿体基因组蛋白编码区ྉዹᆍʛᔽႿ੫
            种密码子ᖔ各密码子与氨基酸相对应ᖔ除甲硫氨酸                             ᧕શዶ ༁ᔀीࣼᔀႿዹᔀᖔ ऊ᧕୩ɯ 序列的碱基组成ܦ中性绘图ܦ
            和色氨酸外ᖔ其余 ϟऐ 种氨基酸均有 ԰ጲᤃ 个密码                         ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 及 ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 等方法推断影响降香黄檀叶绿
            子ᖔ这些编码同一氨基酸的不同密码子被称为同                              体密码子偏好性的主要因素ᖔ确定降香黄檀叶绿体

            义密码子ྉ ༁ᢃႿᆍႿᢃቝᆍࣼ༁ ዹᆍʛᆍႿɯ ྉ ᧕ࣼʢᔀᡷᖔ ԰ԡԡ԰ɯᤥ 在          基因组的最优密码子ᤥ 本研究通过对降香黄檀叶
            翻译过程中ᖔ每个氨基酸相对应同义密码子的使                              绿体基因组密码子使用模式和影响密码子使用偏
            用频率存在差异ᖔ即有的同义密码子使用频率高                              性的因素进行分析ᖔ确定降香黄檀叶绿体基因组的
            于其他同义密码子ᖔ这种现象被称为密码子偏好                              密码子偏好性及最优密码子ᖔ以期为降香黄檀叶绿
            性ྉዹᆍʛᆍႿ ࣼ༁ᑕ੫ᔀ ᤦᔽᑕ༁ɯྉ኏ᆍቝᔀʢᆍ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡԡɯᤥ 密码       体基因组的应用和研究提供科学的参考依据ᤥ
            子偏好性广泛存在于不同生物中ᖔ是物种在长期
            进化过程中受环境选择ܦ碱基突变ܦ基因漂变等因                             ϟজ 材料与方法
            素共同作用ᖔ还受到基因组大小ܦᡷ኏શዶ 丰度和基

            因表达水平等的影响ྉ኏ᆍቝᔀʢᆍ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡԡԡଫ ᧕ࣼʢᔀᡷᖔ              ϓॹϓ 材料
            ԰ԡԡԡଫ ᣮࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟϟɯᤥ 密码子偏好性通过对基                     降香黄檀叶片采自云南省林业科学院热带林
            因翻译准确性和效率的调节影响基因的表达水平                              业研究所ᤥ 将采集的新鲜叶片样品保存在干冰环
            ྉ邢朝斌等ᖔ ԰ԡϟሕɯᖔ叶绿体具有基因组小ܦ基因拷                         境中送至生工生物工程ྉ上海ɯ 股份有限公司进行
            贝数多等特点ྉ ۼʢᔽ੫ၤᡷᖔ ϟँँԡଫ 牛元等ᖔ ԰ԡϟऐɯଫ根                 叶绿体基因组的测序ᖔ并将结果提交至 શऊା᧧ྉ 登
            据最优密码子设计叶绿体基因表达载体ᖔ可迅速                              录号᧥᣽ऊ࿗԰Ꭾ԰Ꭾ࿗ɯᖔ通过 ᥈ᔀႿାᑕႿҴ èᔀᑕᡷࣼʢᔀ ጶ଴ᡷʢᑕዹᡷᆍʢ
            提高叶绿体基因组中基因表达量ᖔ利用目前已知                              ྉ ၤᡷᡷᡱ᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ ᤦᔽᆍᔽႿ஦ᆍʢቝᑕᡷᔽዹ༁঎ ᆍʢ੫ ᣰ ༁ቝ༁԰ ᣰ ੫ᔀႿᤦᑕႿҴ ᡸ
            的密码子使用模式推断未知基因的表达ᖔ或预测                              ஦ᔀᑕᡷ঎ ၤᡷቝ᤟ ɯܦ ᨃ኏è èᔽႿʛᔀʢ ྉ ၤᡷᡷᡱ༁᧥ ᣰ ᣰ औऔऔ঎ Ⴟዹᤦᔽ঎ Ⴟ᤟ቝ঎

            某些未知基因的功能ྉ ۼࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟ᖔ ԰ԡԡᎮɯଫ同时亲缘                    Ⴟᔽၤ঎੫ᆍ׹ ᣰ ᆍʢ஦஦ᔽႿʛᔀʢ ᣰ ɯܦ᧕શዶ ቝᑕႿ 等软件分析降 香 黄
            关系较近的物种具相近的密码子使用模式ྉ 杨国                             檀叶绿体基因组ᖔ根据各基因的注释结果获得 ऐሕ
            锋等ᖔ ԰ԡϟጢɯᤥ 因此研究叶绿体基因组密码子的                          条 ऊ᧕୩ 序列ᖔ剔除序列长度小于 ሕԡԡ ᤦᡱܦ重复基因
            使用模式对探讨物种进化ܦ提高外源基因表达量                              和 ऊ᧕୩ 内部存在终止密码子的序列后得到 ጢ԰ 条
            等具有重要意义ᤥ                                           符合条件的 ऊ᧕୩ 用于分析ᤥ
                 降香 黄 檀 ྉ ᦵᐹᤀᤇᓣʗ੖ᔠᐹ ᅳʐᅳʗᔠஏᓣʗᐹɯ 是蝶形花科           ϓॹԣ 方法
            ྉ۪ᑕᡱᔽ᤟ᔽᆍႿᑕዹᔀᑕᔀɯ 黄檀属 ྉ ᦵᐹᤀᤇᓣʗ੖ᔠᐹɯ 常绿半落叶乔            ϟ঎԰঎ϟ 密码子组成分析জ 将 ጢ԰ 条符合条件的 ऊ᧕୩

            木ᖔ其心材具极高的经济和药用价值ྉ 梁远楠等ᖔ                            整合到一个঎஦ᑕ༁ᡷᑕ 文件中ᖔ应用 ऊᆍʛᆍႿ ۼ ϟ঎࿗঎԰ 软件
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