Page 146 - 《广西植物》2021年第4期

ᤃ ԰ ऐ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷

图 ሕজ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 绘图分析

èᔽ੫঎ ሕজ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ

图 ϟজ 中性绘图分析 与蒺 藜 苜 蓿 ྉ ᤹ᓣʐᔠዞᐹ੖ᅳ ᡙʗࣩႥዞᐹᡙࣩᤀᐹɯྉ 杨国锋等ᖔ
èᔽ੫঎ ϟজ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ Ⴟᔀࣼᡷʢᑕ᤟ᔽᡷᢃ ᡱ᤟ᆍᡷ ԰ԡϟጢɯܦ紫花苜蓿ྉ ᤹ॹ ໧ᐹᡙᔠצᐹɯྉ 陶晓丽ᖔ԰ԡϟᎮɯ 的密
码子 ሕ 个位置的 ᥈ऊ 含量进行比较ᖔ即紫花苜蓿
᥈ऊϟྉ࿗ጢ঎԰࿗ᠮɯ ᢦ᥈ऊ԰ྉሕᎮ঎ሕԡᠮɯ ᢦ᥈ऊሕྉ԰ऐ঎ँᎮᠮɯᖔ蒺
藜苜蓿 ᥈ऊϟྉ࿗ጢ঎ጢᠮɯᢦ᥈ऊ԰ྉሕᤃ঎ऐᠮɯ ᢦ᥈ऊሕྉ԰ᤃ঎ँᠮɯᖔ
ሕ 个物种叶绿体基因组在密码子 ሕ 个位置上的 ᥈ऊ
含量趋势一致ᖔ但具体数据存在一定的差异ᤥ 中
性绘图分析显示ᖔ密码子第 ϟ 位和第 ԰ 位与第 ሕ 位
碱基组成存在显著差异ᖔ通过其 ᥈ऊ 含量高度保
守ᖔ其密码子偏好性主要受选择影响ᖔ与蒺藜苜蓿

一致 ྉ 杨国锋等ᖔ ԰ԡϟጢɯଫ 同时结合 ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 和
۪኏԰᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 等分析方式发现降香黄檀叶绿体基因组
密码子的偏好性受多种因素综合影响ᖔ主要影响
因素为选择ᖔ这个结论与其同科植物蒺藜苜蓿ྉ 杨
国锋等ᖔ ԰ԡϟጢɯ 一致ᤥ 降香黄檀叶绿体基因组密

图 ԰জ ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ 绘图分析 码子偏好以 ዶఋ 结尾ᖔ且其最优密码子 为 ВВВܦ
èᔽ੫঎ ԰জ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ጶશऊ᥋ᡱ᤟ᆍᡷ ВВዶᖔ与大多数高等植物的最优密码子 શશዶܦશશВ
的模式一致ྉ 尚明照等ᖔ ԰ԡϟϟɯᤥ 这种密码子使用

表 ྽ই ጛટࣷ 比值频数分布 模式可能由于叶绿体基因组中含有丰富的 ዶܦఋ 碱
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ࿗জ ᧕ᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ጶશऊ ʢᑕᡷᔽᆍ ஦ʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ 基ᖔ且其密码子使用模式存在显著差异ᖔ而在进化
和亲缘关系较近的植物通常具相似的密码子使用
组中值 频数
组段 频率
ऊ᤟ᑕ༁༁ ቝᔽʛʛ᤟ᔀ èʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ 模式ᖔ叶绿体基因组密码子的偏好性在进化关系
ऊ᤟ᑕ༁༁ ʢᑕႿ੫ᔀ èʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ
׹ᑕ᤟ࣼᔀ Ⴟࣼቝᤦᔀʢ
上较为保守ᤥ 本研究中降香黄檀叶绿体基因组密
ͱԡ঎ϟጢጲ ͱԡ঎ԡጢ ͱԡ঎ϟԡ ጢ ԡ঎ϟԡ
码子偏好性主要受突变的影响ᖔ同时与其他因素
ͱԡ঎ԡጢጲ ԡ঎ԡጢ ԡ ϟ࿗ ԡ঎԰Ꭾ
一起共同作用于其密码子使用模式ᖔ确定了 ϟँ 个
ԡ঎ԡጢጲ ԡ঎ϟጢ ԡ঎ϟԡ ԰ጢ ԡ঎࿗ऐ
最优密码子ᖔ且均为 શશዶ 和 શશВ 模式ᤥ 降香黄檀
ԡ঎ϟጢጲ ԡ঎԰ጢ ԡ঎԰ԡ ᤃ ԡ঎ϟ԰
ԡ঎԰ጢጲ ԡ঎ሕጢ ԡ঎ሕԡ ԰ ԡ঎ԡ࿗ 的分布区较为零散ᖔ仅分布于海南全岛ᖔ及广东ܦ
广西和福建的少数地区 ྉ张丽佳等ᖔ ԰ԡϟँɯᖔ 但降
合计 ఋᆍᡷᑕ᤟ ጢ԰ ϟ