Page 154 - 《广西植物》2023年第1期
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究拟对广西钦州市夹竹桃中的内生真菌进行分离 1.5 ITS rDNA 序列分析
鉴定和抗菌活性筛选ꎬ以确定夹竹桃内生真菌多样 提取内生真菌的 DNA 后ꎬ用真菌鉴定通用引物
性究竟如何ꎬ有哪些内生真菌类型及其在不同组织 ITS1 ( 5′ ̄TCCGTAGGTGAACCTGCGG ̄3′) 和 ITS4
的分布情况ꎬ以期能够获得一些具有抗水产病原弧 (5′ ̄TCCTCCGCTTATTGATATGC ̄3′) 扩 增 真 菌 ITS
菌活性的菌株ꎬ为进一步开发新型的抗菌剂奠定 rDNA 序列ꎮ PCR 反应体系:ddH O 20 μLꎬ2 ×Taq
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基础ꎮ PCR MasterMix 25 μL (北京索莱宝生物科技有限公
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司)ꎬ10 μmolL 的引物各 2 μLꎬ10 ngμL 模板 1
1 材料与方法 μLꎮ 反应程序:94 ℃预变性 4 minꎬ94 ℃ 变性 30 sꎬ
57 ℃退火 30 sꎬ72 ℃ 延伸 30 sꎬ30 个循环ꎬ72 ℃ 延
1.1 样品采集和预处理 伸 10 minꎮ 引物合成和测序都由北京六合华大基因
夹竹桃样品采集于广西钦州市钦北区ꎬ经钦 科技有限公司完成ꎮ 将获得的序列用 BLAST 程序
州市中医院中药研究所朱开昕高级工程师鉴定为 在 GenBank 数据库中进行同源性检索ꎬ比对得出与
夹竹桃属夹竹桃( Nerium oleander)ꎮ 选取健康夹 其相似性最高的核酸序列ꎮ 通过 MEGA7.0 软件使
竹桃的新鲜茎段和叶组织块ꎬ用自来水冲洗表面 用邻接法构建系统发育树ꎮ
的泥土和灰尘ꎬ在无菌操作台中进行表面消毒:先 1.6 内生真菌次生代谢产物的提取和抑菌活性的测定
将样品浸泡在 75%酒精中 3 ~ 5 minꎬ再转入 3% ~ 接种分离真菌于 100 mL 液体 PDA 培养基ꎬ于
5%的次氯酸钠溶液中浸泡 30 sꎬ然后再用无菌水 26~28 ℃在 200 rmin 转速下培养 10 ~ 20 d 至菌
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冲洗干净ꎮ 在超净操作台中放到干燥灭菌的培养 丝体长满三角瓶ꎻ8 000 rmin 离心收集菌丝体ꎬ20
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皿中晾干ꎬ备用ꎮ ℃下吹干水分ꎻ称取 0.3 g 干燥后的菌体加入 5 mL
1.2 内生真菌分离和纯化 提取液(乙酸乙酯 ∶ 甲醇 ∶ 乙酸 = 80 ∶ 15 ∶ 5)浸泡ꎬ
将上述处理过的茎段和叶片组织用无菌剪刀 然后将提取液静置挥发ꎬ加入 500 μL 乙酸乙酯溶解
剪成 5 mm× 5 mm 小块后ꎬ贴于 PDA 培养基平板 提取物ꎮ 抑菌活性指示菌蜡样芽孢杆菌( Bacillus
上ꎻ置于 28 ℃ 恒温培养箱倒置培养 2 ~ 4 dꎬ并定期 cereus)、金黄色葡萄球菌 ( Staphylococcus aureus) 、
观察真菌的生长情况ꎻ得到生长状况良好的菌株ꎻ 魔鬼弧菌(Vibrio diabolicus) 由本实验室购买保藏ꎻ
待组织边缘发现有菌丝长出时ꎬ在无菌环境下挑 溶藻弧菌(V. alginolyticus)、坎氏弧菌(V. campbellii)
取菌丝尖端转接到纯化培养基平板上ꎻ经多次分 分离自患病的鱼虾ꎮ 分别接种到 LB 液体培养基
离纯化后再接种于 PDA 斜面作为保种ꎬ保存在 中ꎬ30~35 ℃ 摇床上以 200 rmin 的转速培养过
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4 ~ 8 ℃ 冰箱备用ꎮ 夜ꎮ 将上述菌液 200 μL 采用混菌法接种于培养皿
1.3 形态学鉴定 中ꎬ采用滤纸片法测定抑菌活性ꎬ观察抑菌圈的有
将分离菌株接种于 PDA 培养基平板中ꎬ放置于 无及大小ꎬ 测量并记录抑菌圈直径 ( Gong et al.ꎬ
28 ℃ 培养箱中培养ꎮ 在各菌株生长的最佳时期ꎬ对 2018)ꎮ 该实验使用滤纸片蘸取乙酸乙酯作为空白
照«真菌鉴定手册»(魏景超ꎬ 1979)ꎬ观察菌落形态 对照ꎬ阳性对照为滤纸片蘸取 50 μgmL 的卡那霉
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(菌落颜色、大小、性状及边缘等)、生长情况、菌丝 素和氯霉素ꎮ
体、孢子的形态特征和表面特征ꎬ拍照记录ꎮ
1.4 DNA 提取 2 结果与分析
菌丝体用液氮研磨至匀浆状ꎬ再加入 600 μL
的 CTAB 提 取 液ꎬ65 ℃ 水 浴 45 minꎬ12 000 r 2.1 内生真菌的形态学鉴定
min 离心 5 minꎬ取上清液ꎻ加入苯酚 ∶ 氯仿 ∶ 异 如图 1 所示ꎬ根据菌株的菌落、菌丝体和孢子
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戊醇混合液( 25 ∶ 24 ∶ 1)ꎬ混匀后 4 ℃ 条 件 下ꎬ 的形态特征ꎬ对照«真菌签定手册» 进行初步鉴定ꎬ
 ̄1 分属于 7 个属ꎮ 其中ꎬ叶部组织获得 12 株菌ꎬ占
10 000 rmin 离心 5 minꎻ取上清液ꎬ加入-20 ℃
预冷的异戊醇静置数分钟ꎻ室温 12 000 rmin 离 63.16%ꎬ分属于炭疽菌属( Colletotrichum spp.)、球
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心 5 minꎬ去上清液ꎻ取沉淀ꎬ用 75%乙醇洗沉淀ꎬ 座菌 属 ( Guignardia spp.)、 叶 点 霉 属 ( Phyllosticta
加 50 μL 无菌水ꎬ-20 ℃ 保存备用ꎮ spp.)、 新壳梭孢属 ( Neofusicoccum sp.) 和曲霉属