Page 49 - 《广西植物》2024年第10期
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10 期      王雅楠等: 喀斯特石山老龄林檵木根际和非根际土壤微生物群落及酶活性的旱、雨季节变化                                       1 8 5 1

            Greifenseeꎬ Switzerland)测量ꎬ水土比为 2.5 ∶ 1(m/         图分析等ꎬ用 QIIME 软件ꎬ对样本 Alpha 多样性指
            V)ꎻ土壤全碳(total carbonꎬTC)、全氮(total nitrogenꎬ        数( SOBS、 ACE、 Chao、 Shannon、 Shannoneven、 Pd)
            TN)含量用过 100 目筛的风干土用元素分析仪直接                         和 Beta 多样性( PCoA) 分析ꎬ用 Cannoco 5.0 软件
            测定ꎻ土壤有机质(soil organic matterꎬSOM) 含量用              进行 RDA 分 析ꎬ 用 FUNGuild ( v1. 0)、 PICRUSt2

            重铬酸钾稀释热法测定ꎻ土壤全磷(total phosphorusꎬ                  (v2.2.0 ̄b)分别进行真菌、细菌群落的功能预测
            TP)含量采用 HClO -H SO 熔融———钼锑抗比色法                     分析ꎮ
                              4  2   4
            测定ꎻ土壤全钾( total potassiumꎬTK) 含量用 NaOH
            熔融———火焰光度计法测定ꎮ                                     3  结果与分析
            2.3.2 土壤酶活性测定( Li et al.ꎬ 2016)   土壤蔗
            糖酶( sucraseꎬSUC)、纤维素酶( cellulaseꎬCEL) 活            3.1 土壤含水量及理化性质的旱、雨季节动态
            性用 3ꎬ5-二硝基水杨酸比色法测定ꎻ碱性磷酸酶                               由图 2 可知ꎬ根际和非根际的 SWC 雨季显著
            (alkaline phosphataseꎬALP) 活性用磷酸苯二钠比               高于旱季( P<0.05)ꎬ旱季时期 SWC 约占雨季的
            色法测定ꎻ脲酶( ureaseꎬURE) 活性用苯酚钠—次                      50%ꎻ无论旱季还是雨季ꎬSWC 含量均表现为非根
            氯酸钠比色法测定ꎻ过氧化氢酶( catalaseꎬCAT) 活                    际土高于根际土ꎮ
            性用胞外酶的方法测定ꎮ                                            檵木群 落 根 际 和 非 根 际 土 壤 pH、 SOM、 TC、
            2.3.3 土壤微生物群落组成和多样性分析  微生                          TN、TP 和 TK 含量对旱、雨季节变化表现出显著性
            物多样性云分析采用高通量测序技术和当前主流                              差异( P<0.05ꎬ图 3)ꎮ 雨季根际土偏弱酸性ꎬpH
            的扩 增 子 测 序 数 据 降 噪 方 法 DADA2 / Deblurꎬ 对           约 6.78ꎻ旱季根际土偏弱碱性ꎬpH 约 7.15ꎬ而非根
            16S / 18S / ITS / 功能基因等特定区段的高通量测序                  际土都偏弱碱性ꎬ无季节性差异(P>0.05)ꎮ 雨季ꎬ
            序列进行错误校正ꎬ获得每个样本的 ASV 代表序                           土壤 TC、TN、TK、TP、SOM 的含量均表现为非根际
            列及丰度表ꎬ基于序列降噪结果进行微生物多样                              土高于根际土ꎬ旱季则反之ꎮ 根际和非根际 SOM
            性分析ꎮ 完成基因组 DNA 抽提后用 1%琼脂糖凝                         均为雨季高于旱季ꎬ而土壤 TP 含量为旱季高于雨
            胶检测 DNA 完整性ꎬ用 NanoDrop2000 检测 DNA                  季ꎻ非根际土壤 TC、TN、TK 含量雨季高于旱季ꎬ而
            的纯度和浓度ꎮ 细菌 16S rRNA 基因 V3+V4 区引                    根际土壤则相反ꎮ
            物为 338F ( 5′ ̄ACTCCTACGGGAGGCAGCA ̄3) 和              3.2 土壤微生物及酶活性的旱、雨季节动态
            806R ( 5′ ̄GGACTACHVGGGTWTCTAAT ̄3′)ꎬ 真 菌            3.2.1 土壤酶活性分析  由图 4 可知ꎬ无论旱季还
            18S rRNA 基 因 ITS1 区 引 物 为 ITS1F ( 5′ ̄              是雨季ꎬ土壤 SUC、CEL 活性为根际土高于非根际
            CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA ̄3′) 和 ITS2 ( 5′ ̄            土ꎬ而土壤 ALP、CAT 活性则相反ꎻ雨季ꎬ土壤 URE
            GCTGCGTTCTTCATCGATGC ̄3′)ꎮ 在引物末端加上                  活性为根际土低于非根际土ꎬ旱季则反之ꎮ 旱、雨
            测序接头进行 PCR 扩增ꎬ并对其产物进行纯化、定                          季节变 化 对 土 壤 酶 活 性 的 影 响 相 对 显 著 ( P <
            量和均一化构建 PE 文库ꎬ将建好的文库先进行文                           0.05)ꎮ 根 际 土 壤 SUC、CEL 活 性 为 雨 季 高 于 旱
            库质检ꎬ质检合格的文库用 Illumina(上海美吉生物                       季ꎬ而 URE、ALP 活性则相反ꎻ非根际土壤 SUC、

            医药科技有限公司)进行测序ꎮ                                     CEL、URE 和 ALP 活性都为雨季高于旱季ꎬ而根际
            2.4 数据处理                                           和非根际土壤 CAT 活性为旱季高于雨季ꎮ
                 土壤理化性质及酶活性用 Excel 2022 软件进行                   3.2.2 土壤微生物多样性分析  由表 1 可知ꎬ无论旱
            数据整理ꎬ其差异显著性和相关性用 SPSS 23.0 软                       季还是雨季ꎬ真菌和细菌多样性变化均表现为根际

            件进行分析ꎮ 土壤微生物群落组成和多样性分析ꎬ                            土显著高于非根际土(P<0.05)ꎮ 此外ꎬ根际和非根
            先根据测序质量对双端 Reads 进行质控和过滤ꎬ再                         际土壤真菌多样性变化均表现为旱季显著高于雨
            根据双端 Reads 之间的 overlap 关系进行拼接ꎬ获得                   季ꎻ非根际土壤细菌多样性变化表现为雨季显著高
            质控 拼 接 后 的 优 化 数 据ꎮ 使 用 序 列 降 噪 方 法                于旱季ꎬ而根际土壤细菌多样性旱、雨季节变化不
            (DADA2 / Deblur ) 等 处 理 优 化 数 据ꎬ 获 得 ASV           明显(P>0.05)ꎬ说明根际土壤细菌群落更稳定、更
            (amplicon sequence variant) 代表序列和丰度信息ꎮ             复杂ꎬ从而导致较低的微生物代谢活动ꎮ
            用 R 语言(V4.1.3)进行群落组成分析及相关性热                            本研 究 基 于 BrayCurtis 距 离 的 主 坐 标 分 析
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