Page 49 - 《广西植物》2024年第10期
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10 期 王雅楠等: 喀斯特石山老龄林檵木根际和非根际土壤微生物群落及酶活性的旱、雨季节变化 1 8 5 1
Greifenseeꎬ Switzerland)测量ꎬ水土比为 2.5 ∶ 1(m/ 图分析等ꎬ用 QIIME 软件ꎬ对样本 Alpha 多样性指
V)ꎻ土壤全碳(total carbonꎬTC)、全氮(total nitrogenꎬ 数( SOBS、 ACE、 Chao、 Shannon、 Shannoneven、 Pd)
TN)含量用过 100 目筛的风干土用元素分析仪直接 和 Beta 多样性( PCoA) 分析ꎬ用 Cannoco 5.0 软件
测定ꎻ土壤有机质(soil organic matterꎬSOM) 含量用 进行 RDA 分 析ꎬ 用 FUNGuild ( v1. 0)、 PICRUSt2
重铬酸钾稀释热法测定ꎻ土壤全磷(total phosphorusꎬ (v2.2.0 ̄b)分别进行真菌、细菌群落的功能预测
TP)含量采用 HClO -H SO 熔融———钼锑抗比色法 分析ꎮ
4 2 4
测定ꎻ土壤全钾( total potassiumꎬTK) 含量用 NaOH
熔融———火焰光度计法测定ꎮ 3 结果与分析
2.3.2 土壤酶活性测定( Li et al.ꎬ 2016) 土壤蔗
糖酶( sucraseꎬSUC)、纤维素酶( cellulaseꎬCEL) 活 3.1 土壤含水量及理化性质的旱、雨季节动态
性用 3ꎬ5-二硝基水杨酸比色法测定ꎻ碱性磷酸酶 由图 2 可知ꎬ根际和非根际的 SWC 雨季显著
(alkaline phosphataseꎬALP) 活性用磷酸苯二钠比 高于旱季( P<0.05)ꎬ旱季时期 SWC 约占雨季的
色法测定ꎻ脲酶( ureaseꎬURE) 活性用苯酚钠—次 50%ꎻ无论旱季还是雨季ꎬSWC 含量均表现为非根
氯酸钠比色法测定ꎻ过氧化氢酶( catalaseꎬCAT) 活 际土高于根际土ꎮ
性用胞外酶的方法测定ꎮ 檵木群 落 根 际 和 非 根 际 土 壤 pH、 SOM、 TC、
2.3.3 土壤微生物群落组成和多样性分析 微生 TN、TP 和 TK 含量对旱、雨季节变化表现出显著性
物多样性云分析采用高通量测序技术和当前主流 差异( P<0.05ꎬ图 3)ꎮ 雨季根际土偏弱酸性ꎬpH
的扩 增 子 测 序 数 据 降 噪 方 法 DADA2 / Deblurꎬ 对 约 6.78ꎻ旱季根际土偏弱碱性ꎬpH 约 7.15ꎬ而非根
16S / 18S / ITS / 功能基因等特定区段的高通量测序 际土都偏弱碱性ꎬ无季节性差异(P>0.05)ꎮ 雨季ꎬ
序列进行错误校正ꎬ获得每个样本的 ASV 代表序 土壤 TC、TN、TK、TP、SOM 的含量均表现为非根际
列及丰度表ꎬ基于序列降噪结果进行微生物多样 土高于根际土ꎬ旱季则反之ꎮ 根际和非根际 SOM
性分析ꎮ 完成基因组 DNA 抽提后用 1%琼脂糖凝 均为雨季高于旱季ꎬ而土壤 TP 含量为旱季高于雨
胶检测 DNA 完整性ꎬ用 NanoDrop2000 检测 DNA 季ꎻ非根际土壤 TC、TN、TK 含量雨季高于旱季ꎬ而
的纯度和浓度ꎮ 细菌 16S rRNA 基因 V3+V4 区引 根际土壤则相反ꎮ
物为 338F ( 5′ ̄ACTCCTACGGGAGGCAGCA ̄3) 和 3.2 土壤微生物及酶活性的旱、雨季节动态
806R ( 5′ ̄GGACTACHVGGGTWTCTAAT ̄3′)ꎬ 真 菌 3.2.1 土壤酶活性分析 由图 4 可知ꎬ无论旱季还
18S rRNA 基 因 ITS1 区 引 物 为 ITS1F ( 5′ ̄ 是雨季ꎬ土壤 SUC、CEL 活性为根际土高于非根际
CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA ̄3′) 和 ITS2 ( 5′ ̄ 土ꎬ而土壤 ALP、CAT 活性则相反ꎻ雨季ꎬ土壤 URE
GCTGCGTTCTTCATCGATGC ̄3′)ꎮ 在引物末端加上 活性为根际土低于非根际土ꎬ旱季则反之ꎮ 旱、雨
测序接头进行 PCR 扩增ꎬ并对其产物进行纯化、定 季节变 化 对 土 壤 酶 活 性 的 影 响 相 对 显 著 ( P <
量和均一化构建 PE 文库ꎬ将建好的文库先进行文 0.05)ꎮ 根 际 土 壤 SUC、CEL 活 性 为 雨 季 高 于 旱
库质检ꎬ质检合格的文库用 Illumina(上海美吉生物 季ꎬ而 URE、ALP 活性则相反ꎻ非根际土壤 SUC、
医药科技有限公司)进行测序ꎮ CEL、URE 和 ALP 活性都为雨季高于旱季ꎬ而根际
2.4 数据处理 和非根际土壤 CAT 活性为旱季高于雨季ꎮ
土壤理化性质及酶活性用 Excel 2022 软件进行 3.2.2 土壤微生物多样性分析 由表 1 可知ꎬ无论旱
数据整理ꎬ其差异显著性和相关性用 SPSS 23.0 软 季还是雨季ꎬ真菌和细菌多样性变化均表现为根际
件进行分析ꎮ 土壤微生物群落组成和多样性分析ꎬ 土显著高于非根际土(P<0.05)ꎮ 此外ꎬ根际和非根
先根据测序质量对双端 Reads 进行质控和过滤ꎬ再 际土壤真菌多样性变化均表现为旱季显著高于雨
根据双端 Reads 之间的 overlap 关系进行拼接ꎬ获得 季ꎻ非根际土壤细菌多样性变化表现为雨季显著高
质控 拼 接 后 的 优 化 数 据ꎮ 使 用 序 列 降 噪 方 法 于旱季ꎬ而根际土壤细菌多样性旱、雨季节变化不
(DADA2 / Deblur ) 等 处 理 优 化 数 据ꎬ 获 得 ASV 明显(P>0.05)ꎬ说明根际土壤细菌群落更稳定、更
(amplicon sequence variant) 代表序列和丰度信息ꎮ 复杂ꎬ从而导致较低的微生物代谢活动ꎮ
用 R 语言(V4.1.3)进行群落组成分析及相关性热 本研 究 基 于 BrayCurtis 距 离 的 主 坐 标 分 析