Page 47 - 《广西植物》2024年第2期
P. 47

2 期      张世鑫等: 橡胶树形成层组织的酵母双杂交 cDNA 文库构建及 HbHDA6 互作蛋白筛选                                      2 4 9

            平板(含链霉素抗性)上随机挑取 4 个大肠杆菌转                           凝胶电泳进行 PCR 扩增产物的检测ꎬ对扩增得到
            化子接种于 LB 液体培养基ꎬ37 ℃ 、220 rmin 条                  阳性条带的克隆ꎬ进行质粒抽提( Axygen 质粒小量
                                                        ̄1
            件下振荡培养 16 h 后ꎬ用 pGBKT7 载体的通用引                      抽提试剂盒) 和测序ꎮ 插入片段测序结果在比对
            物 pGBKT7 ̄F ( 5′ ̄TAATACGACTCACTATAGGGC ̄             确认正确后ꎬ进行后续实验ꎮ 按照表 1 构建不同
            3′)和 pGBKT7 ̄R(5′ ̄TAAGAGTCACTTTAAAATTT              质粒和涂布不同类型的平板ꎬ将各种质粒转入酵
            GTAT ̄3′)ꎬ进行 PCR 扩增验证ꎬ并使用 1%琼脂糖                     母受体菌株 AH109 中ꎬ观察并检测结果ꎮ


                                           表 1  构建酵母双杂交文库所需的载体
                                     Table 1  Vectors for constructing yeast two ̄hybrid library

                反应           AD 载体            BD 载体            涂板种类                       备注
               Reaction      AD vector        BD vector      Coated plate type            Note
                  1        pGADT7 ̄largeT     pGBKT7 ̄p53       SD ̄Trp ̄Leu           阳性对照 Positive control
                  2        pGADT7 ̄largeT    pGBKT7 ̄laminC     SD ̄Trp ̄Leu           阴性对照 Negative control
                  3          pGADT7        pGBKT7 ̄HbHDA6      SD ̄Trp ̄Leu        自激活检测 Self ̄activation detection
                  4            —           pGBKT7 ̄HbHDA6        SD ̄Trp          筛库备用 Library screening backup



                从 pGADT7 +pGBKT7 ̄HbHDA6 共转化 AH109              体系ꎮ 在 30 ℃ 条 件 下 水 浴 孵 育 30 min 后ꎬ 在
            长出的酵母转化子中ꎬ随机挑取了 6 个菌落ꎬ进行自                          42 ℃ 条件下水浴热激 25 minꎬ在 30 ℃ 条件下水浴
            激活检测ꎬ包括对 HIS3、ADE2 和 MEL1 共 3 个报告                  复苏 1 hꎬ将复苏后的菌液离心并重悬菌体ꎮ 从重
            基因的检测ꎮ 对 HIS3、ADE2 和 MEL1 报告基因的                    悬菌液中取 20 μL 酵母培养物经梯度稀释后ꎬ分
            检测采用点板培养的方法ꎮ 将转化子点板于 SD ̄                           别涂在 3 块 SD ̄TL 平板上ꎬ用于酵母文库的转化
            TL+X ̄α ̄Gal 和 SD ̄TLHA 平板ꎬ30 ℃ 恒温培养 4 dꎬ             效率检测ꎮ 剩余的酵母培养物涂在 SD ̄TLH + 5
            观察其生长状态ꎮ 在预先配制好的 SD ̄TLHA 板上                        mmolL 3AT 平板上ꎬ每块平板涂 200 μLꎬ共涂
                                                                        ̄1
            各涂布 200 μL X ̄α ̄Gal 溶液ꎬ待 X ̄α ̄Gal 溶液被平               40 块平板ꎮ 在 30 ℃ 条件下恒温倒置培养 3 ~ 4 dꎬ
            板培养基完全吸收后ꎬ将转化子菌液进行点板并                              观察并记录转化结果ꎬ分析转化效率ꎮ
            培养ꎮ                                                1.7 阳性克隆鉴定和测序分析
            1.6 pGBKT7 ̄HbHDA6 诱饵质粒筛选酵母文库                           在 pGBKT7 ̄HbHDA6 诱饵质粒筛选酵母双杂
                 用含有测序正确 pGBKT7 ̄HbHDA6 诱饵质粒                    交文库的平板中ꎬ挑取阳性克隆的单菌落ꎬ转接到
            的 AH109 酵母转化子作为受体菌来制备酵母感受                          SD ̄TL 缺陷型培养基平板中ꎬ在 30 ℃ 条件下恒温
            态细胞ꎮ 将 COR 处理橡胶树形成层组织的 cDNA                        倒置培养 2 ~ 3 dꎮ 将在 SD ̄TL 缺陷型培养基平板
            初级文库质粒转入酵母感受态细胞中ꎬ并将其涂                              上长出的初始阳性克隆转化子分别用无菌水稀释
            在 SD ̄Trp ̄Leu ̄His+5 mmolL 3AT 平板上并倒置              后ꎬ接种到 SD ̄TL 和 SD ̄TLHA+X ̄α ̄Gal 缺陷平板
                                         ̄1
            培养ꎮ 从 SD ̄Trp 平 板 挑 取 单 克 隆 菌 斑ꎬ 接 种 在              上ꎬ进行 HIS3、ADE2 和 MEL1 报告基因的检测ꎬ在
            SD ̄Trp 液体培养基中ꎬ在 30 ℃ 、220 rmin 条件                30 ℃ 条件下恒温培养 3 ~ 4 dꎮ
                                                      ̄1
            下振荡培养 18 hꎬ再转接到 YPDA 培养基中培养ꎬ                           对 HIS3、ADE2 和 MEL1 报告基因进行检测ꎬ
            使用紫外分光光度计ꎬ测定菌液测定初始浓度为                              显示结果为阳性对照在 SD ̄TL 和 SD ̄TLHA+X ̄α ̄
                                           ̄1
            OD   = 0.2ꎻ在 30 ℃ 、220 rmin 条件下振荡培养              Gal 缺陷型培养基平板上都能正常生长ꎬ并且 SD ̄
               600
            4 ~ 5 hꎬ中途使用紫外分光光度计测定菌液的浓                          TLHA+X ̄α ̄Gal 缺陷型培养基平板上的菌落呈现
            度ꎬ当菌液浓度达到 OD            = 0.6 即停止培养ꎮ 将菌            蓝色ꎻ阴性对照由于不会激活 HIS3 和 ADE2 报告
                                  600
            液离心并弃上清ꎬ重悬菌体ꎮ 按照加入试剂的体                             基因ꎬ虽然在 SD ̄TL 缺陷型培养基平板上可以正
            积从大到小ꎬ依次加入 9.6 mL 的 50% PEG3350ꎬ                   常生长ꎬ但菌落不呈现蓝色ꎬ而在缺少 Histidine 和
                                ̄1
            1.44 mL 的 1 molL LiAcꎬ300 μL 的 ssDNA (10         Adenine 这两种成分的 SD ̄TLHA+X ̄α ̄Gal 缺陷型
            mgmL ) ꎬ以及 25 μg 的文库质粒 DNAꎬ并混匀                   培养基平板上不能生长ꎮ 因此ꎬ初始阳性克隆能
                     ̄1
   42   43   44   45   46   47   48   49   50   51   52