Page 194 - 《广西植物》2025年第11期
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2 1 3 8 广 西 植 物 45 卷
表 1 大叶梅属地衣标本采集信息及所分离的菌株
Table 1 Information on the collection of Parmotrema lichen specimens and the strains isolated
高通量测序编号
物种名称 标本信息 标本号 菌株编号
High ̄throughput
Name of species Information of specimens Voucher No. Strain No.
sequencing No.
粉芽网纹大叶梅 P. reticulatum 核心区ꎬ500 mꎬ树皮ꎬ2023-11-28ꎬ蒋树浩 FJ232421 4318 ̄1 / 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 B1
(以下标本中ꎬ采集地均为福建万木林
自然保护区ꎬ基物均为树皮ꎬ不再赘述)
大叶梅 P. tinctorum 核心区ꎬ500 mꎬ2023-11-28ꎬ蒋树浩 FJ232422 4319 ̄2/ 3 / 8 / 10 A2
大叶梅 P. tinctorum 核心区ꎬ500 mꎬ2023-11-28ꎬ蒋树浩 FJ232423 4320 ̄3 / 4 / 5 / 6 / 7 A3
大叶梅 P. tinctorum 275 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232493 4324 ̄1 / 2 / 3 / 4 / 5 A4
大叶梅 P. tinctorum 275 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232494 4325 ̄1/ 2 / 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 A5
大叶梅 P. tinctorum 285 mꎬ2023-11-30ꎬ蒋树浩 FJ232626 4335 ̄1/ 3 / 4 / 5 / 6 / 7 / 8 / 9 A6
大叶梅 P. tinctorum 285 mꎬ2023-11-30ꎬ蒋树浩 FJ232628 4337 ̄1 / 2 / 3 / 4 A7
大叶梅 P. tinctorum 兰缘谷ꎬ260 mꎬ2023-11-27ꎬ蒋树浩 FJ232087 4338 ̄1 A8
大叶梅 P. tinctorum 兰缘谷ꎬ260 mꎬ2023-11-27ꎬ蒋树浩 FJ232088 4339 ̄1 / 2 / 3 A9
大叶梅 P. tinctorum 兰缘谷ꎬ260 mꎬ2023-11-27ꎬ蒋树浩 FJ232089 4340 ̄9/ 10 A10
粉芽网纹大叶梅 P. reticulatum 305 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232560 4346 ̄2 / 5 B11
粉芽网纹大叶梅 P. reticulatum 305 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232566 4352 ̄1 / 3 B12
大叶梅 P. tinctorum 305 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232569 4355 ̄1 / 2 / 3 / 5 / 6 / 7 / 8 A13
大叶梅 P. tinctorum 305 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232572 4358 ̄2 / 3 / 4 A14
大叶梅 P. tinctorum 305 mꎬ2023-11-29ꎬ蒋树浩 FJ232574 4360 ̄1 / 2 / 3 / 5 A15
大叶梅 P. tinctorum 280 mꎬ2023-11-30ꎬ蒋树浩 FJ232629 4366 ̄1 / 5 / 6 / 7 / 8 A16
学分析ꎬ结合形态学特征共确定了 20 个种级分类 后共产生 1 135 848 条待处理 Readsꎬ每个样品至
单元ꎬ分属于 1 个门 2 个纲 6 个目 8 个科 12 个属 少产生 69 824 条待处理 Readsꎬ平均产生 70 991
(图 1、表 2)ꎮ 20 个种级分类单元全部隶属于子囊 条待处理 Reads(表 3)ꎮ
菌门( Ascomycota)ꎬ其中 19 个种级分类单元为粪 从 16 份样品中随机抽取一定数量的序列ꎬ统
壳菌纲(Sordariomycetes)(68 个菌株ꎬ97.14%)ꎬ另 计这些序列所代表的物种数目ꎬ并以序列数与物
外 1 个为座囊菌纲( Dothideomycetes) 中的拟内黑 种数来构建曲线ꎬ用于验证测序数据量是否足以
孢属(Endomelanconiopsis)ꎮ 在目级水平上ꎬ炭角菌 反映样品中的物种多样性ꎬ并间接反映样品中物
目(Xylariales) 占明显优势(63 个菌株ꎬ90.00%)ꎬ 种的丰富程度ꎮ 16 个样品的稀释曲线随测序数目
该目中菌株数量较多的为炭层菌属( Nemania) (25 增加逐渐趋于平缓( 图 2:A)ꎬ并且各样品测序覆
株ꎬ 35. 71%) 和 炭 角 菌 属 ( Xylaria ) ( 23 株ꎬ 盖度均在 99.9%以上(表 3)ꎬ表明测序数据量能较
32.86%)ꎮ 宿主之间的比较如下:3 份粉芽网纹大 全面反映测序样品的真菌群落组成ꎬ测序质量评
叶梅 共分离出 11 株菌株ꎬ优势菌属为炭层菌属(6 价各项指标均符合 ITS 测序要求ꎬ可以进行后续分
株ꎬ54.55%) 和炭角菌属(3 株ꎬ27.27%)ꎻ13 份大 析和研究ꎮ
叶梅共分离出 59 株菌株ꎬ优势菌属同样为炭角菌 16 份样品的 Simpson 指数和 Shannon 指数较
属(20 株ꎬ33.90%) 和炭层菌属(19 株ꎬ32.20%)ꎬ 大且相近ꎬ说明样品中物种的丰富度较大和均匀
可见两个物种的内生真菌未表现出明显差别ꎮ 分 性较高ꎬ因此总的生物多样性较大ꎮ 样品 A4 的
离得到的内生真菌各属的数量如表 2 所示ꎮ Simpson 指数和 Shannon 指数 最 高ꎬA8 和 B11 较
2.2 高通量测序分析 低ꎮ 其余样 品 的 Shannon 指 数 集 中 在 5 ~ 7 之 间
2.2.1 α 多样性分析 本研究 16 个样品测序共获 (表 3)ꎮ 这说明 87.5%以上样品的真菌群落的种
得 1 279 802 对原始 Readsꎬ双端 Reads 质控、拼接 类多且分布均匀ꎮ

