Page 123 - 《广西植物》2025年第5期
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5 期 彭晓梅等: 垂穗披碱草 TCP 转录因子家族鉴定及激素响应模式分析 9 2 7
表 4 Clean data 质量统计 素合成通路存在负反馈调节ꎬ从而维持激素稳态ꎬ
Table 4 Statistics of Clean data quality 调控植株形态建成ꎮ
Reads 数量 GC 含量 本研究首次利用 SMRT 技术获得了垂穗披碱
样品 碱基数量 Q30
Number of GC 草的全长转录组数据ꎬ并对全长转录本进行功能
Sample Number of bases (%)
Reads content
注释ꎮ 基于全长转录组数据鉴定到 26 个 TCP 转
CK ̄1 21 591 401 6 461 740 072 55.48 93.36
录因子家族成员ꎬ并对其系统进化及保守基序进
CK ̄2 24 923 567 7 463 230 832 56.00 92.59
CK ̄3 26 817 251 8 030 051 808 55.63 92.56 行分析ꎬ同时对 4 种激素( IAA、6 ̄BA、ABA、JA) 处
IAA ̄1 ̄1 24 859 447 7 443 929 914 55.23 92.90
理后 EnTCPs 家族成员的表达模式进行分析ꎬ并用
IAA ̄1 ̄2 27 906 644 8 356 593 550 55.49 92.64
qRT ̄PCR 证实了转录组数据的可靠性ꎬ同时筛选
IAA ̄1 ̄3 25 003 084 7 486 658 114 55.13 92.95
与激素响应相关的 EnTCPs 基因ꎮ 这些结果将为
IAA ̄6 ̄1 27 737 807 8 305 417 660 55.80 92.74
后续 EnTCPs 基因功能研究奠定基础ꎬ同时为研究
IAA ̄6 ̄2 28 759 233 8 610 794 344 55.76 92.73
IAA ̄6 ̄3 26 959 975 8 072 710 152 55.62 92.46
EnTCPs 对激素响应的分子机制提供参考依据ꎮ
6 ̄BA ̄1 ̄1 27 134 581 8 125 162 572 55.12 92.99
6 ̄BA ̄1 ̄2 26 448 980 7 923 207 260 55.09 94.27
6 ̄BA ̄1 ̄3 28 425 181 8 514 761 930 54.48 94.60
参考文献:
6 ̄BA ̄6 ̄1 25 981 541 7 783 208 798 55.23 94.11
6 ̄BA ̄6 ̄2 23 907 478 7 161 953 166 55.08 94.09
AGGARWAL Pꎬ DAS GUPTA Mꎬ JOSEPH APꎬ et al.ꎬ
6 ̄BA ̄6 ̄3 25 166 257 7 539 534 454 55.50 93.88
2010. Identification of specific DNA binding residues in the
ABA ̄1 ̄1 26 633 239 7 976 245 194 55.42 92.42
TCP family of transcription factors in Arabidopsis [J]. Plant
ABA ̄1 ̄2 20 451 305 6 123 372 210 55.70 93.36
Cellꎬ 22(4): 1174-1189.
ABA ̄1 ̄3 23 857 960 7 144 896 962 55.63 92.48
BALLESTER Pꎬ NAVARRETEGÓMEZ Mꎬ CARBONERO Pꎬ
ABA ̄6 ̄1 20 763 945 6 218 258 426 55.58 92.24
et al.ꎬ 2015. Leaf expansion in Arabidopsis is controlled by a
ABA ̄6 ̄2 27 794 030 8 316 177 302 55.22 92.70
TCP ̄NGA regulatory module likely conserved in distantly
ABA ̄6 ̄3 26 660 036 7 987 027 752 55.13 94.09
related species [ J ]. Physiologia Plantarumꎬ 155(1):
JA ̄1 ̄1 27 263 233 8 164 288 718 55.55 91.88
21-32.
JA ̄1 ̄2 20 375 650 6 098 831 692 56.06 93.62
CUBAS Pꎬ LAUTER Nꎬ DOEBLEY Jꎬ et al.ꎬ 1999. The TCP
JA ̄1 ̄3 21 490 554 6 435 247 690 55.84 93.49
domain: a motif found in proteins regulating plant growth and
JA ̄6 ̄1 20 066 917 6 005 514 796 55.43 94.47
development [J]. The Plant Journalꎬ 18(2): 215-222.
JA ̄6 ̄2 20 014 216 5 989 140 730 54.95 92.69
CUI GWꎬ CHAI Hꎬ YIN Hꎬ et al.ꎬ 2019. Full ̄length
JA ̄6 ̄3 20 593 575 6 165 306 832 56.42 94.50
transcriptome sequencing reveals the low ̄temperature ̄
注: 设置 3 个生物学重复ꎮ IAA ̄1 ̄1 表示 IAA 处理 1 h 的第 1 tolerance mechanism of Medicago falcata roots [ J]. BMC
个重复ꎬ以此类推其他ꎮ
Plant Biologyꎬ 19: 575.
Note: Set up three biological replicates. IAA ̄1 ̄1 represents the
DANISMAN Sꎬ IMMINK RGHꎬ 2012. Arabidopsis ClassⅠand
first replicate of IAA treatment for 1 hꎬ and so on.
Class Ⅱ TCP transcription factors regulate jasmonic acid
metabolism and leaf development antagonistically [J]. Plant
分裂素信号转导过程ꎻEn14028 可能参与脱落酸响 Physiologyꎬ 159(4): 1511-1523.
应ꎬ系统进化分析表明其与 AtTCP14 亲缘较近ꎬ推 DANISMAN Sꎬ VAN DIJK ADꎬ BIMBO Aꎬ et al.ꎬ 2013.
Analysis of functional redundancies within the Arabidopsis
测 En14028 通过抑制脱落酸合成基因 ABA1 的转
TCP transcription factor family [J]. Journal of Experimental
录来阻碍 ABA 信号转导ꎻEn108950 可能参与茉莉 Botanyꎬ 64(18): 5673-5685.
酸响应ꎬ它与 AtTCP1 亲缘较近ꎬ而 AtTCP1 主要参 DING SCꎬ CAI ZZꎬ DU HWꎬ et al.ꎬ 2019. Genome ̄wide
与油菜素类固醇的合成ꎻEn16325 可能参与多种激 analysis of TCP family genes in Zea mays L. identified a role
for ZmTCP42 in drought tolerance [J]. International Journal
素 信 号 转 导 通 路ꎬ 它 与 AtTCP9、 AtTCP19 和
of Molecular Sciencesꎬ 20(11): 2762.
AtTCP11 亲缘关系较近ꎬ其中 AtTCP9 参与茉莉酸 DUAN Qꎬ LUO Qꎬ TANG Qꎬ et al.ꎬ 2023. Comprehensive
信号转导ꎬ而 AtTCP19 和 AtTCP11 参与激素调控 transcripts analysis based on single ̄molecule real ̄time
sequencing and Illumina sequencing provides insights into
通路的分子机制暂不清晰ꎮ 此外ꎬ本研究发现 7
the mining of Toll ̄like receptor family in Schizothorax
个 EnTCPs 家族成员表达量上调或下调并未呈现 lissolabiatus [ J ]. Fish & Shellfish Immunologyꎬ
出规律性变化ꎬ这可能是由于 TCP 转录因子与激 140(1): 108963.

