Page 118 - 《广西植物》2025年第5期
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图 2 CDS 编码的蛋白序列长度分布
Fig. 2 Length distribution of protein sequences encoded by CDS
表 2 全长转录本注释结果统计 ABA、JA)处理后 EnTCPs 的表达水平ꎬ结果( 图 6:
Table 2 Statistics of full ̄length transcript annotation results A) 显 示ꎬ Class Ⅱ EnTCPs 和 大 部 分 的 Class I
所注释数据库 转录本数量 占比 EnTCPs 家族成员在激素处理后表达水平较低ꎬ仅
Annotated database Number of transcripts Percentage (%)
有 4 个 Class I EnTCPs 家 族 成 员 ( En127132、
Nr 78 155 97.18
En128790、En10346 和 En14028) 表达量较高ꎮ 为
Swiss ̄Prot 51 689 64.27
了进一步分析 EnTCPs 的表达模式ꎬ我们统计了与
Pfam 54 044 67.20
对照组相比ꎬ4 种激素处理后的 DEGs 数量ꎬ结果
GO 62 355 77.50
(图 6:B)表明ꎬ与激素处理 1 h 相比ꎬ处理 6 h 后
KOG 39 964 49.69
上调 / 下调 DEGs 的数量均显著增加ꎮ 其中ꎬ7 个
COG 23 323 29.00
EnTCPs 家族成员( En108950、En35573、En10347、
eggNOG 64 538 80.25
En16325、En128790、En10346 和 En14028) 在激素
KEGG 50 902 63.29
处理后表达量发生变化( 图 6:C):IAA 处理 6 h
总计 Total 80 421 88.42
后ꎬEn35573 表达量上调ꎬ而 En16325 和 En14028
表达量下调ꎻ6 ̄BA 处理 1 h 后ꎬEn108950 表达量
转录组测序ꎬ原始数据经过质控后获得 Clean dataꎮ 下调ꎻ6 ̄BA 处理 6 h 后ꎬEn13407 表达量上调ꎬ而
质控结 果 ( 表 4) 显 示ꎬ 所 有 样 品 的 GC 含 量 为 En16325、En128790、En10346 和 En14028 表达 量
54.48% ~ 56.42%ꎬQ30≥91.88%ꎬ说明转录组测序 均下调ꎻABA 处理 6 h 后ꎬEn16325 和 En14028 表
数据质量较高ꎬ可用于后续分析ꎮ 达量下调ꎻJA 处理 6 h 后ꎬEn108950 表达量下调ꎮ
通过 FPKM 值来 评 估 不 同 激 素 ( IAA、6 ̄BA、 利 用 qRT ̄P CR 对 7 个 EnTCPs 家 族 成 员

