Page 118 - 《广西植物》2025年第5期
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                                            图 2  CDS 编码的蛋白序列长度分布
                                   Fig. 2  Length distribution of protein sequences encoded by CDS


                     表 2  全长转录本注释结果统计                          ABA、JA)处理后 EnTCPs 的表达水平ꎬ结果( 图 6:
            Table 2  Statistics of full ̄length transcript annotation results  A) 显 示ꎬ Class Ⅱ EnTCPs 和 大 部 分 的 Class I

                所注释数据库          转录本数量            占比            EnTCPs 家族成员在激素处理后表达水平较低ꎬ仅
               Annotated database  Number of transcripts  Percentage (%)
                                                               有 4 个 Class I EnTCPs 家 族 成 员 ( En127132、
                    Nr            78 155         97.18
                                                               En128790、En10346 和 En14028) 表达量较高ꎮ 为
                  Swiss ̄Prot      51 689         64.27
                                                               了进一步分析 EnTCPs 的表达模式ꎬ我们统计了与
                   Pfam           54 044         67.20
                                                               对照组相比ꎬ4 种激素处理后的 DEGs 数量ꎬ结果
                    GO            62 355         77.50
                                                               (图 6:B)表明ꎬ与激素处理 1 h 相比ꎬ处理 6 h 后
                   KOG            39 964         49.69
                                                               上调 / 下调 DEGs 的数量均显著增加ꎮ 其中ꎬ7 个
                   COG            23 323         29.00
                                                               EnTCPs 家族成员( En108950、En35573、En10347、
                  eggNOG          64 538         80.25
                                                               En16325、En128790、En10346 和 En14028) 在激素
                   KEGG           50 902         63.29
                                                               处理后表达量发生变化( 图 6:C):IAA 处理 6 h
                 总计 Total         80 421         88.42
                                                               后ꎬEn35573 表达量上调ꎬ而 En16325 和 En14028
                                                               表达量下调ꎻ6 ̄BA 处理 1 h 后ꎬEn108950 表达量

            转录组测序ꎬ原始数据经过质控后获得 Clean dataꎮ                      下调ꎻ6 ̄BA 处理 6 h 后ꎬEn13407 表达量上调ꎬ而
            质控结 果 ( 表 4) 显 示ꎬ 所 有 样 品 的 GC 含 量 为               En16325、En128790、En10346 和 En14028 表达 量
            54.48% ~ 56.42%ꎬQ30≥91.88%ꎬ说明转录组测序                 均下调ꎻABA 处理 6 h 后ꎬEn16325 和 En14028 表
            数据质量较高ꎬ可用于后续分析ꎮ                                    达量下调ꎻJA 处理 6 h 后ꎬEn108950 表达量下调ꎮ
                 通过 FPKM 值来 评 估 不 同 激 素 ( IAA、6 ̄BA、                利 用 qRT ̄P CR 对 7 个 EnTCPs 家 族 成 员
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