Page 120 - 《广西植物》2025年第5期

９ ２ ４ 广 西 植 物 ４５ 卷
表 ３ 垂穗披碱草 ＴＣＰ 蛋白的理化性质 Ｅｎ１２８７９０、Ｅｎ１０３４６ 和 Ｅｎ１４０２８ 均参与细胞分裂
Ｔａｂｌｅ ３ Ｐｈｙｓｉｃｏｃｈｅｍｉｃａｌ ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ｏｆ ＴＣＰ 素响应ꎬＥｎ１４０２８ 参与脱落酸响应ꎬＥｎ１０８９５０ 参与
ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｉｎ Ｅｌｙｍｕｓ ｎｕｔａｎｓ
茉莉酸响应ꎬ而 Ｅｎ１６３２５ 可能参与多种激素信号
氨基酸数量 分子量 等电点 转导通路ꎮ
基因编号 Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｉｓｏｅｌｅｃｔｒｉｃ 亚细胞定位
Ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ
Ｇｅｎｅ ＩＤ ａｍｉｎｏ ｗｅｉｇｈｔ ｐｏｉｎｔ
ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ
３ 讨论与结论
ａｃｉｄｓ (ａａ) (Ｄａ) (ｐＩ)
Ｅｎ１２４４９２ ４０２ ４０ ３２１.５０ ９.２２ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
Ｅｎ４２６９０ ５７５ ６０ ６０５.５７ １０.５８ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
垂穗披碱草是异源六倍体ꎬ基因组组分复杂
Ｅｎ９１６３３ ４１０ ４２ ７７６.２２ ９.１５ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
( Ｋｙｒｉａｋｉｄｏｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１８ꎻ Ｌｉｕ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２２)ꎮ 目前ꎬ
Ｅｎ３４７９６ ４４１ ４７ ０９８.００ ６.８１ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
利用 ＳＭＲＴ 测序技术可直接获取高质量的全长转
Ｅｎ１３０４７ ４１４ ４４ ６９７.４３ ９.８９ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
录本ꎬ无需进行组装( Ｗｅｓｔｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１５)ꎬ能
Ｅｎ１１６１０４ ４５９ ４８ ２２６.６４ ９.９７ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
够提供有效的遗传信息( Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２１)ꎮ 过
Ｅｎ１２９０６０ ５２７ ５５ ４６２.３０ ６.１３ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
去关于垂穗披碱草的组学研究大多集中在叶绿体
Ｅｎ１０３４６ ３５６ ３７ ５８４.６３ ７.０１ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
基因组组装和 ＳＳＲ 标记开发等领域( Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ
Ｅｎ８７８１８ ２５７ ２６ ３５５.９６ ６.３３ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
２０１８ꎻ Ｙａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９ꎻ Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９)ꎬ暂无
Ｅｎ１４０２８ ２５９ ２６ ９３７.７２ ６.４２ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
垂穗披碱草全长转录组数据发表ꎮ 本研究首次利
Ｅｎ１２８７９０ ２５５ ２６ ４３２.１８ ６.３０ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
用 ＳＭＲＴ 测序技术获得了垂穗披碱草全长转录组
Ｅｎ１２７１３２ ２５５ ２５ ８１５.８２ ８.９３ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
数据 ３６.９６ Ｇｂꎬ对原始数据进行校正合并和去冗
Ｅｎ１６６２８ ３２４ ３３ ９９９.９１ ６.０５ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
余分析得到 ９０ ９５６ 条非冗余转录本ꎬ其中完全覆
Ｅｎ１０７６４３ ３４４ ３５ ７４４.７５ ５.７４ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
盖到已知基因集的基因占比为 ７１.５％ꎮ 对去冗余
Ｅｎ１６３２５ ３５７ ３７ １０７.３１ ５.６５ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
转录本进行功能注释ꎬ其中 ８０ ４２１ 条在 ８ 个数据
Ｅｎ６６７５０ ３８８ ４０ ５８１.６１ １１.５２ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
库中成功得到注释ꎬ占总转录本数量的８８.４２％ꎮ
Ｅｎ１２３１９３ ２７２ ２９ １５９.３２ １２.２５ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
此外ꎬ９３.７６％ 转录本被注释为小麦族物种( 节节
Ｅｎ１０９７４５ ３９８ ４３ ０９７.３４ ９.４７ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
麦、圆锥小麦、大麦等)ꎬ它们在分类学上与垂穗披
Ｅｎ１１２０７０ ４２０ ４５ ５６２.３５ ９.７２ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
碱草亲缘关系较近ꎮ 以上结果表明ꎬ垂穗披碱草
Ｅｎ１０８９５０ １８６ ２０ ６５０.２０ ９.６７ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
全长转录组的质量较高ꎬ测序结果准确ꎬ可为后续
Ｅｎ９３８８６ ２１０ ２２ ２１４.１９ ９.７５ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
开展垂穗披碱草重要农艺性状相关基因挖掘提供
Ｅｎ１２０９２５ ４２１ ４４ ７０３.０８ ８.８９ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
重要的遗传信息ꎮ
Ｅｎ１６８６９ ３０７ ３１ ３９８.８８ １０.８０ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
ＴＣＰ 是植物特有的转录因子家族ꎬ参与调控植
Ｅｎ４６９４４ ３３９ ３５ ５５７.９４ ５.７６ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
物生长发育的众多过程ꎬ如叶片发育、侧枝形成、花
Ｅｎ３５５７３ ３８０ ４０ １６０.６４ ５.９８ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
器官形成、 激素合成与信号转导等 ( Ｍａｎａｓｓｅｒｏ ｅｔ
Ｅｎ１５４４２ ３２３ ３３ ２１３.０７ １１.２１ 细胞核 Ｎｕｃｌｅｕｓ
ａｌ.ꎬ ２０１３ꎻ Ｎｉｃｏｌａｓ ＆ Ｃｕｂａｓꎬ ２０１６)ꎮ 大多数主要作
物和重要牧草已完成 ＴＣＰ 转录因子家族全基因组
号转导过程ꎮ Ｅｎ１６３２５ 基因在 ＩＡＡ、６￣ＢＡ 和 ＡＢＡ 鉴定分析(梅文宇等ꎬ２０２２ꎻ王世泽等ꎬ２０２４)ꎮ 利用
处理后显著下调ꎬ它可能参与多种激素信号调控 全长转录组数据进行基因家族鉴定已在部分物种

通 路ꎮ 结 合 系 统 进 化 关 系 发 现 Ｅｎ１２８７９０、 中运用ꎬ如 Ｗｅｎ 等(２０２２) 基于药用植物三叶木通
Ｅｎ１０３４６ 和 Ｅｎ１４０２８ 这 ３ 个基因的同源性较高ꎬ (Ａｋｅｂｉａ ｔｒｉｆｏｌｉａｔａ)的全长转录组数据ꎬ鉴定了 ４２ 个
并且在 ６￣ＢＡ 处理后ꎬ它们的相对表达量均下调ꎬ ＷＲＫＹ 基因家族成员ꎮ 本研究利用垂穗披碱草全
而在 ＩＡＡ 和 ＡＢＡ 处理后ꎬ仅 Ｅｎ１４０２８ 基因的表达 长转录组数据共鉴定到 ２６ 个 ＥｎＴＣＰｓ 家族成员ꎬ基

量下调ꎬ推测它们可能存在功能冗余ꎮ 结果表明ꎬ 因数量与拟南芥 ２４ 个(Ｄａｎｉｓｍａｎ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３)和水
在垂穗披碱草中ꎬ７ 个 ＥｎＴＣＰｓ 家族成员可能参与 稻 ２２ 个 相 当ꎮ 此 外ꎬ 理 化 性 质 分 析 表 明ꎬ ２６ 个
调控激素合成与信号转导通路ꎬ其中 Ｅｎ３５５７３ 和 ＥｎＴＣＰｓ 蛋白在氨基酸数量、分子量及等电点方面存
Ｅｎ１４０２８ 参 与 生 长 素 响 应ꎬ Ｅｎ１０８９５０、 Ｅｎ１０３４７、 在较大差异ꎬ 但亚细胞定位预测均位于细胞核中ꎬ