Page 118 - 《广西植物》2026年第1期
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１ １ ４ 广 西 植 物 ４６ 卷
个保守基序 ( 图 ３: Ａ)ꎬ 其中 ＦｔＣ３Ｈ１０、 ＦｔＣ３Ｈ１１、
２ 结果与分析 ＦｔＣ３Ｈ１２、 ＦｔＣ３Ｈ１３、 ＦｔＣ３Ｈ１４、 ＦｔＣ３Ｈ２０、 ＦｔＣ３Ｈ４４
均含有 Ｍｏｔｉｆ １、Ｍｏｔｉｆ ３、 Ｍｏｔｉｆ ５、Ｍｏｔｉｆ ９、 Ｍｏｔｉｆ １０ꎬ数
２.１ 太白贝母 Ｃ３Ｈ 基因家族鉴定及理化性质分析 目最多ꎻ 同一族的 ＦｔＣ３Ｈ１４、 ＦｔＣ３Ｈ３９、 ＦｔＣ３Ｈ４１、
将前期课题组的太白贝母转录组数据注释得 ＦｔＣ３Ｈ５３、 ＦｔＣ３Ｈ５４、 ＦｔＣ３Ｈ５７、 ＦｔＣ３Ｈ５８ 均 含 有
到的 ６１ ５７４ 条蛋白序列提交至 ＰｌａｎｔＴＦＤＢ 数据库 Ｍｏｔｉｆ ６、Ｍｏｔｉｆ ８ ꎬ其他各亚族内的不同成员也具有相
中进行 ＢＬＡＳＴ 分析ꎬ通过 ＣＤＤ 和 ｐｆａｍ 对得到的 似的基序( ｍｏｔｉｆ )组成ꎬ除此之外ꎬ大部分成员都含
序列进行筛选验证ꎬ共筛选得到 ６５ 条具有 Ｃ３Ｈ 结 有 Ｍｏｔｉｆ １ 和 Ｍｏｔｉｆ ３ꎬ并且 ＣＣＣＨ 基序中 ４ 个(３ 个
构域的序列ꎬ将其分别命名为 ＦｔＣ３Ｈ１ －ＦｔＣ３Ｈ６５ꎮ 半胱氨酸和 １ 个组氨酸) 氨基酸是完全保守的ꎬ说
６５ 条 Ｃ３Ｈ 转录因子的氨基酸数在 １９７ ~ １ ４５１ 之 明 Ｃ３Ｈ 家族在遗传进化上还是相对保守ꎬ并且 Ｃ３Ｈ
间ꎬ其中 ＦｔＣ３Ｈ１４ 氨基酸数最多(１ ４５１)ꎬＦｔＣ３Ｈ２５ 残基之间氨基酸的种类和数量不同ꎬ很可能会导致
氨基酸数最少(１９７)ꎻ等电点为 ４.５９ ~ ９.７０ꎮ 脂肪 Ｃ３Ｈ 成员功能相似或互补ꎮ
性系数 为 ３４. ８７ ~ ７８. ４４ꎬ 不 稳 定 指 数 为 ２９. ３２ ~ 保守结构域分析发现ꎬ除 Ｃ３Ｈ 家族的共识序
７７.３８(表 ４)ꎮ ＧＲＡＶＹ 值为－１.５８８ ~ －０.２２３ꎬ６５ 条 列 ｚｆ￣ＣＣＣＨ 和 ＺｎＦ￣Ｃ３Ｈ１ 在 ＦｔＣ３Ｈ 基因家族成员
太白贝母种子 Ｃ３Ｈ 的氨基酸序列中有 ４５ 条亲疏 中广泛存在外ꎬ还鉴定出 Ａｎｋ( 锚蛋白ꎬＡｎｋｙｒｉｎ)、
水值是负值且小于 － ０.５ꎬ占 ６９.２３％ꎬ可以推出大 ＫＨ(Ｋ￣ｈｏｍｏｌｏｇｙ)、ＹＴＨ１( ＹＴ５２１Ｂ ｈｏｍｏｌｏｇｙ)、ＲＲＭ
部分太白贝母种子 Ｃ３Ｈ 蛋白是亲水蛋白ꎬ两性蛋 (ＲＮＡ ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ｍｏｔｉｆ) 等多个结构域 ( 图 ３:Ｂ)ꎮ
白占 ３０.７７％ꎬ并且没有明显的疏水区域ꎬ因此可 这表明 ＦｔＣ３Ｈ 基因家族可能具有多层次的功能协
认为这些蛋白都是亲水蛋白ꎮ 综合上述理化性质 同作用ꎮ
分析ꎬ太白贝母种子 Ｃ３Ｈ 蛋白中有 ７ 个 Ｃ３Ｈ 蛋白 ２.４ 太白贝母种子 Ｃ３Ｈ 基因家族表达模式分析
属于稳定亲水蛋白ꎬ５８ 个 Ｃ３Ｈ 蛋白属于不稳定亲 为了挖掘太白贝母种子 中 响 应 低 温 胁 迫 的
水蛋 白ꎬ 亚 细 胞 定 位 预 测 显 示ꎬ 除 ＦｔＣ３Ｈ４３ 和 Ｃ３Ｈ 基因ꎬ本研究对低温和常温 ２ 种条件下的太
ＦｔＣ３Ｈ５０ 定位在叶绿体和内质网以外ꎬ其余 Ｃ３Ｈ 白贝母种子中的 Ｃ３Ｈ 基因表达情况进行了分析ꎮ
蛋白均位于细胞核中ꎬ该预测结果可为后续研究 转录组分析结果发现ꎬ所有的 Ｃ３Ｈ 基因均在种子
太白种子 Ｃ３Ｈ 转录因子家族的功能提供了重要 萌发的第一阶段高表达ꎬ只有 ＦｔＣ３Ｈ２２、ＦｔＣ３Ｈ３５、
的线索和基础ꎮ ＦｔＣ３Ｈ３６、ＦｔＣ３Ｈ４０、ＦｔＣ３Ｈ４６ 在低温条件下的 ５ 个
２.２ 太白贝母种子 Ｃ３Ｈ 基因家族进化分析 阶段中ꎬ基因表达量均高于常温的 ５ 个阶段(图 ４)ꎮ
系统进化分析结果表明ꎬ１９６ 条 Ｃ３Ｈ 蛋白被 在种子萌发过程中ꎬＦｔＣ３Ｈ２２、ＦｔＣ３Ｈ３５、ＦｔＣ３Ｈ３６、
聚类为 ５ 个不同分支ꎬ分别标记为 Ｉ－Ⅴꎮ 在 ５ 个 ＦｔＣ３Ｈ４０ 和 ＦｔＣ３Ｈ４６ 在萌发 Ａ 时期的表达量达到
分支中均同时包含了太白贝母、拟南芥和水稻的 峰值ꎬ表明这些基因可能在该阶段具有显著的正
Ｃ３Ｈ 家族成员ꎬ各家族成员在第 ５ 个分支中的数 向调控功能ꎮ
量最多ꎮ 太白贝母 Ｃ３Ｈ 成员与拟南芥和水稻表 ２.５ 太白贝母候选 Ｃ３Ｈ 基因在 ＧＡ 处理下的表达分析
３
现出较近的亲缘关系ꎬ如 ＦｔＣ３Ｈ４０ 蛋白与拟南芥 ＧＡ 是种子萌发过程中最重要的激素ꎬ可以打
３
的 ＡＴ１Ｇ７５３４０.１ 亲缘关系较近ꎬＦｔＣ３Ｈ２３ 蛋白与 破种子 休 眠ꎬ为 研 究 太 白 贝 母 种 子 的 ＦｔＣ３Ｈ２２、
水稻的 ＯＮＩＶＡ１２Ｇ０１３４０.１ 较近ꎬ说明二者可能与 ＦｔＣ３Ｈ３５、ＦｔＣ３Ｈ３６、ＦｔＣ３Ｈ４０ 和 ＦｔＣ３Ｈ４６ 在 低 温
拟南芥和水稻的这两条蛋白具有相似的功能和特 条件下对 ＧＡ 的响应情况ꎬ本研究利用激素处理
３
点ꎮ 太白贝母、拟南芥和水稻各自的 Ｃ３Ｈ 家族成 和实时荧光定量的方法ꎬ以在低温条件下分别经
员在各分支中分布不均匀ꎬ可能是由于 ３ 个物种 过 ＧＡ 处理后的太白贝母种子作为材料ꎬ利用实
３
在进化过程中经历不同的基因组进化事件或者在 时 荧 光 定 量 ＰＣＲ 检 测 ＦｔＣ３Ｈ２２、 ＦｔＣ３Ｈ３５、
进化过程中朝多个方向发展(图 ２)ꎮ ＦｔＣ３Ｈ３６、ＦｔＣ３Ｈ４０ 和 ＦｔＣ３Ｈ４６ 的表达量ꎮ
２.３ 太白贝母 Ｃ３Ｈ 基因家族保守基序和保守结构 ＧＡ 处理后( 图 ５)ꎬ５ 个候选基因在种子萌发
３
域分析 的各 个 时 期 都 有 不 同 程 度 的 激 素 响 应ꎮ 其 中ꎬ
保守基序分析结果显示ꎬ ＦｔＣ３Ｈ 蛋白中包含 １０ ＦｔＣ３Ｈ２２、 ＦｔＣ３Ｈ３５ 在种子萌发 Ａ、 Ｂ、 Ｃ 时期显著
