Page 127 - 《广西植物》2026年第1期

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Ｇｕｉｈａｉａ Ｊａｎ. ２０２６ꎬ ４６(１): １２３－１３６

ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２５０４０１２
胡国瑾ꎬ 曾思恒ꎬ 杜明阳ꎬ 等ꎬ ２０２６. 水母雪兔子 ＧＰＡＴ 家族全基因组鉴定及表达分析 [Ｊ]. 广西植物ꎬ ４６(１): １２３－１３６.
ＨＵ Ｇ Ｊꎬ ＺＥＮＧ Ｓ Ｈꎬ ＤＵ Ｍ Ｙꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２６. Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｔｈｅ ＧＰＡＴ ｆａｍｉｌｙ ｉｎ Ｓａｕｓｓｕｒｅａ
ｍｅｄｕｓａ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４６(１): １２３－１３６.

水母雪兔子 ＧＰＡＴ 家族全基因组鉴定及表达分析

胡国瑾 ꎬ 曾思恒 ꎬ 杜明阳 ꎬ 多杰措 ꎬ 熊辉岩 ꎬ 段瑞君 １∗
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( １. 青海大学 生态环境工程学院ꎬ 西宁 ８１００１６ꎻ ２. 青海大学 农林科学院ꎬ 西宁 ８１００１６ꎻ ３. 青海大学 农牧学院ꎬ 西宁 ８１００１６ )
摘 要: 甘油￣３￣磷酸酰基转移酶( ＧＰＡＴ) 在植物生长发育和适应逆境胁迫过程中具有重要作用ꎬ为探究
ＧＰＡＴ 基因家族成员对高山植物水母雪兔子(Ｓａｕｓｓｕｒｅａ ｍｅｄｕｓａ)适应高山极端生境时发挥的作用ꎬ该研究采
用 ＨＭＭ 和 ＢＬＡＳＴｐ 方法对 ＳｍＧＰＡＴ 基因家族成员进行全基因组鉴定ꎬ对家族成员的理化性质、染色体定
位、基因结构、保守基序和顺式作用元件进行分析ꎬ并基于转录组数据和 ｑＲＴ￣ＰＣＲ 技术分析 ＳｍＧＰＡＴ 家族成
员的组织表达模式ꎮ 结果表明:(１)共鉴定出 １５ 个 ＳｍＧＰＡＴ 家族成员ꎬ随机分布在 １０ 条染色体上ꎬ分别编

码 ３５７~ ５６６ 个氨基酸ꎬ蛋白质相对分子质量为 ４０.１６ ~ ６３.８６ ｋＤꎬ等电点为 ５.９３ ~ １０.０２ꎬ亲脂系数为７９.５６~
１０４.６０ꎬ亚细胞定位预测位于线粒体或内质网(除 ＳｍＧＰＡＴ７ 以外)ꎮ (２) 系统进化分析发现ꎬＳｍＧＰＡＴ 家族
分为 ３ 个亚族(Ｇｒｏｕｐ １－Ｇｒｏｕｐ ３)ꎬ各亚族的基因结构和保守基序相似ꎮ ＳｍＧＰＡＴ 家族蛋白质二级结构以 α￣
螺旋和无规则卷曲为主ꎬ各亚族蛋白质三级结构模型相似ꎮ (３)顺式作用元件预测分析结果显示ꎬＳｍＧＰＡＴ
家族含有大量逆境胁迫响应、激素响应和光响应相关的元件ꎮ (４) 不同组织转录组数据分析结果表明ꎬ
ＳｍＧＰＡＴ 家族成员在叶和花中的表达量较茎和根高ꎬ并且 ｑＲＴ￣ＰＣＲ 结果与转录组结果基本一致ꎮ 综上认
为ꎬ水母雪兔子中鉴定出的 １５ 个 ＳｍＧＰＡＴ 家族成员在不同组织间的表达模式存在差异ꎬ其中在花和叶中表
达量较高ꎬ推测其在水母雪兔子叶和花发育过程中发挥重要作用ꎬ该研究为进一步开展 ＳｍＧＰＡＴ 基因在适
应高山极端环境过程中的功能研究提供理论基础ꎮ
关键词: 水母雪兔子ꎬ 甘油￣３￣磷酸酰基转移酶ꎬ 基因家族ꎬ 生物信息学分析ꎬ 组织特异性表达
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２６)０１￣０１２３￣１４

Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ａｎａｌｙｓｉｓ
ｏｆ ｔｈｅ ＧＰＡＴ ｆａｍｉｌｙ ｉｎ Ｓａｕｓｓｕｒｅａ ｍｅｄｕｓａ

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ＨＵ Ｇｕｏｊｉｎ ꎬ ＺＥＮＧ Ｓｉｈｅｎｇ ꎬ ＤＵ Ｍｉｎｇｙａｎｇ ꎬ ＤＵＯ Ｊｉｅｃｕｏ ꎬ
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ＸＩＯＮＧ Ｈｕｉｙａｎ ꎬ ＤＵＡＮ Ｒｕｉｊｕｎ
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｅｃｏ￣Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇꎬ Ｑｉｎｇｈａｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｘｉｎｉｎｇ ８１００１６ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ
ａｎｄ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｑｉｎｇｈａｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｘｉｎｉｎｇ ８１００１６ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ
ａｎｄ Ａｎｉｍａｌ Ｈｕｓｂａｎｄｒｙꎬ Ｑｉｎｇｈａｉ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｘｉｎｉｎｇ ８１００１６ꎬ Ｃｈｉｎａ )

收稿日期: ２０２５－０６－０２ 接受日期: ２０２５－０７－０９
基金项目: 青海省中央引导地方科技发展资金计划项目(２０２３ＺＹ００３)ꎻ ２０２３ 年度青海省“昆仑英才高端创新创业人才”计划项
目ꎻ 青海大学生态学世界一流学科研究生科技创新项目(２０２４￣ｓｔｘｙ￣Ｙ３１)ꎮ
第一作者: 胡国瑾(２０００—)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为植物生态学ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)２６８０４２７５６８＠ ｑｑ.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 段瑞君ꎬ博士ꎬ教授ꎬ主要从事高原植物生态适应性研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｒｕｉｊｕｎｄｕａｎ＠ １６３.ｃｏｍꎮ