Page 35 - 《广西植物》2026年第4期

４ 期 张晟等: 贵州九种猕猴桃属植物叶绿体基因组特征及比较分析 ５ ９ ３

表 ３ ９ 种猕猴桃属叶绿体基因组基因类型
Ｔａｂｌｅ ３ Ｇｅｎｅ ｔｙｐｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｎｉｎｅ Ａｃｔｉｎｉｄｉａ ｓｐｅｃｉｅｓ
基因类别 基因类群 基因名称
Ｇｅｎｅ ｃａｔｅｇｏｒｙ Ｇｅｎｅ ｇｒｏｕｐ Ｇｅｎｅ ｎａｍｅ
光合作用基因
∗
ＡＴＰ 合成酶 ＡＴＰ ｓｙｎｔｈｅｔａｓｅ ａｔｐＡꎬ ａｔｐＢꎬ ａｔｐＥꎬ ａｔｐＦ ꎬ ａｔｐＨꎬ ａｔｐＩ
Ｐｈｏｔｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｇｅｎｅｓ
ｐｓｂＡꎬ ｐｓｂＢꎬ ｐｓｂＣꎬ ｐｓｂＤꎬ ｐｓｂＥꎬ ｐｓｂＦꎬ ｐｓｂＨꎬ ｐｓｂＩꎬ ｐｓｂＪꎬ
光合系统Ⅱ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ ＩＩ
ｐｓｂＫꎬ ｐｓｂＬꎬ ｐｓｂＭꎬ ｐｓｂＮꎬ ｐｓｂＴꎬ ｐｓｂＺꎬ ｙｃｆ３ ∗∗
ｎｄｈＡ ꎬ ｎｄｈＢ ∗ ( ×２ ) ꎬ ｎｄｈＣꎬ ｎｄｈＤꎬ ｎｄｈＥꎬ ｎｄｈＦꎬ
∗
ＮＡＤＨ 脱氢酶 ＮＡＤＨ ｄｅｈｙｄｒｏｇｅｎａｓｅ
ｎｄｈＧꎬ ｎｄｈＨꎬ ｎｄｈＩꎬ ｎｄｈＪꎬ ｎｄｈＫ
细胞色素 ｂ / ｆ 复合物
∗
∗
ｐｅｔＡꎬ ｐｅｔＢ ꎬ ｐｅｔＤ ꎬ ｐｅｔＧꎬ ｐｅｔＬꎬ ｐｅｔＮ
Ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｂ / ｆ ｃｏｍｐｌｅｘ
光合系统 Ⅰ Ｐｈｏｔｏｓｙｓｔｅｍ ＩＩ ｐｓａＡꎬ ｐｓａＢꎬ ｐｓａＣꎬ ｐｓａＩꎬ ｐｓａＪ
二磷酸核酮糖羧化酶大亚基
ｒｂｃＬ
ＲｕｂｉｓＣＯ ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
自我复制基因
核糖体 ＲＮＡ Ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ＲＮＡ ｒｒｎ１６Ｓ ( ×２) ꎬ ｒｒｎ２３Ｓ ( ×２ ) ꎬ ｒｒｎ４.５Ｓ ( ×２ ) ꎬ ｒｒｎ５Ｓ ( ×２)
Ｓｅｌｆ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｇｅｎｅｓ
∗
∗
ｔｒｎＫ￣ＵＵＵ ꎬ ｔｒｎＱ￣ＵＵＧ ꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＣＵ ꎬ ｔｒｎＧ￣ＵＣＣ ꎬ ｔｒｎＲ￣
ＵＣＵ ꎬ ｔｒｎＣ￣ＧＣＡ ꎬ ｔｒｎＤ￣ＧＵＣ ꎬ ｔｒｎＹ￣ＧＵＡ ꎬ ｔｒｎＥ￣ＵＵＣꎬ
ｔｒｎＴ￣ＧＧＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＵＧＡꎬ ｔｒｎＧ￣ＧＣＣꎬ ｔｒｎｆＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎｆＭ￣
∗
ＣＡＵꎬ ｔｒｎＳ￣ＧＧＡꎬ ｔｒｎＴ￣ＵＧＵꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＡ ꎬ ｔｒｎＦ￣ＧＡＡꎬ
转运 ＲＮＡ 基因 Ｔｒａｎｓｆｅｒ ＲＮＡ
∗
ｔｒｎＶ￣ＵＡＣ ꎬ ｔｒｎＭ￣ＣＡＵꎬ ｔｒｎＷ￣ＣＣＡꎬ ｔｒｎＰ￣ＵＧＧꎬ ｔｒｎＨ￣
ＧＵＧ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＩ￣ＣＡＵ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＬ￣ＣＡＡ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＶ￣ＧＡＣ ( ×２) ꎬ
ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ ∗ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ ∗ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＮ￣
ＧＵＵ ( ×２) ꎬ ｔｒｎＬ￣ＵＡＧ
核糖体蛋白大亚基 ｒｐｌ１４ꎬ ｒｐｌ１６ ꎬ ｒｐｌ２ ꎬ ｒｐｌ２０ꎬ ｒｐｌ２２ꎬ ｒｐｌ２３ꎬ ｒｐｌ３２ꎬ
∗
∗
Ｌａｒｇｅ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｒｐｌ３３ꎬ ｒｐｌ３６
核糖体蛋白小亚基 ｒｐｓ１２ ∗∗ ( ×２) ꎬ ｒｐｓ１４ꎬ ｒｐｓ１５ꎬ ｒｐｓ１６ ꎬ ｒｐｓ１８ꎬ
∗
Ｓｍａｌｌ ｓｕｂｕｎｉｔ ｏｆ ｒｉｂｏｓｏｍａｌ ｐｒｏｔｅｉｎ ｒｐｓ１９ [Ａｃ＿Ｄ２４３３ꎬ Ａｃ＿Ｄ＿２４３５] ꎬ ｒｐｓ２ꎬ ｒｐｓ３ꎬ ｒｐｓ４ꎬ ｒｐｓ７ ( ×２) ꎬ ｒｐｓ８
∗
ＲＮＡ 聚合酶 ＲＮＡ ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ ｒｐｏＡꎬ ｒｐｏＢꎬ ｒｐｏＣ１ ꎬ ｒｐｏＣ２
其他基因 乙酰辅酶 Ａ 羧化酶亚基 ａｃｃＤ
Ｏｔｈｅｒ ｇｅｎｅｓ Ａｃｅｔｙｌ￣ＣｏＡ ｃａｒｂｏｘｙｌａｓｅ ｓｕｂｕｎｉｔ
Ｃ 型细胞色素合成 ｃｃｓＡ
Ｃ￣ｔｙｐｅ ｃｙｔｏｃｈｒｏｍｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
包膜蛋白 ｃｅｍＡ
Ｅｎｖｅｌｏｐ ｍｅｍｂｒａｎｅ ｐｒｏｔｅｉｎ
翻译起始因子 ｉｎｆＡ
Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎａｌ ｉｎｉｔｉａｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ
成熟酶 Ｍａｔｕｒａｓｅ ｍａｔＫ
未知功能基因 假定阅读框 (ｙｃｆ) ∗∗ ( ×２) ( ×２)
ｙｃｆ１ ꎬ ｙｃｆ１５ ꎬ ｙｃｆ２ ꎬ ｙｃｆ４
Ｕｎｋｎｏｗｎ ｆｕｎｃｔｉｏｎ ｇｅｎｅｓ Ｈｙｐｏｔｈｅｔｉｃａｌ ｒｅａｄｉｎｇ ｆｒａｍｅ (ｙｃｆ)
注: ∗表示含有 １ 个内含子ꎻ∗∗表示含有 ２ 个内含子ꎻ( ×２)表示位于 ＩＲｓ 区的重复基因ꎻ[ ]为该基因在某些物种中不存在ꎮ
Ｎｏｔｅ: ∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｏｎｅ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ∗∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｗｏ ｉｎｔｒｏｎｓꎻ ( ×２) ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｄｕｐｌｉｃａｔｅｄ ｇｅｎｅｓ ｌｏｃａｔｅｄ ｉｎ ｔｈｅ ＩＲｓ ｒｅｇｉｏｎꎻ [ ] ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈａｔ
ｔｈｅ ｇｅｎｅ ｉｓ ａｂｓｅｎｔ ｉｎ ｓｏｍｅ ｓｐｅｃｉｅｓ.

(Ｔａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１９ａ)也相似ꎬ反映了猕猴桃属叶绿 亚基ꎬ其缺失推测是由于功能已转移至核基因组ꎬ
体基因组在进化过程中的整体保守性ꎮ 本研究 这一现象在被子植物叶绿体进化中并不罕见ꎬ可
中ꎬ９ 种猕猴桃均未检测到 ｃｌｐＰ 基因ꎮ ｃｌｐＰ 基因的 能与基因的亚细胞定位重排有关ꎮ 相比之下ꎬｉｎｆＡ
缺失在猕猴桃属中可能是一个普遍事件ꎬ近期对 基因 在 本 研 究 所 有 物 种 中 均 保 留ꎬ 但 Ｌｉｎ 等
猕猴桃属多个种的比较基因组研究也证实了这一 (２０２５)报道该基因在安息香猕猴桃和浙江猕猴桃
点(Ｗａｎｇ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１６)ꎮ 该基因编码蛋白酶水解 中发生缺失ꎮ 这种谱系特异性的基因丢失现象表