Page 24 - 《广西植物》2026年第5期
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7 5 6                                  广  西  植  物                                         46 卷
                                     表 1  OsNGCD 家族成员 qRT ̄PCR 分析的引物序列
                             Table 1  Primer sequences for qRT ̄PCR analysis of OsNGCD family members
                                                                                                扩增产物
                基因名称                正向引物(5′-3′)                    反向引物(5′-3′)
                                                                                            Amplification product
                Gene name         Forward primer (5′-3′)         Reverse primer (5′-3′)
                                                                                                 (bp)
                OsNGCD1         TTCCCTGAATCCGCTCCTTTC         ACCCAGCAGAAGAAAATCCAGG              129
                OsNGCD2        CTCTTCACATGGGCAAATTCGG           CATCCGCCGTCGTCATTCT               82
                OsNGCD3         AGGATTCACCACTGCCGAAG            TAGTGCCCGTCTATGGTCCA              102
                OsNGCD4         TCTTGGCCGACACATCCTTG            TGAACCAATGCCGCCAAGT               115
                 OsActin        GACCTTCAACACCCCTGCTA           ACAGTGTGGCTGACACCATC               114



                                   表 2  OsNGCD 家族成员蛋白理化性质及亚细胞定位分析
                    Table 2  Physicochemical properties and subcellular localization of OsNGCD family members in rice
                                         氨基酸数量      分子量                        亚细胞定位预测
                                 染色体数                     理论等电点     不稳定系数                          注释
             基因名称       基因号               Number of  Molecular                    Predicted
                                Chromosome                 Theoretical  Instability              Annotation
             Gene name  Gene No.            amino   weight                        subcellular
                                  number                      pI       index
                                            acids   (Da)                          localization
             OsNGCD1 Os07g0444000   7       463    52 478.16  5.31     45.27    过氧化物酶体
                                                                                  Peroxisome
             OsNGCD2 Os08g0111200   8       928   101 328.40  5.94     35.72    过氧化物酶体            假定的
                                                                                  Peroxisome
                                                                                                 非溶酶体
             OsNGCD3 Os10g0473400  10       974   109 268.40  6.79     41.27   叶绿体、细胞质、         葡萄糖神经
                                                                             线粒体、过氧化物酶体           酰胺酶
                                                                             Chloroplastꎬ cytoplasmꎬ  Non ̄lysosomal
                                                                                mitochondrumꎬ  glucosylceramidaseꎬ
                                                                                  peroxisome      putativeꎬ
                                                                                                 expressed
             OsNGCD4 Os11g0242100  11       950   106 810.41  5.81     40.19      细胞质、
                                                                                过氧化物酶体
                                                                                  Cytoplasmꎬ
                                                                                  peroxisome



            其中 OsNGCD1 仅含 6 个基序( 缺失 motif 7 -motif             2.5 OsNGCD 基因家族的顺式作用元件分析
            10)ꎬ而 OsNGCD2 -OsNGCD4 完整保留 10 个预测                     通过对 OsNGCD 基因家族成员启动子区结构
            基序(motif 1-motif 10)ꎮ InterProScan 分析( 图 6)        域(转录起始位点上游 2 kb) 的系统分析ꎬ我们鉴
            显 示ꎬ 所 有 成 员 均 含 功 能 核 心 结 构 域 DUF608ꎬ             定出 3 类功能显著的顺式调控元件ꎬ即发育调控
            OsNGCD2 含有特异性结构域 COG4354ꎬ可能参与                      元件、植物激素响应元件、胁迫响应元件ꎮ (1) 在
            原核同源功能ꎬ而 OsNGCD3 -OsNGCD4 含有特异                     发育调控元件中ꎬ分生组织特异性表达元件( CAT ̄
            性结构域 Glyco_hydr_116N 可能与糖水解酶活性                     box)存在于 OsNGCD1 和 OsNGCD4 的启动子ꎻ贮藏

            有关ꎮ motif 1 - motif 6 位 于 DUF608 结 构 域 内ꎬ          蛋白 代 谢 调 控 元 件 ( O2 ̄site) 存 在 于 OsNGCD1 /
            motif 7-motif 10 与 COG4354、Glyco_hydr_116N 结       OsNGCD2 / OsNGCD4 的启 动 子ꎮ ( 2) 在 植 物 激 素

            构域共定位ꎮ                                             响应元件中ꎬ脱落酸响应元件( ABRE) 在所有成员
            2.4 同源蛋白系统进化分析                                     均含 有 1 ~ 2 个 拷 贝ꎻ 水 杨 酸 响 应 元 件 ( TCA ̄
                 基于邻接法构建的水稻和拟南芥同源蛋白系                           element)为 OsNGCD2 / OsNGCD4 特异性存在ꎻ赤霉
            统进化树(图 7)显示:OsNGCD2 单独形成一个进化                       素响应元件( GARE ̄motif) 为 OsNGCD3 独有ꎻ茉莉

            枝ꎬ表现 出 明 显 的 序 列 分 化ꎬ 可 能 获 得 新 功 能ꎻ               酸 甲 酯 响 应 元 件 ( CGTCA ̄motif) 为 OsNGCD2 /
            OsNGCD4 与拟南芥 AT5G49900 聚为一簇ꎬ提示功                    OsNGCD3 共有ꎻ生长素响应元件( TGA ̄element) 仅
            能保守性ꎻOsNGCD1 / OsNGCD3 与 AT3G24180 构成              存在于 OsNGCD1 启动子区ꎮ (3) 在胁迫响应元件
            单系群ꎮ                                               中ꎬ MYB 结合干旱响应元件( MBS) 保守存在于
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