Page 24 - 《广西植物》2026年第5期
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表 1 OsNGCD 家族成员 qRT ̄PCR 分析的引物序列
Table 1 Primer sequences for qRT ̄PCR analysis of OsNGCD family members
扩增产物
基因名称 正向引物(5′-3′) 反向引物(5′-3′)
Amplification product
Gene name Forward primer (5′-3′) Reverse primer (5′-3′)
(bp)
OsNGCD1 TTCCCTGAATCCGCTCCTTTC ACCCAGCAGAAGAAAATCCAGG 129
OsNGCD2 CTCTTCACATGGGCAAATTCGG CATCCGCCGTCGTCATTCT 82
OsNGCD3 AGGATTCACCACTGCCGAAG TAGTGCCCGTCTATGGTCCA 102
OsNGCD4 TCTTGGCCGACACATCCTTG TGAACCAATGCCGCCAAGT 115
OsActin GACCTTCAACACCCCTGCTA ACAGTGTGGCTGACACCATC 114
表 2 OsNGCD 家族成员蛋白理化性质及亚细胞定位分析
Table 2 Physicochemical properties and subcellular localization of OsNGCD family members in rice
氨基酸数量 分子量 亚细胞定位预测
染色体数 理论等电点 不稳定系数 注释
基因名称 基因号 Number of Molecular Predicted
Chromosome Theoretical Instability Annotation
Gene name Gene No. amino weight subcellular
number pI index
acids (Da) localization
OsNGCD1 Os07g0444000 7 463 52 478.16 5.31 45.27 过氧化物酶体
Peroxisome
OsNGCD2 Os08g0111200 8 928 101 328.40 5.94 35.72 过氧化物酶体 假定的
Peroxisome
非溶酶体
OsNGCD3 Os10g0473400 10 974 109 268.40 6.79 41.27 叶绿体、细胞质、 葡萄糖神经
线粒体、过氧化物酶体 酰胺酶
Chloroplastꎬ cytoplasmꎬ Non ̄lysosomal
mitochondrumꎬ glucosylceramidaseꎬ
peroxisome putativeꎬ
expressed
OsNGCD4 Os11g0242100 11 950 106 810.41 5.81 40.19 细胞质、
过氧化物酶体
Cytoplasmꎬ
peroxisome
其中 OsNGCD1 仅含 6 个基序( 缺失 motif 7 -motif 2.5 OsNGCD 基因家族的顺式作用元件分析
10)ꎬ而 OsNGCD2 -OsNGCD4 完整保留 10 个预测 通过对 OsNGCD 基因家族成员启动子区结构
基序(motif 1-motif 10)ꎮ InterProScan 分析( 图 6) 域(转录起始位点上游 2 kb) 的系统分析ꎬ我们鉴
显 示ꎬ 所 有 成 员 均 含 功 能 核 心 结 构 域 DUF608ꎬ 定出 3 类功能显著的顺式调控元件ꎬ即发育调控
OsNGCD2 含有特异性结构域 COG4354ꎬ可能参与 元件、植物激素响应元件、胁迫响应元件ꎮ (1) 在
原核同源功能ꎬ而 OsNGCD3 -OsNGCD4 含有特异 发育调控元件中ꎬ分生组织特异性表达元件( CAT ̄
性结构域 Glyco_hydr_116N 可能与糖水解酶活性 box)存在于 OsNGCD1 和 OsNGCD4 的启动子ꎻ贮藏
有关ꎮ motif 1 - motif 6 位 于 DUF608 结 构 域 内ꎬ 蛋白 代 谢 调 控 元 件 ( O2 ̄site) 存 在 于 OsNGCD1 /
motif 7-motif 10 与 COG4354、Glyco_hydr_116N 结 OsNGCD2 / OsNGCD4 的启 动 子ꎮ ( 2) 在 植 物 激 素
构域共定位ꎮ 响应元件中ꎬ脱落酸响应元件( ABRE) 在所有成员
2.4 同源蛋白系统进化分析 均含 有 1 ~ 2 个 拷 贝ꎻ 水 杨 酸 响 应 元 件 ( TCA ̄
基于邻接法构建的水稻和拟南芥同源蛋白系 element)为 OsNGCD2 / OsNGCD4 特异性存在ꎻ赤霉
统进化树(图 7)显示:OsNGCD2 单独形成一个进化 素响应元件( GARE ̄motif) 为 OsNGCD3 独有ꎻ茉莉
枝ꎬ表现 出 明 显 的 序 列 分 化ꎬ 可 能 获 得 新 功 能ꎻ 酸 甲 酯 响 应 元 件 ( CGTCA ̄motif) 为 OsNGCD2 /
OsNGCD4 与拟南芥 AT5G49900 聚为一簇ꎬ提示功 OsNGCD3 共有ꎻ生长素响应元件( TGA ̄element) 仅
能保守性ꎻOsNGCD1 / OsNGCD3 与 AT3G24180 构成 存在于 OsNGCD1 启动子区ꎮ (3) 在胁迫响应元件
单系群ꎮ 中ꎬ MYB 结合干旱响应元件( MBS) 保守存在于

