Page 42 - 《广西植物》2020年第12期
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ϟ԰ 期                   时小东等᧥ 基于藜麦转录组的脂肪酸生物合成途径解析                                          ϟ Ꭾ ԰ Ꭾ
                                             表 ྽ই 藜麦 ϓ᎒ 个 ዛࣷࣷᐹ໧ᓣ 编码基因
                                          ఋᑕᤦ᤟ᔀ ࿗জ ᓂᔽ༁ᡷ ᆍ஦ ጢᎮ ዶऊऊᑕ༁ᔀ ੫ᔀႿᔀ༁ ᔽႿ ीࣼᔽႿᆍᑕ

                                    染色体定位      蛋白长度                                      脂肪系数
                基因 ᧧᧕      基因名                          相对分子质量       等电点     不稳定指数֒               总平均亲水性
                                    ऊၤʢᆍቝᆍ༁ᆍቝᑕ᤟  ۪ʢᆍᡷᔀᔽႿ                                  ዶ᤟ᔽᡱၤᑕᡷᔽዹ
               ᥈ᔀႿᔀ ᧧᧕   ᥈ᔀႿᔀ Ⴟᑕቝᔀ                          ᥘऔ         ᡱ᧧   ᧧Ⴟ༁ᡷᑕᤦᔽ᤟ᔽᡷᢃ ᔽႿʛᔀ଴ ֒     ᥈኏ዶ჆ɟ
                                      ᤟ᆍዹᑕᡷᔽᆍႿ   ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ                                    ᔽႿʛᔀ଴
                ͅዞÞᤇᤃᤃ      ᐹዞዞࣷ      ऊၤʢϟ࿗      ጢሕँ       ጢऐ ሕϟँ     ᤃ঎ऐ࿗      ሕጢ঎ᤃሕ      ऐጢ঎࿗      ͱԡ঎ϟԡ
                ͅዞÞᤇᎮᤃ      ᐹዞዞࣷ      ऊၤʢԡሕ      ጢ࿗Ꭾ       ጢँ ᤃ࿗ԡ     Ꭾ঎ϟऐ      ሕ࿗঎ऐϟ      ऐऐ঎ϟ      ͱԡ঎ϟᤃ
                ͅዞÞᤇऐ       ᐹዞዞዛ      ऊၤʢԡϟ      Ꭾ԰ጢ       ऐϟ ࿗԰ऐ     ऐ঎ँϟ      ሕሕ঎ᤃ࿗      ँጢ঎࿗ሕ     ͱԡ঎࿗ϟ
                ͅዞÞᤇ԰ᤃ      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢԡϟ      ጢϟሕ       ጢᎮ ϟँᎮ     ऐ঎ሕጢ      ࿗ԡ঎ᤃ      ϟԡϟ঎ϟँ     ԡ঎ԡ԰
                ͅዞÞᤇᤃᎮ      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢԡϟ      ᤃँϟ       Ꭾऐ ԰ጢऐ     ँ঎ϟ࿗      ሕᤃ঎࿗ጢ      ँ԰঎԰ϟ     ͱԡ঎࿗Ꭾ

                ͅዞÞᤇᤃऐ      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢϟԡ      Ꭾሕᤃ       ऐ԰ ጢँϟ     ऐ঎ᤃሕ      ሕጢ঎ँᤃ      ँሕ঎࿗ᤃ     ͱԡ঎࿗ሕ
                ͅዞÞᤇᎮ԰      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢϟԡ      Ꭾ԰Ꭾ       ऐϟ ࿗԰ϟ     ऐ঎ँ࿗      ሕᎮ঎ጢϟ      ऐँ঎ᤃሕ     ͱԡ঎ጢϟ
                ͅዞÞᤇᎮᎮ      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢԡጢ      Ꭾϟ԰       Ꭾँ ऐ࿗ऐ     ऐ঎ጢ࿗      ሕᤃ঎ጢሕ      ँϟ঎԰࿗     ͱԡ঎ጢ԰
                ͅዞÞᤇᎮँ      ᐹዞዞዛ      ऊၤʢԡ԰      ጢᤃԡ       ᤃ԰ ሕጢϟ     ऐ঎ԡऐ      ሕጢ঎ऐϟ      ँԡ঎Ꭾँ     ͱԡ঎ጢԡ
                ͅዞÞᤇϟԡ      ᐹዞዞᦵ      ऊၤʢԡϟ      ሕᤃँ       ࿗ϟ ԰Ꭾᤃ     Ꭾ঎ᤃᤃ      ࿗ጢ঎ጢँ      ँँ঎ԡऐ     ԡ঎ϟԡ
                ͅዞÞᤇϟሕ      ᐹዞዞᦵ      ऊၤʢԡᎮ      ሕጢሕ       ሕऐ ԰ጢ࿗     ࿗঎ँᎮ      ሕ԰঎Ꭾ࿗      ँᎮ঎԰      ԡ঎ԡϟ
                ͅዞÞᤇᤃሕ      ᐹዞዞᦵ      ऊၤʢԡሕ      ԰ሕᎮ       ԰ጢ ऐጢϟ     ࿗঎Ꭾጢ      ࿗ϟ঎ሕሕ      ँ࿗঎ᤃ࿗     ԡ঎ԡጢ

                ͅዞÞᤇ԰࿗      ᐹዞዞଧ      ऊၤʢԡऐ      ԰Ꭾሕ       ԰ऐ Ꭾऐ࿗     ᤃ঎࿗࿗      ᤃ԰঎Ꭾሕ      Ꭾऐ঎ँᎮ     ͱԡ঎ሕԡ
                ͅዞÞᤇሕጢ      ᐹዞዞଧ      ऊၤʢϟԡ      ԰԰ᤃ       ԰ሕ ᤃሕ࿗     ጢ঎ᎮᎮ      Ꭾϟ঎ᤃϟ      Ꭾጢ঎ጢऐ     ͱԡ঎԰ጢ
                ͅዞÞᤇ࿗ᤃ      ᐹዞዞଧ      ऊၤʢϟԡ      ԰Ꭾሕ       ԰ऐ ऐϟँ     ᤃ঎ጢሕ      ᤃ԰঎ᤃऐ      ऐሕ঎԰ᤃ     ͱԡ঎԰ᤃ
                ͅዞÞᤇጢ԰      ᐹዞዞଧ      ऊၤʢԡँ      ԰԰ሕ       ԰ሕ ሕ԰԰     ጢ঎ᎮᎮ      ᤃᎮ঎Ꭾ࿗      Ꭾँ঎԰࿗     ͱԡ঎ϟँ
                ͅዞÞᤇऐᎮ      ᐹዞዞଧ      ऊၤʢԡऐ      ԰ጢᤃ       ԰ᤃ Ꭾँँ     ँ঎ሕऐ      Ꭾᤃ঎ԡ԰      Ꭾऐ঎ጢँ     ͱԡ঎԰ԡ


            列结构分析表明ᖔ 含有相对保守的 ᣽ዶ୩ ֒ 结构

            ᥈۪શɟ୩᧧୩ఋዶऊዶఋ୩શྉè ᣰ ̀ ᣰ ɟɯऊ᧧ଫ同时ᖔ藜麦 ᣽ዶ୩֒             ሕজ 讨论与结论
            序列 શ 端氨基酸序列存在差异性ᖔऊ 端氨基酸序
            列相对保守ྉ图 ሕɯᤥ                                            虽然藜麦全基因组数据已经报道ᖔ但藜麦分
                 将基因在种子中表达量与其他组织中的表达                           子生物学研究基础相对薄弱ᖔ功能基因数据仍有
            量进行两两对比发现ᖔ除 ͅዞÞᤇሕԡ 外ᖔ其他 ᣽ዶ୩ 编                      待深 入地研究 ྉ Ȯᑕʢ׹ᔽ༁ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟᎮଫ Իᆍࣼ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ
            码基因在种子中均发现存在上调表达ଫ与叶片相                              ԰ԡϟᎮɯᤥ 转录组测序技术成本低ᖔ灵敏度高ᖔ可在
            比ᖔϟ 个基因ྉͅዞÞᤇ԰ँɯ 在种子中出现下调表达ᖔ这                       短时间内获得大量基因表达数据ᖔ相比其他高通
            是挖掘到的唯一的下调表达基因ྉ 表 ጢɯᤥ 对差异                          量基因表达数据获得方法具有明显的优势ᖔ已经

            表达基因进行分析ᖔ与根相比ᖔϟԡ 个基因为上调表                           在油桐ܦ核桃等产油植物的脂肪酸合成途径挖掘
            达ଫ与茎相比ᖔऐ 个基因为上调表达ଫ在叶和花中存                           中得到成功运用ྉ 陈昊等ᖔ԰ԡϟሕଫ 杨丽等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ
            在上调表达的基因数目为 ࿗ 个和 ᤃ 个ᤥ 与其他 ࿗                        本研究利用藜麦 ጢ 种组织ྉ 根ܦ茎ܦ叶ܦ花和种子ɯ
            个组织相比ᖔ在种子中 ͅዞÞᤇϟጢܦͅዞÞᤇ࿗ጢܦͅዞÞᤇᎮጢܦ                   转录组数据ᖔ 测序数据 ͐ሕԡ 碱基百分比 均 大 于
            ͅዞÞᤇጢϟ 基因均表现为上调表达ᤥ 上述结果表明ᖔ                         ँ԰ᠮᖔ对比参考基因组效率大于 ँ԰ᠮᖔ表明序列测
            在种子中 ᣽ዶ୩ 编码基因表达量相对其他组织中                            序质量达到转录组分析的要求ᤥ 同时ᖔ通过基因
            高ᖔ有利于种子中脂肪酸链的延长ᖔ为油脂合成提                             组对比分析ᖔ挖掘得到了Ꭾ ࿗ᤃϟ个新基因序列ᖔ并有

            供条件ᤥ                                               ጢ ᤃ԰ሕ个新基因得到注释ᖔ 新基因的挖掘可能与品
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