Page 42 - 《广西植物》2020年第3期
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3 2 2 广 西 植 物 40 卷
已鉴定化合物对于人体健康保健方面如延缓衰老 1.2 红树根系土壤放线菌多样性实验
活性则鲜有报道ꎮ 本研究对红树根系土壤放线菌 1.2.1 培养基配方 分离用固体培养基:参考李家
多样性进行分析ꎬ并通过初步筛选获得具有延缓 怡 等 ( 2017 ) 方 法 采 用 AGG、 M4、 M5、 M7、 M9、
衰老表型的放线菌菌株ꎬ为后期挖掘具有延缓衰 M10、M11、ISP7 和 ISP3 共 9 种分离培养基ꎬ培养
老活性的新化合物提供重要的菌种资源ꎮ 基详细配方见参考文献ꎮ
纯化及保藏培养基:改良 ISP2 固体培养基ꎬ包
1 材料与方法 括酵母提取物 2.0 gꎬ麦芽提取物 2.0 gꎬ葡萄糖 2.0
gꎬ琼脂 20.0 g 和海水 1 000 mLꎮ
1.1 材料 发酵培养基:改良 ISP2 液体培养基ꎮ
1.1.1 红树林根系土壤样品 2017 年 7 月从海南 1.2.2 红树根系土壤样品的处理方法 参考李菲
西海岸共采集四种真红树林植物根系土壤样品 7 等(2018)的方法ꎬ挑除根系土壤样品表面的杂质ꎬ
份ꎬ样品信息如表 1 所示ꎮ 用灭菌铲沿每种红树 取红树植物根须表面附着的土壤 2.0 g 装于含有
根围挖取深度为 5 cm 的土壤样品ꎬ同一种红树植 石英砂和 20 mL 无菌水的锥形瓶中ꎬ于摇床中充
物样品的取样地点距离均大于 100 mꎬ土壤样品保 分摇匀ꎬ制成 10 、10 稀释液ꎮ 取两种稀释液各
 ̄2
 ̄3
存于采样冰盒中并于 24 h 内送回实验室进行菌株 0.2 mLꎬ分别涂布于 9 种分离培养基上ꎬ置于恒温
的分离实验ꎮ 培养箱 28 ℃ 下倒置培养 2 ~ 8 周ꎻ从涂布培养基中
挑选单一菌落ꎬ采用三区划线法于 ISP2 培养基上
表 1 样品采集信息
进行分离纯化ꎬ得到单一纯净的菌落ꎬ编号并记录
Table 1 Information of collected samples
菌落的形态特征及菌落数ꎮ 将纯化好的菌株保藏
样品编号 土壤样品 经纬度 于 20%(V / V)无菌甘油管ꎬ-80 ℃ 冰箱保存备用ꎮ
Code of Longitude and
Rhizosphere soil sample
sample latitude 1.2.3 16S rRNA 基因序列的系统发育学分析 放
1-3 红海榄土壤 109°59′37″ E、 线菌基因组提取采 用 Chelex ̄100 法 ( 周 双 清 等ꎬ
2010)通过梯度 PCR 扩增得到 16S rRNA 基因序
Rhizophora stylosa rhizosphere soil 19°55′07″ N
1-4 红海榄土壤 109°59′37″ E、 列(Walsh et al.ꎬ1991)ꎬ利用琼脂糖凝胶电泳初步
Rhizophora stylosa rhizosphere soil 19°55′07″ N
1-14 红海榄土壤 109°33′50″ E、 评价目的条带大小及扩增质量ꎬ切胶回收目的条
Rhizophora stylosa rhizosphere soil 19°51′27″ N
带并委托上海美吉生物医药技术有限公司广州分
2-1 桐花树土壤 109°59′37″ E、
Aegiceras corniculatum rhizosphere soil 19°55″07″ N 公司进行测序分析ꎮ
2-2 白骨壤土壤 109°59′37″ E、 测序结果利用 DNA Star 软件处理ꎬ所得到 16S
Avicennia marina rhizosphere soil 19°55′07″ N
rRNA 基因 序 列 通 过 数 据 库 EzBioCloud ( https: / /
2-3 白骨壤土壤 109°59′37″ E、
www.ezbiocloud.net/ )(Yoon et al.ꎬ 2017)进行相似
Avicennia marina rhizosphere soil 19°55′07″ N
7-7 红树土壤 109°33′50″ E、 性搜索和在线比对ꎬ获得相似性最高且有效发表
Rhizophora apiculata rhizosphere soil 19°51′27″ N
的典型菌株ꎬ并以此作为参比对象ꎮ
1.3 红树根系土壤放线菌活性实验
1.1.2 线虫样品 OP50 大肠杆菌(OP50 Escherichia 1.3.1 红树根系土壤放线菌粗提物的制备 参考
coli) 和 野 生 型 秀 丽 隐 杆 线 虫 ( Caenorhabditis 覃媚等(2016) 的方法ꎬ将根系放线菌于改良 ISP2
elegans)均由广西科学院汪斌博士惠赠ꎮ 固体培养基进行活化培养ꎬ在其对数生长期接种
1.1.3 实验试剂 Chelex ̄100 树脂ꎬ2×Easy Taq Su ̄ 到 4 瓶 200 mL 改良 ISP2 液体培养基中ꎬ于 28 ℃ 、
permix 购于 BioRad 公司(美国)ꎻ16S rRNA 基因扩 180 rmin 摇床发酵培养 7 dꎮ 发酵液用等体积
 ̄1
增 引 物 对 27F ( 5′ ̄AGAGTTTGATCCTGGCTCAG ̄ 乙酸乙酯萃取三次ꎬ萃取液减压浓缩置于干燥器
3′)和 1492R(5′ ̄GGTTACCTTGTTACGACTT ̄3′) 购 中低温保存备用ꎮ
于全式金生物技术有限公司( 中国ꎬ北京)ꎻ5%次 1.3.2 红树根系土壤放线菌抗衰老活性测试方法
氯酸钠购于朗索医用消毒剂有限公司( 中国ꎬ杭 以秀丽隐杆线虫为模型对红树林根系土壤放线
州)ꎻ其他试剂均为国产分析纯ꎮ 菌发酵产物进行活性筛选ꎬ记录线虫的寿命数据