Page 139 - 《广西植物》2021年第11期

ϟϟ 期 李江莹等᧥ 印度血桐与中平树基因组调查及 ୩୩኏ 分子标记分析 ϟ ँ ԡ ϟ

ዛ঎ 印度血桐ଫ ଧ঎ 中平树ᤥ
ዛ঎ ᤹ᐹዞᐹʗᐹႥ੖ᐹ ᔠႥʐᔠዞᐹଫ ଧ঎ ᤹ॹ ʐᓣႥᡙᔠዞࣩᤀᐹᡙᐹॹ
图 ԰জ ϟᎮ᤬ቂᓣʗ 分布曲线
èᔽ੫঎ ԰জ ᧕ᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ዹࣼʢ׹ᔀ ᆍ஦ ϟᎮ᥋ቝᔀʢ

表 ԣই ϓ᎒᤬ቂᓣʗ 分析数据统计
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ᧕ᑕᡷᑕ ༁ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ༁ ᆍ஦ ϟᎮ᥋ቝᔀʢ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁
修正后的 杂合率 重复率
基因组大小
样品 ᣽᥋ቝᔀʢ 深度 ᣽ቝᔀʢ 总数 基因组大小
长度
୩ᑕቝᡱ᤟ᔀ ᧕ᔀᡱᡷၤ ᣽ቝᔀʢ ༁ࣼቝ ᥈ᔀႿᆍቝᔀ ༁ᔽझᔀ ኏ᔀ׹ᔽ༁ᔀʛ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ̀ᔀᡷᔀʢᆍझᢃ੫ᆍࣼ༁ ኏ᔀᡱᔀᑕᡷ ʢᑕᡷᔀ
᣽᥋ቝᔀʢ ᤟ᔀႿ੫ᡷၤ ྉᥘɯ ʢᑕᡷᔀ ྉᠮɯ ྉᠮɯ
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印度血桐 ϟᎮ ࿗ԡ ሕँ Ꭾ԰ጢ ऐጢϟ ϟँጢ ँँሕ঎ϟጢ ँऐᤃ঎ऐ࿗ ԡ঎Ꭾጢ Ꭾሕ঎ԡ԰
᤹ᐹዞᐹʗᐹႥ੖ᐹ ᔠႥʐᔠዞᐹ
中平树 ϟᎮ ጢ࿗ ጢϟ ጢँ࿗ ँऐሕ ϟϟᎮ ँጢጢ঎࿗ᤃ ँ࿗ᤃ঎԰ሕ ԡ঎ᤃጢ Ꭾϟ঎ጢ
᤹ॹ ʐᓣႥᡙᔠዞࣩᤀᐹᡙᐹ

行统计ᖔ在印度血桐的 ୩୩኏ 核苷酸数量中ᖔ单ܦ双ܦ
ሕজ 讨论与结论
三ܦ四ܦ五和六核苷酸重复模体分别有԰ ऐԡԡ ԰ँ԰ܦ
ϟ ϟँँ ᎮԡᎮܦ࿗ሕ԰ ጢԡँܦ࿗ऐ ऐँԡܦϟԡ ࿗ँऐܦᎮ ԰ऐँ个ᖔ分别

占印度血桐总重复模体的 ᤃ԰঎ ԰࿗ᠮܦ ԰ᤃ঎ ᤃᤃᠮܦ 基因组大小是比较和进化基因组学的基础ᖔ
ँ঎ᤃϟᠮܦϟ঎ԡँᠮܦԡ঎԰ሕᠮܦԡ঎ϟᤃᠮଫ在中平树的 ୩୩኏ 核 基因组的杂合率和重复率是决定基因组组装质量
苷酸数量中ᖔ单ܦ双ܦ三ܦ四ܦ五和六核苷酸核苷酸 的关键ᖔ评估测序数据的杂合率与重复率ᖔ有助于

重复 模 体分别有 ሕ ԡሕᎮ ᤃϟሕܦϟ ሕ԰ϟ Ꭾጢ԰ܦጢ԰԰ ऐԡϟܦ 找到合适的组装策略ྉାᔽ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟँɯᤥ 对印度血
ᤃሕ ँᎮሕܦϟϟ ԰ጢ࿗ܦϟϟ Ꭾԡጢ个ᖔ分别占中平树总重复模 桐与中平树进行 ϟᎮ᥋ቝᔀʢ 分析后发现ᖔ印度血桐与

体的 ᤃϟ঎ ϟሕᠮܦ ԰ᤃ঎ ᤃԡᠮܦ ϟԡ঎ ጢ԰ᠮܦ ϟ঎ ԰ँᠮܦ ԡ঎ ԰ሕᠮܦ 中平树的预估基因组大小分别为 ँऐᎮ 和 ँ࿗ᤃ ᥘᖔ由
ԡ঎԰࿗ᠮᤥ 然后ᖔ进一步对印度血桐与中平树中每种 测定结果来看ᖔ印度血桐与中平树的基因组大小
୩୩኏ 重复模体按照序列组成进行细分ᖔ分别展示 相近ᖔ两种材料的基因组大小均比大戟科植物木

出两种材料中重复类型的部分数目ྉ表 ጢɯᤥ 薯的基因组 ᎮᎮԡ ᥘྉ୩ᔽቝᆍႿ ᔀᡷ ᑕ᤟঎ᖔ ԰ԡϟ԰ɯܦ蓖麻的基