Page 141 - 《广西植物》2021年第11期
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ϟϟ 期                李江莹等᧥ 印度血桐与中平树基因组调查及 ୩୩኏ 分子标记分析                                       ϟ ँ ԡ ሕ
                          表 ጇই 印度血桐与中平树中单ܓ双ܓ三ܓ四ܓ五ܓ六核苷酸重复模体部分统计结果
                       ఋᑕᤦ᤟ᔀ ጢজ ୩ᡷᑕᡷᔽ༁ᡷᔽዹ ʢᔀ༁ࣼ᤟ᡷ༁ ᆍ஦ ቝᆍႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀᖔ ʛᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀᖔ ᡷᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀᖔ ᡷᔀᡷʢᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀᖔ
                        ᡱᔀႿᡷᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ᑕႿʛ ၤᔀ଴ᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁ ᔽႿ ᤹ᐹዞᐹʗᐹႥ੖ᐹ ᔠႥʐᔠዞᐹ ᑕႿʛ ᤹ॹ ʐᓣႥᡙᔠዞࣩᤀᐹᡙᐹ
                      印度血桐的重复类型                     数目                 中平树的重复类型                     数目
                     ኏ᔀᡱᔀᑕᡷ ᡷᢃᡱᔀ ᆍ஦ ᤹ॹ ᔠႥʐᔠዞᐹ      શࣼቝᤦᔀʢ           ኏ᔀᡱᔀᑕᡷ ᡷᢃᡱᔀ ᆍ஦ ᤹ॹ ʐᓣႥᡙᔠዞࣩᤀᐹᡙᐹ  શࣼቝᤦᔀʢ
                       单核苷酸重复模体                                        单核苷酸重复模体
                        ᥘᆍႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ                                   ᥘᆍႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ
                         ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                                   ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                            ዶᣰ ఋ                  ԰ Ꭾᤃԡ ԡᎮϟ                 ዶᣰ ఋ                  ሕ ԡϟሕ ᤃԡϟ
                            ऊᣰ ᥈                   ࿗ԡ ԰԰ϟ                   ऊᣰ ᥈                   ԰࿗ ԡϟ԰
                       双核苷酸重复模体                                        双核苷酸重复模体
                         ᧕ᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ                                  ᧕ᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ
                         ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                                   ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                           ዶఋ ᣰ ዶఋ                 ँऐԡ ँᎮऐ                 ዶఋ ᣰ ዶఋ                ϟ ԡऐ࿗ ጢϟϟ
                           ዶ᥈ ᣰ ऊఋ                 ϟԡँ ࿗ऐऐ                 ዶऊ ᣰ ᥈ఋ                 ϟϟँ Ꭾ԰ϟ
                           ዶऊ ᣰ ᥈ఋ                 ϟԡऐ ऐँሕ                 ዶ᥈ ᣰ ऊఋ                 ϟϟᎮ ԰ϟँ
                           ऊ᥈ ᣰ ऊ᥈                  ሕ࿗ऐ                    ऊ᥈ ᣰ ऊ᥈                  ሕԡϟ
                       三核苷酸重复模体                                        三核苷酸重复模体
                    ఋᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                     ఋᔽႿᆍႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                          ዶዶఋ ᣰ ዶఋఋ                ԰ጢ࿗ ጢ԰ሕ                ዶዶఋ ᣰ ዶఋఋ                ԰ँᎮ Ꭾँϟ
                          ዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋ                ऐँ ᎮᎮᎮ                 ዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋ                ϟԡጢ ऐԡँ
                          ዶఋऊ ᣰ ዶఋ᥈                ሕሕ Ꭾऐϟ                 ዶఋऊ ᣰ ዶఋ᥈                ࿗Ꭾ Ꭾሕϟ
                          ዶዶऊ ᣰ ᥈ఋఋ                ϟँ ϟ࿗԰                 ዶዶऊ ᣰ ᥈ఋఋ                ԰ጢ ԰ሕᎮ
                       四核苷酸重复模体                                        四核苷酸重复模体
                    ఋᔀᡷʢᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                   ఋᔀᡷʢᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                         ዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋ               ԰ँ ԰ሕϟ                ዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋ               ሕᤃ ऐሕԡ
                         ዶዶఋఋ ᣰ ዶዶఋఋ               ऐᎮᎮጢ                  ዶዶఋఋ ᣰ ዶዶఋఋ               ϟ԰ ԰ሕ࿗
                         ዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋ               ࿗ጢጢᎮ                  ዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋ                ጢ԰԰ϟ
                         ዶऊዶఋ ᣰ ዶఋ᥈ఋ               ሕϟᎮँ                  ዶऊዶఋ ᣰ ዶఋ᥈ఋ                ࿗ϟᤃᎮ
                       五核苷酸重复模体                                        五核苷酸重复模体
                    ۪ᔀႿᡷᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                   ۪ᔀႿᡷᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                        ዶዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋఋ              ࿗ϟᤃ࿗                 ዶዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋఋ               ࿗ԡँ࿗
                        ዶዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋఋ              ԰ँሕᎮ                 ዶዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋఋ               ԰԰ँऐ
                        ዶዶዶఋఋ ᣰ ዶዶఋఋఋ               ࿗ऐ԰                 ዶዶఋዶఋ ᣰ ዶఋዶఋఋ               ϟ԰ጢँ
                        ዶዶఋዶఋ ᣰ ዶఋዶఋఋ               ࿗Ꭾ԰                 ዶዶዶఋఋ ᣰ ዶዶఋఋఋ               ጢऐ࿗
                       六核苷酸重复模体                                        六核苷酸重复模体
                    ̀ᔀ଴ᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁                    ̀ᔀ଴ᑕႿࣼዹ᤟ᔀᆍᡷᔽʛᔀ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ቝᆍᡷᔽ஦༁
                       ዶዶዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋఋఋ             ϟᤃँऐ                ዶዶዶዶዶఋ ᣰ ዶఋఋఋఋఋ              ϟँϟᤃ
                       ዶዶዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋఋఋ             ϟϟϟ࿗                ዶዶዶዶዶ᥈ ᣰ ऊఋఋఋఋఋ              ϟ࿗ँᎮ
                       ዶዶఋ᥈ዶఋ ᣰ ዶఋऊዶఋఋ              ሕ԰ँ                ዶዶఋዶ᥈ఋ ᣰ ዶऊఋዶఋఋ              ϟԡँሕ
                       ዶऊዶఋዶఋ ᣰ ዶఋዶఋ᥈ఋ              ሕ԰ऐ                ዶዶऊዶዶఋ ᣰ ዶఋఋ᥈ఋఋ              ऐጢጢ


            此ᖔ使用 ۼ᥈୩ 策略对印度血桐与中平树的基因组                           种材料的 ୩୩኏ 分子标记具有显著的碱基偏好性ᖔ
            分析有一定的风险和难度ᖔ建议后续的研究采用                              其单核苷酸重复模体中 ዶᣰ ఋ 含量均高于 ऊᣰ ᥈ 含
            二代测序ྉ ᧧᤟᤟ࣼቝᔽႿᑕɯ 和三代测序ྉ۪ᑕዹାᔽᆍɯ 技术相                  量ଫ两种材料中双核苷酸重复模体中含量最高均
            结合的策略ᖔ对印度血桐与中平树基因组进行测                              为 ዶఋ ᣰ ዶఋᖔ含量最低为 ऊ᥈ ᣰ ऊ᥈ᖔ这可能是甲基化的
            序和组装ᖔ此外ᖔ利用 ̀ᔽ᥋ऊ 技术达到染色体水平                          ऊ 残基变为 ఋᖔ使得两种核苷酸重复的差异较大
            的组装ᖔ多种方法互补ᖔ以期获得两种材料的高质                             ྉ周佳煜等ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ 有研究认为基因组中低级重

            量全基因组图谱ᤥ                                           复单元较多则表示该物种进化水平较高ᖔ而高级
                 ୩୩኏ 分子标记具有易操作ܦ多态性高ܦ成本低ܦ                       重复单元比例高的物种其进化时间短或变异频率
            数量丰富等优点ᤥ 本研究基于印度血桐与中平树                             低ྉ于福来等ᖔ԰ԡϟँɯᤥ 因此ᖔ在基因组调查测序的
            基因组调查数据进行 ୩୩኏ 分析发现ᖔ印度血桐中                           基础上规模化开发与筛选 ୩୩኏ 分子标记ᖔ为进一
                                                               步运用 ୩୩኏ 标记在物种遗传图谱的构建和遗传多
            平均 ԰ ԰ጢϟ ᤦᡱ 出现 ϟ 个 ୩୩኏ᖔ中平树中平均 ԰ ሕ࿗ऐ
            ᤦᡱ 出现 ϟ 个 ୩୩኏ᖔ含丰富的重复类型ᖔ结果显示两                       样性分析以及 ͐ఋᓂ 定位等方面的研究提供参考ᤥ
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