Page 14 - 《广西植物》2021年第12期
P. 14

ϟ ँ ጢ ऐ                                广জ 西জ 植জ 物                                         ࿗ϟ 卷
            关系进行预测ᤥ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ 可受到 ቝᔽ኏԰԰Ꭾጢ஦ 的裂                  个内含子ᖔ其中含有 ϟܦ԰ܦሕ 个内含子的基因数目分别
            解抑制调控ᖔ受到 ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕၤܦቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᔽܦቝᔽ኏԰ᤃᎮሕҴ                为 ࿗ܦሕ 和 ԰ᖔ内含子相位类型ྉᔽႿᡷʢᆍႿ ᡱၤᑕ༁ᔀɯ多样ྉ图
            的转 录抑制调控ᖔ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ԰ 可受到 ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕၤܦ                 ϟ᧥ାɯᤥ 使用 ᥘጶᥘጶ 软件分析发现菠萝 ۪̀ఋϟ 蛋白含
            ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᔽܦቝᔽ኏԰ᤃᎮሕҴ 和 ቝᔽ኏ሕँँʛ 的转录抑制调                 有 ϟԡ 个保守的氨基酸基序ᖔ基序 ϟ 含有保守的 ۪̀ఋϟ
            控ᖔ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ँ 可受到 ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᑕܦ ቝᔽ኏ጢ԰ऐᑕܦ               蛋白标签 ᥈᥈᧕ɟ۪ᓂ୩ዶఋ᧧଴୩ጶᖔ存在于 ँ 个菠萝 ۪̀ఋϟ
            ቝᔽ኏ጢ԰ऐᤦ 的裂解抑制调控ྉ表 ԰ɯᤥ                              蛋白中ᤥ 基序 ϟጲᎮ 编码跨膜功能域ᤥ ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎࿗ 缺
            ԣॹᇺ 基因结构和氨基酸基序分析                                   少基序 ᤃᖔ其跨膜功能域相对较少ᖔዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ጢ 缺少基
                 利用 ᥘጶ᥈ዶ Ꭾ঎ԡ 构建聚类树ᖔ发现菠萝 ۪̀ఋϟ                   序 ऐ 和基序 ँᖔዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ऐ 和 ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ँ 缺少基序 ϟԡᖔ
            主 要分为三个聚 类 组ᖔ 其中 ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ऐ 和                      基序 ऐጲϟԡ 功能未知ྉ图 ϟ᧥ऊᖔ ᧕ɯᤥ
            ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ँ 聚在一 组ᖔዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ᤃ 和 ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ Ꭾ            ԣॹ྽ 聚类分析
            聚在一组ᖔ 其他 ጢ 个菠萝 ۪̀ఋ 蛋白聚在一组 ྉ 图                          为了解植物 ۪̀ఋϟ 家族的聚类及进化ᖔ使用拟
            ϟ᧥ዶɯᤥ 基因结构分析显示ᖔዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ 基因含有 ϟጲሕ                    南芥ܦ水稻ܦ玉米ܦ大豆ܦ杨树和菠萝的 ۪̀ఋϟ 全长蛋


                                    表 ԣই ቂᔠቴટዛ໧ 及其调控靶基因 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϓ 互作预测分析
                       ఋᑕᤦ᤟ᔀ ԰জ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᔽႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽ׹ᔀ ᡱʢᔀʛᔽዹᡷᔽᆍႿ ᤦᔀᡷऔᔀᔀႿ ቝᔽ኏શዶ༁ ᑕႿʛ ᡷၤᔀᔽʢ ᡷᑕʢ੫ᔀᡷᔀʛ ੫ᔀႿᔀ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ
                          靶基因     期望值     非配对能                       靶位点配对                        表达抑制模式
                ቝᔽ኏શዶ
                        ఋᑕʢ੫ᔀᡷ ੫ᔀႿᔀ  ጶ଴ᡱᔀዹᡷ  В۪ጶ                      ዶ᤟ᔽ੫ႿቝᔀႿᡷ                     ᧧ႿၤᔽᤦᔽᡷᔽᆍႿ
              ቝᔽ኏԰԰Ꭾጢ஦᥋ሕᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ  ሕ    ϟጢ঎ᤃ԰ጢ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ     ዶऊВऊВ᥈ВዶዶऊऊВऊऊВВВВ᥈ВВ        ϟ     裂解抑制
                                                                     ঎᧥ ᧥ ᧥঎᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥঎᧥᧥᧥঎᧥          ऊ᤟ᔀᑕ׹ᑕ੫ᔀ
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢ࿗ऐ  ᥈ऊ᥈᥈Вऊ᥈ВВ᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈ዶዶऊ᥈ዶ       ϟ ጢᤃऐ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕၤ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ  ሕ    ϟ԰঎ሕጢԡ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                     ᧥᧥঎᧥᧥᧥ ᧥ ᧥᧥᧥᧥᧥঎᧥᧥᧥᧥            ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢጢᤃ  В᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈ዶዶऊ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈᥈ዶ᥈ዶ       ϟ ጢᎮᤃ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᔽ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ  ሕ    ϟ԰঎ሕጢԡ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                     ᧥᧥঎᧥᧥᧥ ᧥ ᧥᧥᧥᧥᧥঎᧥᧥᧥᧥            ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢጢᤃ  В᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈ዶዶऊ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈᥈ዶ᥈ዶ       ϟ ጢᎮᤃ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕҴ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ  ሕ    ϟ԰঎ሕጢԡ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                                                    ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                                     ᧥᧥঎᧥᧥᧥ ᧥ ᧥᧥᧥᧥᧥঎᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢጢᤃ  В᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈ዶዶऊ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈᥈ዶ᥈ዶ       ϟ ጢᎮᤃ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᑕ᥋ሕᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹँ  ሕ঎ጢ  ϟ԰঎ሕऐᎮ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ     ᥈ऊ᥈᥈ዶ᥈ዶዶ᥈᥈ዶ᥈ऊዶ᥈᥈ዶ᥈ऊ᥈В        ϟ     裂解抑制
                                                                                                    ऊ᤟ᔀᑕ׹ᑕ੫ᔀ
                                                                     ᧥঎᧥᧥ ᧥᧥঎᧥᧥᧥ ᧥᧥᧥঎᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ϟጢँ   ᥈ВऊВВऊऊВऊВВऊ᥈ऊऊऊВВ᥈ऊዶ      ϟ ϟᎮँ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕၤ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ԰  ሕ঎ጢ  ϟϟ঎ϟጢऐ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                                                    ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                                     ঎᧥ ᧥᧥᧥ ᧥᧥঎ ᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ऐϟ     ᥈В᥈ऊዶ᥈ዶዶ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈ዶዶዶ᥈ዶ᥈ዶ       ϟԡϟ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕᔽ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ԰  ሕ঎ጢ  ϟϟ঎ϟጢऐ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                                                    ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                                     ঎᧥ ᧥᧥᧥ ᧥᧥঎ ᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ऐϟ     ᥈В᥈ऊዶ᥈ዶዶ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈ዶዶዶ᥈ዶ᥈ዶ       ϟԡϟ
              ቝᔽ኏԰ᤃᎮሕҴ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ԰  ሕ঎ጢ  ϟϟ঎ϟጢऐ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ      ᥈᥈ऊВВऊВऊऊВВऊВऊВВВऊВऊВ       ϟ     转录抑制
                                                                                                    ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                                     ঎᧥ ᧥᧥᧥ ᧥᧥঎ ᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ऐϟ     ᥈В᥈ऊዶ᥈ዶዶ᥈ዶ᥈ዶዶ᥈ዶዶዶ᥈ዶ᥈ዶ       ϟԡϟ
              ቝᔽ኏ሕँँʛ᥋ጢᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ԰  ሕ঎ጢ   ԰ሕ঎ऐ࿗ϟ  ቝᔽ኏શዶ  ԰԰     ऊ᥈ዶऊ᥈᥈ВВВऊऊВऊВВВዶ᥈ऊ᥈᥈᥈       ϟ     转录抑制
                                                                                                    ఋʢᑕႿ༁᤟ᑕᡷᔽᆍႿ
                                                                     ᧥঎᧥঎᧥᧥᧥᧥঎ ᧥᧥঎᧥᧥᧥᧥঎᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ᤃጢሕ  ᥈᥈ዶ᥈Вऊ᥈ዶዶ᥈᥈᥈ዶዶዶ᥈Вऊ᥈ऊВऊ      ϟ ᤃᎮ࿗
              ቝᔽ኏ጢ԰ऐᑕ᥋ሕᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹँ  ሕ঎ጢ   ऐ঎ϟᤃԡ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ       ऊऊዶऊऊВВऊВऊऊ᥈ВВऊ᥈В᥈Вऊऊ       ϟ     裂解抑制
                                                                                                    ऊ᤟ᔀᑕ׹ᑕ੫ᔀ
                                                                    ᧥᧥ ᧥᧥᧥঎᧥᧥ ᧥᧥᧥ ᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢጢጢ  ᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈᥈ዶዶ᥈ऊዶऊ᥈ऊዶऊዶ᥈᥈       ϟ ጢᎮጢ
              ቝᔽ኏ጢ԰ऐᤦ᥋ሕᡱ  ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹँ  ሕ঎ጢ   ऐ঎ϟᤃԡ  ቝᔽ኏શዶ  ԰ϟ       ऊऊዶऊऊВВऊВऊऊ᥈ВВऊ᥈В᥈Вऊऊ       ϟ     裂解抑制
                                                                                                    ऊ᤟ᔀᑕ׹ᑕ੫ᔀ
                                                                    ᧥᧥ ᧥᧥᧥঎᧥᧥ ᧥᧥᧥ ᧥᧥᧥᧥᧥᧥᧥
                                                  ఋᑕʢ੫ᔀᡷ  ϟ ጢጢጢ  ᥈᥈ዶ᥈᥈ዶ᥈᥈ዶዶ᥈ऊዶऊ᥈ऊዶऊዶ᥈᥈       ϟ ጢᎮጢ
            জ 注᧥᧥ 表示完全匹配ଫ ॹ 表示不完全匹配ᤥ
            জ શᆍᡷᔀ᧥ ᧥ ቝᔀᑕႿ༁ ዹᆍቝᡱ᤟ᔀᡷᔀ ቝᑕᡷዹၤᔽႿ੫ଫ ॹ ቝᔀᑕႿ༁ ᔽႿዹᆍቝᡱ᤟ᔀᡷᔀ ቝᑕᡷዹၤᔽႿ੫঎
   9   10   11   12   13   14   15   16   17   18   19