Page 15 - 《广西植物》2021年第12期

ϟ԰ 期 韩利红等᧥ 菠萝磷转运蛋白 ϟ 家族基因鉴定及特征分析 ϟ ँ ጢ ँ

图 ϟজ 菠萝 ۪̀ఋϟ 家族聚类ྉዛɯᖔ 基因结构ྉଧɯᖔ 氨基酸保守基序ྉࣷᖔ ᦵɯ分析
èᔽ੫঎ ϟজ ۪ၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ᡷʢᔀᔀ ྉዛɯᖔ ੫ᔀႿᔀ ༁ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ྉଧɯᖔ ᑕႿʛ ᑕቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ༁ ዹᆍႿ༁ᔀʢ׹ᔀʛ ቝᆍᡷᔽ஦༁ ྉࣷᖔ ᦵɯ ᆍ஦ ᡱᔽႿᔀᑕᡱᡱ᤟ᔀ ۪̀ఋϟ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ

白序列ᖔ利用 ᥘጶ᥈ዶ Ꭾ঎ԡ 软件应用最大似然法和邻 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ሕܦ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ࿗ܦ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ᤃܦ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ Ꭾ 和
接法构建系统发育树ᖔ两种进化树结果相似ᖔ文中 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ऐ 的启 动 子 中ᖔ ᨃ୩ጶ԰኏ᨃᨃఋશᨃ᧕Вᓂጶ
选择最大似然法的结果进行展示ྉ 图 ԰ɯᤥ 结果显 ྉऊఋऊఋఋɯ 存在于 ँ 个 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ 基因启动子中ᤥ 除
示ᖔ植物 ۪̀ఋϟ 蛋白共归为 ሕ 组ᖔ分别为双子叶植 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹጢ 外ᖔዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ 基因均含有至少 ϟ 个 ۼ᥋ᤦᆍ଴ᤥ
物组ܦ单子叶植物组和单双子叶植物混合组ᤥ 菠 此外ᖔ 菠萝 ۪̀ఋϟ 家族基因启动子中还存在
萝 ۪̀ఋϟ 主要分布在单子叶植物组中的亚组 ᤦܦዹ ዶା኏ጶᓂዶఋጶ኏᧕ϟ ྉ ዶऊ᥈ఋ᥈ ɯܦ ऊዶऊ᥈ఋ᥈ᥘᨃఋ᧧è
和 ᔀ 以及单双子叶混合组的亚组 ᤦ 和 ዹ 中ᤥ 为了 ྉ ऊዶऊ᥈ఋ᥈ ɯܦ ᓂఋ኏ጶϟ̀჆ାᓂఋ࿗ँ ྉ ऊऊ᥈ዶዶዶ ɯܦ
解菠萝 ۪̀ఋϟ 蛋白的起源和进化ᖔ使用 ऊᔽʢዹᆍ᤟ᔀᡷᡷᆍ ጶᓂ኏ጶऊᨃ኏ጶ۪ऊ኏۪ϟྉ ۼ᥋ᤦᆍ଴ᖔఋఋ᥈ዶऊऊɯ 等胁迫响应
软件对拟南芥ܦ水稻和菠萝 ۪̀ఋϟ 蛋白序列相似性 和激素响应相关元件ᤥ
进行分析ᖔ图 ሕ 结果显示ᖔ绝大多数菠萝 ۪̀ఋϟ 蛋 ԣॹᣤ 菠萝 ̵ۗ௴ϓ 家族基因的组织表达分析
白与水稻 ۪̀ఋϟ 蛋白相似度较高ᖔ这些蛋白可能具 为了解菠萝 ۪̀ఋϟ 家族基因在植物不同组织
有 共同的起源ᖔ 如 ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ϟᣰ ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ԰ 与 器官中的表达ᖔ从菠萝基因组数据库中下载并分

ᨃ༁۪̀ఋϟ঎ ᤃᖔ ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ሕᣰ ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ ጢ 与 ᨃ༁۪̀ఋϟ঎ ԰ᖔ 析 ۪̀ఋϟ 家族基因在根ܦ叶ܦ花和果实等器官的表
ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ऐᣰ ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ँ 与 ᨃ༁۪̀ఋϟ঎ϟԡᖔዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎࿗ 与 达 ྉ 图 ጢɯᤥ 发现 除 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ᤃ 外ᖔ 其余 ऐ 个
ᨃ༁۪̀ఋϟ঎࿗ᖔዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎ᤃ 与 ᨃ༁۪̀ఋϟ঎ϟϟ 具有较高的相似 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ 基 因 在不同组织中均有表达ᤥ 其中ᖔ

性ᖔ而 ዶዹᆍ۪̀ఋϟ঎Ꭾ 与 ዶᡷ۪̀ఋϟ঎ሕ 具有较高的相似性ᤥ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ࿗ 和 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹँ 在 ࿗ 类组织中均有表达ᖔ
ԣॹጇ 菠萝 ̵ۗ௴ϓ 家族基因启动子顺式作用元件分析 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹϟ 在除部分叶片节段外的组织中有表达ᖔ

使用 ۪ᓂዶऊጶ 软件对 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟ 基因上游 ϟ঎ጢ Ҵᤦ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹᎮ 和 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹऐ 主要在叶组织中有表达ᖔ
序列顺式作用元件进行分析ྉ图 ࿗ɯᖔ结果发现 ϟऐԡ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹᎮ 在花组织中有表达ᖔዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ԰ 仅在花
个顺式作用元件ᖔ这些元件参与植物生长发育ܦ响 组织中有较高表达ᖔዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹሕ 和 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹጢ 主要

应激 素和胁迫信号 等 生 物 过 程ᤥ ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹ ϟܦ 在花ܦ叶部分节段以及根和果实成熟不同阶段的
ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹጢܦዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹᤃ 和 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹᎮ 的启动子中存 组织中有表达ᤥ 这些特征表明ᖔ菠萝 ۪̀ఋϟ 家族基

在 ԰ጲ࿗ 个 ۪ϟା୩ 元件 ྉ ۪̀኏ϟ᥋ᤦᔽႿʛᔽႿ੫ ༁ᔽᡷᔀᖔ 因具有组织表达特异性ᖔ且存在功能冗余ᖔ不同的
᥈શዶఋዶఋશऊ ɯᤥ ᨃ୩ጶϟ኏ᨃᨃఋશᨃ᧕Вᓂጶ ྉ ᆍʢ੫ᑕႿ᥋༁ᡱᔀዹᔽ஦ᔽዹ ̵ۗ௴ϟ 基因可能在不同的组织或发育阶段发挥
ᔀ᤟ᔀቝᔀႿᡷ༁ ᆍ஦ ʢᆍᆍᡷ Ⴟᆍʛࣼ᤟ᔀ༁ᖔዶዶዶ᥈ዶఋɯ存在于 ዛዞᅳ̵ۗ௴ϟॹϟܦ 作用ᤥ