Page 23 - 《广西植物》2021年第12期
P. 23
ϟ 期 章妮等᧥ 毛竹 ዛۗᣏ 基因系统进化与表达分析 ϟ ँ ᤃ Ꭾ
图 ϟজ ۗᓣዛۗᣏ 基因结构
èᔽ੫ ϟজ ୩ᡷʢࣼዹᡷࣼʢᔀ ᆍ ۗᓣዛۗᣏ ੫ᔀႿᔀ
中 ϟ࿗ 个 ۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 成员的等电点小于 Ꭾᖔ偏酸性ଫᤃ 个 这两 个基序为 ۗᓣዛۗᣏ 家族的高度保守结构ᤥ
۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 成员的等电点大于 Ꭾᖔ偏碱性ଫ۪ᔀዶ۪ᣮϟᤃ 等 ۗᓣዛۗᣏϟ࿗ܦۗᓣዛۗᣏϟᤃܦۗᓣዛۗᣏԡܦۗᓣዛۗᣏϟ 的保守基
电点为 Ꭾԡሕᖔ偏中性ᤥ 不稳定指数在 ϟँᎮᤃ ጲ ᤃᎮϟᎮ 序相差较大但仍聚为一支ᖔ可能是由于这四个成
之间ᖔ其中有 ᤃ 个 ۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 蛋白为稳定蛋白ᖔ其余 ϟጢ 员均存在跨膜结构域ᖔ但 ۗᓣዛۗᣏϟऐ 同样存在跨膜
个成员均为不稳定蛋白ᤥ 亲水性平均值为ͱԡᎮጢᤃ ጲ 结构域但未能聚在一起ᖔ 可能是由于缺少 ቝᆍᡷᔽ
ͱԡሕऐᖔ均小于 ԡᖔ۪ᔀዶ۪ᣮ 家族成员均为疏水蛋白ᤥ ϟԡᖔ表明存在 ቝᆍᡷᔽ ϟԡ 的 ዶ۪ᣮ 蛋白可能具有功能
磷酸化位点个数在 ऐጲᤃᎮ 之间ᤥ ఋᥘ̀ᥘᥘ 检测毛竹 特异 性ᤥ 且 ቝᆍᡷᔽ ϟԡ 存在跨膜结构域ᖔ 表明
۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 跨膜结构域ᖔ有五个 ۪ᔀዶ۪ᣮ 家族成员均含 ۗᓣዛۗᣏϟऐ 的跨膜结构与其余存在跨膜结构的毛竹
有 ϟ 个跨膜结构域ᖔ 分别为 ۪ᔀዶ۪ᣮϟ࿗ܦ ۪ᔀዶ۪ᣮϟᤃܦ ۗᓣዛۗᣏ 跨膜序列存在差异ᤥ
۪ᔀዶ۪ᣮϟऐܦ۪ᔀዶ۪ᣮԡܦ۪ᔀዶ۪ᣮϟᤥ ԣॹᇺ 毛竹 ۗᓣዛۗᣏ 与其他植物系统进化树及同源
ԣॹԣ 毛竹 ۗᓣዛۗᣏ 基因家族成员基因结构及保守基 关系分析
序分析 为进一步明确不同物种间 ዛۗᣏ 基因的亲缘关
如图 ϟ 所示ᖔ毛竹 ϟ 条 ۗᓣዛۗᣏ 内含子ͱ外显 系ᖔ基于来自 Ꭾ 种植物的 ऐሕ 条序列构建植物 ዛۗᣏ
子结构存在较大差异ᖔ内含子数目在 ϟጲϟ࿗ 间不 系统进化树ྉ 图 ሕɯᖔ拟南芥ྉ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓᔠ ᡙ၊ᐹᤀᔠᐹႥᐹɯܦ
等ᖔ多数基因含有 Ꭾጲऐ 个内含子ᖔ其中 ۗᓣዛۗᣏ࿗ 基 水稻ྉ ᧣ʗᡥऊᐹ ᐹᡙᔠצᐹɯܦ陆地棉ྉ ᤩᅳᡥᡓᔠࣩቂ ၊ᔠʗࣩᡙࣩቂɯܦ
因长度与其余 ԡ 个成员差异较大ᖔ存在一段约 ϟᎮ 毛果杨ྉۗᅳᡓࣩᤀࣩ ᡙʗᔠዞ၊ᅳዞᐹʗᡓᐹɯܦ毛竹均为绿色种子植
Ҵᤦ 的非编码序列ᖔ可能存在基因的大片段复制ᤥ 物ᖔ莱茵衣藻ྉࣷ၊ᤀᐹቂᡥʐᅳቂᅳႥᐹ ʗᓣᔠႥ၊ᐹʗʐᡙᔠᔠɯ为一种单
通过 ᥘጶᥘጶ 软件对 ۗᓣዛۗᣏ 中的保守基序进行搜 细胞真核绿藻ᖔ小立碗藓ྉ ۗ၊ᡥዞᅳቂᔠᡙʗᓣᤀᤀᐹ ᡓᐹᡙᓣႥɯ 则
索ᖔ以进一步了解基序组成的多样性和演化关系ᖔ 为葫芦藓科的一 类 苔 藓 植 物ᤥ 结果显示ᖔऐሕ 条
共发现 ϟԡ 个保守基序ᤥ ۗᓣዛۗᣏ 家族成员所含基 ዶ۪ᣮ 蛋白序列共分为 ᤃ 个亚家族ᖔ毛竹 ۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 家
序数量ྉ 图 ɯ 在 ጲᎮ 之间ᖔ所含基序数较多 的 族中有 ϟጢ 个成员均分别与水稻 ᨃ༁ዶ۪ᣮ༁ 家族的 ऐ
ۗᓣዛۗᣏ 基因家族成员 શ 端的首个基序均为 ቝᆍᡷᔽ 个成员在第ሙܦ第᤻ܦ第ᤣ亚家族聚在一起ᖔ可能
࿗ᤥ ۗᓣዛۗᣏጢ 的 ቝᆍᡷᔽ 位置较远可能是由于该蛋白定 是由于毛竹与水稻均为单子叶植物ᖔ且同属禾本
位于内质网ᖔ属分泌蛋白ᤥ 具有 ቝᆍᡷᔽ Ꭾ 的蛋白均 科ᖔ两物种间有着高度同源性ᤥ۪ᔀዶ۪ᣮ༁ 另 ᤃ 个成
为碱 性 蛋 白ᖔ 具有 ቝᆍᡷᔽ ऐ 的蛋白均为 线 粒 体 员分别处于第ᎏܦ第ι亚家族ᤥ 第֒亚家族的成
ۗᓣዛۗᣏଫϟᎮ 个 ۗᓣዛۗᣏ 基因家族成员均有 ቝᆍᡷᔽ ጢᖔ 员仅有陆地棉这一物种ᖔ表明这几个成员可能存
ቝᆍᡷᔽ ϟ 在 ϟጢ 个 ۗᓣዛۗᣏ 家族成员中均有出现ᖔ表明 在种特异性ᤥ 结构域分析显示ᖔ 所有序列均含有
