Page 64 - 《广西植物》2021年第4期
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郑威ᖔ 孙文文ᖔ 董学明ᖔ 等 龙眼 ᦵᤀۗɔ 基因在根和叶中的表达及其生物信息学分析 ЏȮ 广西植物ᖔԡϟᖔ࿗ϟྉ࿗ɯ᧥
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龙眼 ᦵᤀۗɔ 基因在根和叶中的表达及其生物信息学分析
郑জ 威 ᕷ 孙文文 ᕷ 董学明 ᕷ 张秋颖 ᕷ 于雪飞 ᕷ 陈জ 宁 ϟ
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摘জ 要ᧅ 为研究八氢番茄红素合成酶ྉᡱၤᢃᡷᆍᔀႿᔀ ༁ᢃႿᡷၤᑕ༁ᔀɯ基因在龙眼类胡萝卜素合成途径中的作用机制ᖔ该
文从龙眼转录组数据中筛选获得一个 ۗɔ 基因ᖔ命名为 ᦵᤀۗɔᖔ采用生物信息学方法对龙眼 ۪୩ɟ 蛋白的一
级结构ܦ理化性质ܦ信号肽ܦ跨膜结构ܦ亚细胞定位ܦ亲疏水性ܦ蛋白质二级结构ܦ蛋白质三级结构ܦ卷曲螺旋ܦ
蛋白质结合位点ܦ系统进化树ܦ蛋白质互作等进行分析和预测ᖔ并同时运用实时荧光定量 ۪ऊྉఋ᥋ी۪ऊɯ技
术对 ᦵᤀۗɔ 基因在龙眼根和叶中的差异表达进行分析ᤥ 结果表明᧥龙眼 ᦵᤀۗɔ 基因长度为ϟ ᤃԡ ᤦᡱᖔ编码
࿗ԡ 个氨基酸ଫ生物信息学预测 ᧕۪୩ɟ 蛋白具有 ᧧༁ᆍᡱʢᔀႿᆍᔽʛ ାᔽᆍ༁ᢃႿ ऊϟ 超家族结构ᖔ含有信号肽ᖔ为分泌性蛋
白ᖔ无跨膜结构ᖔ是一种可溶性亲水蛋白ᖔ定位于膜外ଫ᧕۪୩ɟ 蛋白的二级结构主要由 ም᥋螺旋和无规则卷曲
组成ᖔ具有卷曲螺旋ᤥ ᑕቝᑕዹၤᑕႿʛʢᑕႿ 评估结果表明应用 ୩ۼ᧧୩୩᥋ᥘᨃ᧕ጶᓂ 构建的蛋白质三级结构模型可靠ᖔ其
配体结合位点为 ሕ࿗࿗۪ၤᔀ 和 ሕ࿗Ꭾᓂᢃ༁ᤥ ఋ᥋ी۪ऊ 分析结果表明 ᦵᤀۗɔ 基因在龙眼根和叶中均有表达ᖔ叶中表
达量高于其在根中的表达量ᤥ 该研究结果为下一步采用遗传学方法提高龙眼中类胡萝卜素的含量奠定理
论基础ᤥ
关键词ᧅ 龙眼ᖔ ᦵᤀۗɔ 基因ᖔ 生物信息学ᖔ 基因表达
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡϟɯԡ࿗᥋ԡጢ࿗ᤃ᥋ϟሕ
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收稿日期ᧅ ԡϟँͱԡँͱԡँ
基金项目ᧅ 黑龙江省自然基金ྉ̀ԡϟᎮԡԡϟɯଫ黑龙江省普通本科高等学校青年创新人才培养计划ྉВશ۪ɟ୩ऊఋ᥋ԡϟᎮϟԡɯଫ哈尔滨商
业大学青年科研项目 ྉ ϟᎮᣮશԡԡᎮɯଫ哈尔滨商业大学博士启动基金 ྉϟ࿗ᓂ᥈ԡᤃɯ ྉԡϟᤃା୩࿗ɯଫ哈尔滨商业大学研究生创新项目
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作者简介ᧅ 郑威ྉϟँऐሕͱɯᖔ博士研究生ᖔ研究方向为药用植物次生代谢产物合成ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯऔᔀᔽԡϟሕझၤᔀႿ੫݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
通信作者
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