Page 48 - 《广西植物》2022年第11期
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朱鹏锦ᖔ 宋奇琦ᖔ 谭秦亮ᖔ 等 甘蔗耐寒相关 ቝᔽશዶ 的生物信息学分析及其靶基因预测 ЏȮ 广西植物ᖔԡᖔ
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甘蔗耐寒相关 ቂᔠቴટዛ 的生物信息学分析及其靶基因预测
朱鹏锦ᕷ 宋奇琦ᕷ 谭秦亮ᕷ 程জ 琴ᕷ 李佳慧ᕷ 庞新华ᕷ 周全光ᕷ
吕জ 平ᕷ 欧克纬ᕷ 卢业飞ᕷ 农泽梅ᕷ 唐桓伟ᕷ 龙盛风 ᥍
ྉ 广西壮族自治区亚热带作物研究所ᖔ 南宁 ጢሕԡԡԡϟ ɯ
摘জ 要ᧅ 为了解不同基因型甘蔗ྉᐹዞዞ၊ᐹʗࣩቂ ᅳஏஏᔠዞᔠႥᐹʗࣩቂɯ响应低温胁迫的分子机制ᖔ该研究以低温胁迫 ࿗ቩ
处理 ࿗ ၤ 后的 ሕ 个不同耐寒性甘蔗品种的叶片为材料进行 ᧧ࣼቝᔽႿᑕ ̀ᔽ୩ᔀीఋᥘ ԡԡԡ 高通量测序ᖔ构建了 ϟऐ
个低温胁迫前后 ༁શዶ 文库ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ共获得分属于 ऐ࿗ 个家族的 ሕ 个已知 ቝᔽશዶ 及预测得到 ϟϟԡ
个新 ቝᔽશዶᖔ并在已知 ቝᔽશዶ 中筛选出 ϟԡԡ 个差异表达 ቝᔽશዶྉᤃϟ 个上调ᖔሕँ 个下调ɯᖔ新 ቝᔽશዶ 中筛选
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所获得的差异表达 ቝᔽશዶ 进行靶基因预测ᖔ得到ϟऐ࿗࿗个靶基因并进行 ᥈ᨃ 分析揭示其主要功能类别ᖔ即分
子功能ܦ细胞组分与生物过程ᤥྉሕɯ 为验证高通量测序数据的可靠性ᖔ筛选 ϟ࿗ 个 ቝᔽશዶ 及其靶基因进行
ीఋ᥋۪ऊ 验证ᖔ结果显示这些 ቝᔽશዶ 均被检测发现且大多表达结果与测序结果一致ᤥྉ࿗ɯ鉴定出部分差异
表达 ቝᔽશዶ 的靶基因ᖔ这些基因参与植物生长ܦ发育及低温胁迫反应ᤥ 综上认为ᖔ耐寒型甘蔗体内 ቝᔽશዶ
直接或间接作用靶基因实现表达调控相关代谢途径ᖔ对其重要农艺性状均起着关键的调控作用ᤥ
关键词ᧅ 甘蔗ᖔ 低温胁迫ᖔ 耐寒性ᖔቝᔽશዶᖔ 生物信息学
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗ྉԡɯϟϟ᥋ϟऐ࿗ԡ᥋ϟ࿗
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收稿日期ᧅ ԡϟͱԡऐͱሕԡ
基金项目ᧅ 广西自然科学基金ྉԡϟᎮ᥈ᣮશ୩èାዶϟँऐԡጢ࿗ɯଫ 广西创新驱动发展专项ྉ桂科 ዶዶϟᎮԡԡ࿗᥋ጢɯଫ 广西农业科学院基本科
研业务专项ྉ桂农科 ԡϟɟఋϟጢϟɯ Џ ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ શᑕᡷࣼʢᑕ ୩ዹᔽᔀႿዹᔀ èᆍࣼႿʛᑕᡷᔽᆍႿ ᆍ ᥈ࣼᑕႿ੫ᔽྉԡϟᎮ᥈ᣮશ୩èାዶϟँऐԡጢ࿗ɯଫ ୩ᡱᔀዹᔽᑕ ۪ʢᆍᢼᔀዹᡷ ᆍ
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第一作者ᧅ 朱鹏锦ྉϟँऐሕͱɯᖔ硕士ᖔ高级农艺师ᖔ主要从事作物生理生态学研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯझၤࣼᡱᔀႿ੫ᢼᔽႿԡ࿗݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
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通信作者ᧅ 龙盛风ᖔ副研究员ᖔ主要从事作物栽培育种研究ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽɯϟጢԡᎮᎮϟሕᤃጢԡԡ݀ ϟᤃሕዹᆍቝᤥ
