Page 43 - 《广西植物》2022年第11期
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ϟϟ 期 吴朝昕等᧥ 大粒香水稻叶绿体基因组特征分析 ϟ ऐ ሕ ጢ
表 ই 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 的重复序列 ሕԡԡሕϟᤃܦ᧣ॹ ቂᓣʗᔠʐᔠᅳႥᐹᤀᔠܦ᧣ॹ ʗࣩᔠஏᔠᡓᅳᅳႥɯ各为一类ᖔ其
ఋᑕᤦᔀ ࿗জ ዹᡱ᧕શዶ ʢᔀᡱᔀᑕᡷ ༁ᔀीࣼᔀႿዹᔀ ᆍ ᧕ᑕᔽᔽᑕႿ੫ 余 ϟԡ 种栽培稻为一类ᤥ 在栽培稻类群中ᖔ粳稻与
大小 籼稻分别处于不同进化分支ᤥ 并且ᖔ大粒香水稻
序号 类型 位置 区域
୩ᔽझᔀ
શᆍ ఋᢃᡱᔀ ۪ᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ ᓂᆍዹᑕᡷᔽᆍႿ 与粳稻 ఋʢᆍᡱᔽዹᑕ ȮᑕᡱᆍႿᔽዹᑕ 在同一分支ᖔ表明两者的
ྉᤦᡱɯ
进化关系比其他水稻品种近ྉ图 ɯᤥ
ϟ ጢ 正向 ጢᤃ ԡ࿗࿗ ᧧᥈୩ྉʢᤦዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
èᆍʢऔᑕʢʛ
ሕ ጢ 正向 ϟሕԡ ሕऐऐ ᧧᥈୩ྉႿʛၤଧ᥋ᡷʢႿᒦࣷዛዛɯ ሕজ 讨论与结论
èᆍʢऔᑕʢʛ
ሕ ሕ 正向 ጢጢ ँ࿗ᤃ ᧧᥈୩ྉʢᑕዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
èᆍʢऔᑕʢʛ 本研 究测得大 粒 香 ዹᡱ᧕શዶ 全长为 ϟሕ࿗ ጢᤃሕ
࿗ ࿗ ሕ 正向 ϟ ँϟᎮ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿᤩᤩࣷࣷ᥋ᡷʢႿ௴ᤩᤩІɯ ᤦᡱᖔ᥈ऊ 含量为 ሕँᠮᖔ ᓂ୩ऊ 为 ऐԡ ऐᤃ࿗ ᤦᡱᖔ ୩୩ऊ 为
èᆍʢऔᑕʢʛ
ϟ ሕ࿗Ꭾ ᤦᡱᖔ᧧ 为 ԡ ᤃᎮᤃ ᤦᡱᖔ并注释到 ϟँ 个基因ᖔ
ጢ ࿗ ᤃ 正向 ᤃሕ ϟ ᧧᥈୩ྉᡱᔀᡷዛ᥋ᡱᔀᡷᤩɯ
èᆍʢऔᑕʢʛ 与已报道的禾本科数据相符ྉ 李裕华等ᖔԡԡɯᤥ
ᤃ ሕ ऐ 正向 ጢᤃ ԡԡጢ ᧧᥈୩ྉʢᤦዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
前人通过比对不同禾本科植物 ዹᡱ᧕શዶ 序列表明ᖔ
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虽然叶绿体基因保守程度较高ᖔ但一些基因在进
Ꭾ ሕ ጢ 正向 ऐ࿗ ँጢ࿗ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿ̵ᤩІᤩ᥋ᡷʢႿႬᤩዛࣷɯ
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化过程中仍然出现退化缺失现象ྉ 唐萍等ᖔԡϟϟଫ
ऐ ሕ ԡ 正向 ऐᤃ ࿗ጢϟ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿ̵ᤩІᤩ᥋ᡷʢႿႬᤩዛࣷɯ
付涛等ᖔԡϟᤃɯᤥ 本研究将大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 与 ۼᑕႿ੫
èᆍʢऔᑕʢʛ
ँ ሕ ጢ 回文 ऐጢ ԡԡ࿗ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿ̵ᤩІᤩ᥋ᡷʢႿႬᤩዛࣷɯ 等ྉԡϟᤃɯ报道的热带粳稻叶绿体基因组进行比对
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
结果显示ᖔ虽然二者在细胞色素 ᤦᣰ 复合体相关基
ϟԡ ሕጢ 回文 ऐ࿗ ँጢ࿗ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿ̵ᤩІᤩ᥋ᡷʢႿႬᤩዛࣷɯ
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ 因ܦ光系统ሙܦ֒相关基因ܦ核糖体蛋白大和小亚
ϟϟ ሕԡ 回文 ϟऐ ँ࿗ᤃ ᧧ႿᡷʢᆍႿྉႿʛၤଧɯ 基相关基因ܦᡷશዶ 和未知功能基因等基因差异较
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
少ᖔ但在大粒香叶绿体基因中不存在 ᤀ၊ᤇዶ 基因ᤥ
ϟ ࿗ᤃ 回文 ᤃሕ ϟ ᧧᥈୩ྉᡱᔀᡷዛ᥋ᡱᔀᡷᤩɯ
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ ᤀ၊ᤇዶ 基因是和光合作用过程中光系统֒有关的基
ϟሕ ሕԡ 回文 ऐᤃ ࿗ጢϟ ᧧᥈୩ྉᡷʢႿ̵ᤩІᤩ᥋ᡷʢႿႬᤩዛࣷɯ 因ᖔ在热带粳稻中存在 ᤀ၊ᤇዶ 基因ᖔ并且在喜好温暖
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
的禾本科植物毛竹中同样也存在 ᤀ၊ᤇዶ 基因ྉɟᑕᆍ
ϟ࿗ ሕ 回文 ጢጢ ँ࿗ᤃ ᧧᥈୩ྉʢᑕዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
ᔀᡷ ᑕᖔ ԡϟᤃɯᖔ这可能是热带粳稻为适应热带光温
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
ϟጢ ሕऐ 回文 ጢᤃ ԡԡጢ ᧧᥈୩ྉʢᑕዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
生长环境中逐渐进化而得ᤥ
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
୩୩ 位点可被用于辅助育种和遗传连锁作图
ϟᤃ ጢ 回文 ጢᤃ ԡ࿗࿗ ᧧᥈୩ྉʢᑕዹᒦ᥋ᑕዹዹᦵɯ
等方面的研究ᖔ而 ዹᡱ᧕શዶ 具有序列保守ܦ结构稳
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
ϟᎮ ϟᎮ 回文 ԡ ᧧ ᥈ ୩ ྉ ʢ ᡱ ༁ ϟ ँ ᥋ ᡱ ༁ ᤦ ᣞɯ 定ܦ易测序等优点ᖔ有助于解决类群间的遗传多样
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
ϟऐ ሕԡ 回文 ᤃᤃ ࿗ሕ ᥈ऊ ྉʢᡱ༁ϟऐɯ 性ྉ۪ᆍऔᔀ ᔀᡷ ᑕᖔ ϟँँጢଫ ۪ࣼ੫ၤ ᔀᡷ ᑕᖔ ԡԡ࿗ଫ୩ᆍႿ੫ ᔀᡷ
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ
ᑕᖔ ԡϟँɯᤥ 本研究结果表明ᖔ大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 的
ϟँ ሕ 回文 ጢᎮ ϟጢ ᧧᥈୩ྉᑕዹዹᦵ᥋ᡱ༁ᑕᤀɯ
۪ᑕᔽႿʛʢᆍቝᔽዹ ୩୩ 位点对 ዶᣰ Вྉఋɯ碱基有着明显偏好ᖔ这与前人
研究结论相一致ྉ 张慧等ᖔԡϟऐଫ李泳潭等ᖔԡԡଫ
জ 注᧥ ᧇႥᡙʗᅳႥ 内含子ଫ ᧇᤩ 基因间隔区ଫ ᤩࣷቴ 基因编码区ᤥ
郑祎等ᖔԡԡଫ王一麾等ᖔԡϟଫ吴朝昕等ᖔԡϟɯᤥ
জશᆍᡷᔀ᧥ ᧇႥᡙʗᅳႥ᧧ႿᡷʢᆍႿଫ ᤩᧇ ᥈ᔀႿᔀ ᔽႿᡷᔀʢ੫ᔀႿᔽዹ ༁ᡱᑕዹᔀʢଫ ᤩࣷቴ᥈ᔀႿᔀ
此外ᖔ大粒香 ዹᡱ᧕શዶ 的密码子也偏好 ዶᣰ Вྉ ఋɯ 碱
ዹᆍʛᔽႿ੫ ʢᔀ੫ᔽᆍႿ
基ᖔ这种密码子使用 情 况 也 存 在 于 其 他 物 种 中
ԣॹ 大粒香 ዞᡓᦵટዛ 系统发育分析 ྉ୩ၤᔽႿᆍझᑕҴᔽ ᔀᡷ ᑕᖔ ϟँऐᤃଫᨃၤᢃᑕቝᑕ ᔀᡷ ᑕᖔ ϟँऐऐଫ郑祎
将大粒香与粳稻ܦ籼稻ܦ野生稻及 个外类物 等ᖔԡԡଫ朱斌等ᖔԡϟଫ吴朝昕等ᖔԡϟɯᤥ 大粒香
种等共 ϟጢ 个 ዹᡱ᧕શዶ 序列构建发育树ᤥ 发育树分 ዹᡱ᧕શዶ 编码蛋白质的密码子和 ୩୩ 位点都偏好 ዶ
析表 明ᖔϟጢ 个 物 种可分为三类ᖔ 即第一类为 碱基或者 Вྉ ఋɯ 碱基ᖔ可能是造成大粒香 ዹᡱ᧕શዶ
ଧᐹቂᤇࣩᐹ ᅳᤀʐ၊ᐹቂᔠᔠᖔ第二类为 ᅳʗ၊ࣩቂ ᤇᔠዞᅳᤀᅳʗᖔ第三 总 ዶᣰ Вྉఋɯ含量大于总 ᥈ऊ 含量的原因ᤥ 根据 શᔽࣼ
类为 ϟሕ 个稻属物种组成ᤥ 在第三类群中又可分 等ྉԡԡᎮɯ的研究报道ᖔ因为 ዶᣰ ఋ 核苷酸含有 Ꭾ 个
为 ࿗ 个小类群ᖔ其中 ሕ 种野生稻 ྉ ᧣ॹ ᐹࣩᡙʗᐹᤀᔠᓣႥᔠ 氮原子ᖔ比 ᥈ᣰ ऊ 核苷酸少一个ᖔ 所以富含 ዶᣰ ఋ 核
