Page 39 - 《广西植物》2022年第12期
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１２ 期 马宇辰等: 白菜 ＣｅｓＡ 基因家族鉴定及表达模式分析 ２ ０ ２ ９
表 ４ 白菜 ＣｅｓＡ 亚细胞定位预测与二级结构分析
Ｔａｂｌｅ ４ Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＣｅｓＡ ｉｎ Ｂｒａｓｓｉｃａ ｒａｐａ ｖａｒ. ｇｌａｂｒａ
亚细胞结构定位预测 蛋白质二级结构分析
Ｓｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ Ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ａｎａｌｙｓｉｓ
内质网
蛋白质 ＩＤ
Ｐｒｏｔｅｉｎ ＩＤ 质膜 胞浆 线粒体 Ｅｎｄｏｐｌａｓｍｉｃ α－螺旋 延伸链 β－转角 不规则卷曲
叶绿体 液泡 细胞核 ｒｅｔｉｃｕｌｕｍ Ｒａｎｄｏｍ
Ｐｌａｓ Ｅｎｄｏｃｈｙ￣ Ｍｉｔｏｃｈｏｎ￣ α￣ｈｅｌｉｘ Ｅｘｔｅｎｄｅｄ β￣ｔｕｒｎ
Ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ Ｖａｃｕｏｌｅ Ｎｕｃｌｅｕｓ ｃｏｉｌ
ｍａｌｅｍｍａ ｌｅｍａ ｄｒｉｏｎ (％) ｓｔｒａｎｄ (％) (％)
(％)
Ｂｒａ０２３９５２ １１ — — — — — ２ ３１.８６ １５.５１ ４.８９ ４７.７４
Ｂｒａ０１１３４５ １２ — — — — １ — ３２.１３ １６.６７ ４.６３ ４６.５７
Ｂｒａ０１１８６５ １２ — — — — １ — ３３.７１ １５.７４ ５.５９ ４４.９７
Ｂｒａ０１０６９１ ７ — １ １ ２ １ １ ３５.５４ ２４.０４ ９.０６ ３１.３６
Ｂｒａ０２９８７４ ９ — — — — ２ ２ ３２.７０ １４.６３ ４.４９ ４８.１８
Ｂｒａ００５８４５ １０ — — １ — ２ — ３３.２７ １４.６０ ４.３６ ４７.７７
Ｂｒａ０２８７６８ １１ — — — — ２ — ３３.４９ １４.４５ ４.６９ ４７.３７
Ｂｒａ０３３７１４ １１ — — — — ２ — ３５.０８ １４.５４ ５.２３ ４５.１５
Ｂｒａ０３６００８ — １ — ４ — ８ — ２８.０４ １７.４６ ８.４７ ４６.０３
Ｂｒａ００６０３６ １３ — — — — — — ３１.７８ １５.２４ ４.２８ ４８.７０
Ｂｒａ０３７７９３ １３ — — — — — — ３１.９５ １５.１４ ４.８９ ４８.０１
Ｂｒａ０２４３２４ １３ — — — — — — ３２.７５ １４.３７ ４.２０ ４８.６８
Ｂｒａ０３１９０４ １３ — — — — — — ３２.２５ １４.０２ ３.７３ ５０.００
Ｂｒａ００４８１４ — ８ ４ — — １ — １６.９９ ２６.１４ １０.４６ ４６.４１
Ｂｒａ００６４０７ １１ １ — — — １ — ３４.５３ １４.８１ ３.５９ ４７.０６
Ｂｒａ０１２５７８ １２ — — — — ２ — ３２.７９ １４.４２ ４.７７ ４８.０２
注: 关于亚细胞定位数值根据分选信号、氨基酸组成和功能域数ꎬ经 ＫＮＮ 算法而得到ꎻ数值表示所占比例ꎻ“—”表示无数值ꎮ
Ｎｏｔｅ: Ｖａｌｕｅｓ ｏｆ ｓｕｂｃｅｌｌｕｌａｒ ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎ ｉｓ ｏｂｔａｉｎｅｄ ａｃｃｏｒｄｉｎｇ ｔｏ ｓｏｒｔｉｎｇ ｓｉｇｎａｌｓꎬ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｃｏｍｐｏｓｉｔｉｏｎ ａｎｄ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｍｏｔｉｆｓ ｆｒｏｍ
ＫＮＮ. Ｔｈｅ ｎｕｍｅｒｉｃａｌ ｖａｌｕｅ ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ ｔｈｅ ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ ｃｏｌｕｍｎꎻ — ｒｅｐｒｅｓｅｎｔｓ ｔｈｅ ａｂｓｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｖａｌｕｅ.
横坐标为蛋白序列长度(氨基酸数量)ꎻ 纵坐标为概率ꎮ
Ｘ￣ｃｏｏｒｄｉｎａｔｅ ｉｓ ｔｈｅ ｌｅｎｇｔｈ ｏｆ ｔｈｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｅｑｕｅｎｃｅ (ｔｈｅ ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ)ꎻ Ｙ￣ｃｏｏｒｄｉｎａｔｅ ｉｓ ｔｈｅ ｐｒｏｂａｂｉｌｉｔｙ.
图 ７ 白菜 ＣｅｓＡ 蛋白跨膜螺旋预测
Ｆｉｇ. ７ Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ＣｅｓＡ ｐｒｏｔｅｉｎ ｔｒａｎｓｍｅｍｂｒａｎｅ ｈｅｌｉｘ ｏｆ Ｂｒａｓｓｉｃａ ｒａｐａ ｖａｒ. ｇｌａｂｒａ
