Page 106 - 《广西植物》2022年第6期

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王海波ᖔ 李芙蓉ᖔ 杨金翠ᖔ 等঎ ऊାᓂ᥋ऊ᧧۪᣽ 信号系统参与小桐子抗冷性形成的生物信息学分析 ЏȮ૒঎ 广西植物ᖔ԰ԡ԰԰ᖔ
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ࣷଧᒦ᤬ࣷᧇۗᣞ 信号系统参与小桐子抗冷性

形成的生物信息学分析

王海波 ϟᕷ԰᥍ ᕷ 李芙蓉 ᕷ 杨金翠 ᕷ 郭俊云 ϟ
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ྉϟ঎ 曲靖师范学院 生物资源与食品工程学院ᖔ 云南 曲靖 ᤃጢጢԡϟϟଫ ԰঎ 曲靖师范学院 云南省高校云贵
高原动植物遗传多样性及生态适应性进化重点实验室ᖔ 云南 曲靖 ᤃጢጢԡϟϟ ɯ
摘জ 要ᧅ 类钙调磷酸酶 ା 亚基蛋白ྉዹᑕ᤟ዹᔽႿᔀࣼʢᔽႿ ା᥋᤟ᔽҴᔀ ዹᑕ᤟ዹᔽࣼቝ ༁ᔀႿ༁ᆍʢᖔऊାᓂɯ属 ऊᑕ 结合蛋白ᖔ通过与类钙调磷
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酸酶 ା 亚基互作蛋白激酶ྉዹᑕ᤟ዹᔽႿᔀࣼʢᔽႿ ା᥋᤟ᔽҴᔀ ዹᑕ᤟ዹᔽࣼቝ ༁ᔀႿ༁ᆍʢ ᔽႿᡷᔀʢᑕዹᡷᔽႿ੫ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ҴᔽႿᑕ༁ᔀᖔऊ᧧۪᣽ɯ互作介导 ऊᑕ 信
号转导过程ᤥ ऊାᓂ᥋ऊ᧧۪᣽ 信号系统参与了植物对多种逆境胁迫的响应过程ᤥ 为深入探讨小桐子的抗冷性机
制ᖔ该研究基于 ାᓂዶ୩ఋ 序列比对的方法ᖔ在全基因组水平对小桐子 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因家族进行了鉴定ᖔ并对
其系统进化ܦ基因结构ܦ表达特性及功能互作进行了解析ᤥ 结果表明᧥ྉϟɯ在小桐子基因组中共鉴定到 ऐ 个
ࣷଧᒦ 基因与 ϟऐ 个 ࣷᧇۗᣞ 基因ᖔऊାᓂ 与 ऊ᧧۪᣽ 蛋白长度分别在 ԰ϟϟጲ ԰ጢᎮ ᑕᑕ 与 ࿗԰԰ጲ ࿗ऐ࿗ ᑕᑕ 之间ᖔ等电点分别在
࿗঎ᤃጢጲ ጢ঎ԡऐ 与 ᤃ঎԰ԡጲ ँ঎԰ᤃ 之间ᤥྉ԰ɯ另外ᖔࣷଧᒦ 基因家族都包含 ऐጲ ϟԡ 个外显子ᖔ而 ࣷᧇۗᣞ 基因家族分为显著
的 ϟጲ ԰ 个外显子ྉϟϟ 个基因ɯ和 ϟ԰ጲ ϟጢ 个外显子ྉᎮ 个基因ɯ两类ᤥྉሕɯ多序列比对显示ᖔ小桐子 ऊାᓂ 蛋白
都鉴定到 ϟ 个由 ϟ࿗ 个氨基酸残基组成的非典型 ጶè᥋ၤᑕႿʛ 基序与 ሕ 个取代程度不同的典型 ጶè᥋ၤᑕႿʛ 基序ᖔ而
ऊ᧧۪᣽ 蛋白都包含 શ 端激酶结构域与 ऊ 端自抑制 è᧧୩ᓂᣰ શዶè 结构域ᤥྉ࿗ɯ染色体定位显示ᖔ԰ᤃ 个小桐子 ࣷଧᒦ
与 ࣷᧇۗᣞ 基因不均匀地分布于 ँ 条染色体上ᤥྉጢɯ转录组数据分析表明ᖔ大部分 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因在小桐子
叶片ܦ根及种子中都有高水平表达ᖔ其中 ȣዞࣷᧇۗᣞϟ࿗ 与 ȣዞࣷᧇۗᣞϟऐ 在低温处理时上调表达量达到了极显著水平
ྉۗጐԡ঎ԡϟɯᖔ参与小桐子的抗冷性过程ᤥ 综上结果为开展小桐子 ࣷଧᒦ 和 ࣷᧇۗᣞ 基因的功能鉴定与低温信号转
导机制研究提供了借鉴ᤥ
关键词ᧅ 小桐子ᖔ 蛋白激酶ᖔ ऊାᓂ᥋ऊ᧧۪᣽ᖔ 基因家族ᖔ 表达分析ᖔ 抗冷性
中图分类号ᧅ ͐ँ࿗ሕজ জ 文献标识码ᧅ ዶজ জ 文章编号ᧅ ϟԡԡԡ᥋ሕϟ࿗԰ྉ԰ԡ԰԰ɯԡᤃ᥋ԡँँᤃ᥋ϟ԰

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收稿日期ᧅ ԰ԡ԰ϟͱԡᎮͱϟጢ
基金项目ᧅ 云南省地方本科高校ྉ部分ɯ 基础研究联合专项项目ྉ԰ԡ԰ԡԡϟାዶԡᎮԡԡԡϟ᥋ ԡԡሕɯଫ云南省大学生创新创业训练计划项目
ྉ ԰ԡ԰ԡϟԡᤃऐ࿗ԡሕऐ ɯଫ 国家自然科学基金 ྉ ሕϟ࿗ᤃԡϟᎮँ ɯ Џ ୩ࣼᡱᡱᆍʢᡷᔀʛ ᤦᢃ ɟࣼႿႿᑕႿ ᓂᆍዹᑕ᤟ ऊᆍ᤟᤟ᔀ੫ᔀ༁ ዶᡱᡱ᤟ᔽᔀʛ ାᑕ༁ᔽዹ ኏ᔀ༁ᔀᑕʢዹၤ ۪ʢᆍᢼᔀዹᡷ
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第一作者ᧅ 王海波ྉϟँऐԡͱɯᖔ博士ᖔ教授ᖔ研究方向为植物逆境分子生物学ᖔྉጶ᥋ቝᑕᔽ᤟ɯ ᤦᆍዹᑕᔽԡ࿗ԡᤃ݀ ϟᤃሕ঎ዹᆍቝᤥ
通信作者
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