Page 111 - 《广西植物》2022年第6期

ᤃ 期 王海波等᧥ऊାᓂ᥋ऊ᧧۪᣽ 信号系统参与小桐子抗冷性形成的生物信息学分析 ϟ ԡ ԡ ϟ

ዛ঎ ࣷଧᒦ 基因家族ଫ ଧ঎ ࣷᧇۗᣞ 基因家族ᤥ 下同ᤥ
ዛ঎ ࣷଧᒦ ੫ᔀႿᔀ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃଫ ଧ঎ ࣷᧇۗᣞ ੫ᔀႿᔀ ஦ᑕቝᔽ᤟ᢃ঎ ఋၤᔀ ༁ᑕቝᔀ ᤦᔀ᤟ᆍऔ঎
图 ϟজ 小桐子与拟南芥ܦ水稻及杨树 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因家族的系统进化分析
èᔽ੫঎ ϟজ ۪ၤᢃ᤟ᆍ੫ᔀႿᔀᡷᔽዹ ʢᔀ᤟ᑕᡷᔽᆍႿ༁ၤᔽᡱ ᑕႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ȣᐹᡙʗᅳᡓ၊ᐹ ዞࣩʗዞᐹ໧ औᔽᡷၤ ዛʗᐹᤇᔠʐᅳᡓ໧ᔠ໧ ᡙ၊ᐹᤀᔠᐹႥᐹᖔ ᧣ʗᡥऊᐹ ໧ᐹᡙᔠצᐹᖔ
ᑕႿʛ ۗᅳᡓࣩᤀࣩ໧ ᡙʗᔠዞ၊ᅳዞᐹʗᡓᐹ ࣷଧᒦ ᑕႿʛ ࣷᧇۗᣞ ੫ᔀႿᔀ ஦ᑕቝᔽ᤟ᔽᔀ༁

蛋白与膜的结合ᖔ而 Ȯዹऊାᓂጢ 与 ȮዹऊାᓂᎮ 则包含较 连锁图谱ᖔ在染色体水平定位小桐子 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ
长的 શ 端序列ྉ图 ሕ᧥ ዶɯᤥ 基因ᖔ结果表明ᖔ除 ጢ 号与 Ꭾ 号染色体没有基因分
植物特有的 ऊ᧧۪᣽ 蛋白也称为 ୩Ⴟ኏᣽ሕᖔ该激酶 布外ᖔ԰ᤃ 个小桐子 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因不均匀地分
与酵母 ୩શèϟܦ哺乳动物 ዶᥘ۪᣽ 同源ᖔ都具有 શ 端 布于 ँ 条染色体上ᖔ其中 ሕ 号与 ϟϟ 号染色体上的
激酶结构域ᖔ其中内部激活环ྉ ᑕዹᡷᔽ׹ᑕᡷᔽᆍႿ᥋᤟ᆍᆍᡱɯ 基 基因数量最多 ጢ 个ᖔ而 ϟԡ 号染色体上的基因数量
序发挥核心作用ᤥ 在小桐子 ϟऐ 个 ऊ᧧۪᣽ 蛋白的 શ 最少ᖔ仅包含 ϟ 个 ȣዞࣷᧇۗᣞᤃ 基因ᖔ进一步鉴定到 ँ
ͱ端都鉴定到被᥋᧕è᥈᥋与᥋ዶ۪ጶ᥋序列ྉ 图 ሕ᧥ ऊ 下划 号染 色 体 上 ࣷଧᒦ 基因家族的串联复制 基 因
线表示ɯ间隔的激活环基序ྉ 图 ሕ᧥ ऊɯᖔ且都包含 ȣዞࣷଧᒦᤃᣰ ȣዞࣷଧᒦऐᖔ以及 ሕ 号ܦ࿗ 号ܦᤃ 号染色体上
保守的 ୩ᔀʢܦఋၤʢ 和 ఋᢃʢ 氨基酸残基ྉ图 ሕ᧥ ऊ 箭头所 ࣷᧇۗᣞ 基因家族的串联复制基因 ȣዞࣷᧇۗᣞ԰ᣰ
示ɯᤥ 另外ᖔ在 ऊ 端都鉴定到 ऊ᧧۪᣽ 蛋白 ԰ϟ ᑕᑕ 自 ȣዞࣷᧇۗᣞ࿗ܦȣዞࣷᧇۗᣞሕᣰ ȣዞࣷᧇۗᣞϟሕ 和 ȣዞࣷᧇۗᣞϟᣰ ȣዞࣷᧇۗᣞϟᤃ

抑制基序 è᧧୩ᓂ ᣰ શዶè 的保守ͱશዶèͱ序列ྉ 图 ሕ᧥ ᧕ ྉ图 ࿗ɯᖔ推测该类基因发生了倍增ᤥ
下划线表示ɯᖔ以保证 ऊ᧧۪᣽ 蛋白正常处于自抑制 ԣॹጇ ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因的差异表达分析

状态ᤥ 基于 ᥈ᔀႿାᑕႿҴ 小桐子转录组 数 据ᖔ 通过
ԣॹ྽ ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因家族的染色体定位 ऊࣼ஦஦᤟ᔽႿҴ༁ 程序得到小桐子 ࣷଧᒦ 与 ࣷᧇۗᣞ 基因家族
依据 ۼࣼ 等ྉ԰ԡϟጢɯ 构建的小桐子高密度遗传 ԰ᤃ 个基因的器官表达数据ྉ 图 ጢɯᤥ 结果表明ᖔ除