Page 172 - 《广西植物》2023年第3期
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                                    图 1  本研究中普定 43 个喀斯特次生林样地的地理分布

                     Fig. 1  Geographical distribution of the 43 secondary karst forest sample plots of this study in Puding


            阔叶植物的 MPD 差异ꎮ 谱系多样性采用 alpha 多                      富度占比的影响因素ꎮ 通 过 Rcompanion 软 件 包
            样性(standardized effect size of MPDꎬSES.MPD) 和      (Mangiaficoꎬ 2022) 的“ nagelkerke” 函数计算广义
            beta 多样性(standardized effect size of MPD between   线性回归模型的伪 R 方(pseudo R ̄squared)ꎮ 其余
            samplesꎬSES.betaMPD) 指数衡量( 车俭等ꎬ2020)ꎬ              因变量无空间自相关ꎬ采用线性回归模型评估地
            前者为标准化的群落内平均种间谱系距离ꎬ值越                              形、基 岩 类 型 和 人 类 活 动 的 影 响ꎮ 然 后ꎬ 通 过
            大则谱系 alpha 多样性越高ꎬ后者为标准化的群落                         MuMIn 软件包( Bartońꎬ 2019) 的“ dredge” 函数进
            间平均种间谱系距离ꎬ值越大则谱系 beta 多样性                          行模型选择ꎬ选出 AICc 值最小模型作为最优模型
            越 高 ( Swensonꎬ 2014 )ꎬ 通 过 “ comstruct ” 和         (Jin et al.ꎬ 2018)ꎮ 其 次ꎬ 采 用 ecodist 软 件 包 的
            “comdist” 函 数 分 别 计 算 这 2 个 指 数ꎮ 采 用               “MRM”函数( Goslee & Urbanꎬ 2007) 进行 Mantel
            Wilcoxon 符号秩检验评估落叶阔叶植物和常绿阔                         检验的多元回归分析( Multiple regression extension

            叶植物 SES.MPD 和 SES.betaMPD 差异ꎮ                      of the Mantel test)ꎬ以了解地理距离、地形、基岩类
                 采用线性回归模型分析地形、基岩类型和人                           型和人类活动对谱系 beta 多样性的影响ꎮ 最后ꎬ
            类活动对叶生活型组成比例以及谱系 alpha 多样                          通过 geodist 软件包的“ geodist” 函数计算样地间地

            性的 影 响ꎮ 首 先ꎬ 通 过 ape 软 件 包 ( Paradis &             理距离(Padgham & Sumnerꎬ 2020)ꎻ通过“ dist” 函
            Schliepꎬ 2019) 的“ Moran.I” 函数发现落叶阔叶植               数计算连续变量和有序分类变量的欧氏距离ꎻ通
            物丰富度占比存在空间自相关(Moran’s I = 0.101ꎬ                   过 cluster 软件包的“gower”函数计算其余分类变量
            P< 0.05)ꎮ 因此ꎬ通过 nlme 软件包的“gls” 函数进                 的高尔距离( Maechler et al.ꎬ 2022)ꎮ 以上所有统
            行广义线性回归模型分析ꎬ了解落叶阔叶植物丰                              计分析在 R 3.6.1 中完成(R Core Teamꎬ 2019)ꎮ
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