Page 164 - 《广西植物》2024年第7期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｊｕｌ. ２０２４ꎬ ４４(７): １３６４－１３７６
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２３０１０３１
杨兰锋ꎬ 朱旭东ꎬ 周宾寒ꎬ 等ꎬ ２０２４. 苦荞 ＴＣＰ 转录因子全基因组鉴定及非生物胁迫分析 [ Ｊ]. 广西植物ꎬ ４４(７):
１３６４－１３７６.
ＹＡＮＧ ＬＦꎬ ＺＨＵ ＸＤꎬ ＺＨＯＵ ＢＨꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２４. Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｂｉｏｔｉｃ ｓｔｒｅｓｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ＴＣＰ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ
ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ ｔａｒｔａｒｙ ｂｕｃｋｗｈｅａｔ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４４(７): １３６４－１３７６.
苦荞 ＴＣＰ 转录因子全基因组鉴定及非生物胁迫分析
杨兰锋 ꎬ 朱旭东 ꎬ 周宾寒 ꎬ 罗旖柔 ꎬ 李明辉 ꎬ 方正武 １∗
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( １. 长江大学 农学院/ 主要粮食作物产业化湖北省协同创新中心ꎬ 湖北 荆州 ４３４０２５ꎻ
２. 长阳土家族自治县农业产业服务中心ꎬ 湖北 宜昌 ４４３５００ )
摘 要: ＴＣＰ 是植物特有的一类转录因子ꎬ在植物生长发育过程中发挥着重要作用ꎮ 该研究利用生物信息
学方法对苦荞 ＴＣＰ 家族进行全基因组鉴定ꎬ并通过实时荧光定量 ＰＣＲ(ｑＲＴ￣ＰＣＲ) 技术分析苦荞 ＴＣＰ 基因
在干旱胁迫和盐胁迫下的表达特征ꎮ 结果表明:(１)在苦荞的基因组中鉴定出 ２８ 个 ＴＣＰ 家族成员ꎬ它们不
均匀地分布在苦荞的 ８ 条染色体上ꎮ (２)多数的苦荞 ＴＣＰ 基因包含 １~ ５ 个外显子ꎮ (３)系统发育分析将苦
荞 ＴＣＰ 家族分为 ５ 个亚家族ꎬ种内 ＴＣＰ 蛋白多聚集在同一分支上ꎮ (４) 共线性分析表明ꎬ５ 个苦荞 ＴＣＰ 基
因来自全基因组复制事件ꎮ (５)顺式元件分析显示ꎬ苦荞 ＴＣＰ 基因的启动子区域的顺式响应元件主要包含
胁迫响应元件和激素响应元件两大类ꎮ (６)转录组数据分析结果显示ꎬ所有苦荞 ＴＣＰ 基因在检测组织中均
有表达ꎮ (７)ｑＲＴ￣ＰＣＲ 结果显示ꎬＦｔＴＣＰ３、ＦｔＴＣＰ６、ＦｔＴＣＰ１２ 和 ＦｔＴＣＰ１３ 基因在干旱胁迫和盐胁迫下的表达
量发生变化ꎬ其中 ＦｔＴＣＰ３ 在 ６ ｈ 干旱处理和盐处理时表达量均达到峰值ꎬ说明 ＦｔＴＣＰ３ 基因在苦荞应对干
旱胁迫和盐胁迫中起正向调控作用ꎮ 该研究结果为了解 ＴＣＰ 基因家族的进化和功能提供了新的见解ꎬ为苦
荞 ＴＣＰ 基因家族的功能研究和利用奠定了基础ꎮ
关键词: 苦荞ꎬ ＴＣＰ 转录因子ꎬ 全基因组鉴定ꎬ 非生物胁迫ꎬ 实时荧光定量 ＰＣＲ
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２４)０７￣１３６４￣１３
Ｇｅｎｏｍｅ￣ｗｉｄｅ ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ａｂｉｏｔｉｃ ｓｔｒｅｓｓ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ
ＴＣＰ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒｓ ｉｎ ｔａｒｔａｒｙ ｂｕｃｋｗｈｅａｔ
１ １ １ １
ＹＡＮＧ Ｌａｎｆｅｎｇ ꎬ ＺＨＵ Ｘｕｄｏｎｇ ꎬ ＺＨＯＵ Ｂｉｎｈａｎ ꎬ ＬＵＯ Ｙｉｒｏｕ ꎬ
２ １∗
ＬＩ Ｍｉｎｇｈｕｉ ꎬ ＦＡＮＧ Ｚｈｅｎｇｗｕ
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅ/ Ｃｏｌｌａｂｏｒａｔｉｖｅ Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｍａｊｏｒ Ｆｏｏｄ Ｃｒｏｐｓꎬ Ｙａｎｇｔｚｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｊｉｎｇｚｈｏｕ ４３４０２５ꎬ
Ｈｕｂｅｉꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｉｎｄｕｓｔｒｙ Ｓｅｒｖｉｃｅ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｔｕｊｉａ Ａｕｔｏｎｏｍｏｕｓ Ｃｏｕｎｔｙꎬ Ｙｉｃｈａｎｇ ４４３５００ꎬ Ｈｕｂｅｉꎬ Ｃｈｉｎａ )
Ａｂｓｔｒａｃｔ: ＴＣＰ ｉｓ ａ ｐｌａｎｔ￣ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ ｔｈａｔ ｐｌａｙｓ ｃｒｕｃｉａｌ ｒｏｌｅｓ ｉｎ ｐｌａｎｔ ｇｒｏｗｔｈ ａｎｄ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ. Ｉｎ ｔｈｉｓ
ｓｔｕｄｙꎬ ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ ｍｅｔｈｏｄｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ｔｈｅ ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｇｅｎｏｍｅ ｏｆ ｔａｒｔａｒｙ ｂｕｃｋｗｈｅａｔ ＴＣＰ ｆａｍｉｌｙꎬ ａｎｄ ｒｅａｌ￣ｔｉｍｅ
收稿日期: ２０２３－０７－０６ 接受日期: ２０２３－０８－２４
基金项目: 国家自然科学基金(３１６７１７５５)ꎮ
第一作者: 杨兰锋(１９９９—)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为作物遗传育种ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｙａｎｇｌａｎｆｅｎｇ１９９９＠ １６３.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 方正武ꎬ博士ꎬ教授ꎬ博士生导师ꎬ主要从事作物遗传育种及品种改良研究ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ) ｆａｎｇｚｈｅｎｇｗｕ８８＠ １６３.ｃｏｍꎮ
