Page 120 - 《广西植物》2020年第12期

ϟ԰ 期 付 春 等 ᧥ 原始小球藻 ዛۗ԰ 转录因子的生物信息学分析 ϟ ऐ ԡ ጢ

ዛ঎ 丙氨酸ଫ ቴ঎ 精氨酸ଫ ટ঎ 天冬酰胺ଫ ᦵ঎ 天冬氨酸ଫ ࣷ঎ 半胱氨酸ଫ ͅ঎ 谷氨酰胺ଫ ጛ঎ 谷氨酸ଫ ᤩ঎ 甘氨酸ଫ ̵঎ 组氨酸ଫ ᧇ঎ 异亮氨
酸ଫ ᒦ঎ 亮氨酸ଫ ᣞ঎ 赖氨酸ଫ ᤹঎ 蛋氨酸ଫ Þ঎ 苯丙氨酸ଫ ۗ঎ 脯氨酸ଫ ୒঎ 丝氨酸ଫ ௴঎ 苏氨酸ଫ ۩঎ 色氨酸ଫ ɔ঎ 酪氨酸ଫ Ⴌ঎ 缬氨酸ᤥ
ዛ঎ ዶ᤟ᑕႿᔽႿᔀଫ ቴ঎ ዶʢ੫ᔽႿᔽႿᔀଫ ટ঎ ዶᡱ༁ᑕʢᑕ੫ᔽႿᔀଫ ᦵ঎ ዶᡱ༁ᑕʢᡷᔽዹ ᑕዹᔽʛଫ ࣷ঎ ऊᢃ༁ᡷᔽႿᔀଫ ͅ঎ ᥈᤟ࣼᡷᑕʢႿᔽႿᔀଫ ጛ঎ ᥈᤟ࣼᡷᑕቝᔽዹᑕዹᔽʛଫ ᤩ঎ ᥈᤟ᢃዹᔽႿᔀଫ ̵঎ ̀ᔽ༁ᡷᔽʛᔽႿᔀଫ ᧇ঎᧧༁ᆍ᤟ᔀࣼዹᔽႿᔀଫ
ᒦ঎ ᓂᔀࣼዹᔽႿᔀଫ ᣞ঎ᓂᢃ༁ᔽႿᔀଫ ᤹঎ ᥘᔀᡷၤᔽᆍႿᔽႿᔀଫ Þ঎ ۪ၤᔀႿᢃ᤟ᑕ᤟ᑕႿᔽႿᔀଫ ۗ঎ ۪ʢᆍ᤟ᔽႿᔀଫ ୒঎୩ᔀʢᔽႿᔀଫ ௴঎ ఋၤʢᔀᆍႿᔽႿᔀଫ ۩঎ ఋʢᢃᡱᡷᆍᡱၤᑕႿଫ ɔ঎ఋᢃʢᆍ༁ᔽႿᔀଫ Ⴌ঎჆ᑕ᤟ᔽႿᔀ঎
图 ϟজ 原始小球藻 ዶ۪԰ 蛋白质的氨基酸组成
èᔽ੫঎ ϟজ ዶቝᔽႿᆍ ᑕዹᔽʛ ዹᆍቝᡱᆍ༁ᔽᡷᔽᆍႿ ᆍ஦ ዶ۪԰ ᡱʢᆍᡷᔀᔽႿ ஦ʢᆍቝ ዛࣩଝᓣႥᅳዞ၊ᤀᅳʗᓣᤀᤀᐹ ᡓʗᅳᡙᅳᡙ၊ᓣዞᅳᔠʐᓣ໧

的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟᎮँԡ঎ϟ ྉᎮᎮɯᖔ潜在磷酸化位点最少 ԣॹጇ 原始小球藻 ዛۗԣ 转录因子编码蛋白的二级结
的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡԡጢጢԡ঎ϟ ྉ԰࿗ɯᤥ 将同种氨基酸对比 构和三级结构预测分析
分析ᖔ在整个家族中ᖔ潜在位点为丝氨酸ྉ୩ɯ 数量 蛋白质的二级结构主要是指蛋白质的多肽链
最多的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟᎮँԡ঎ϟᖔ达到了 ࿗ँ 个位点ᖔ数 中有规则重复的构象 ྉ 曹晨和马堃ᖔ԰ԡϟᤃɯᖔ在原

量最少的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟሕँጢᤃ࿗ᤃ঎ϟ 和 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡԡጢጢԡ঎ϟ 始小球藻 ዶ۪԰ 转录因子基因蛋白成员中ᖔ二级结
两个成员ᖔ均含有 ϟᎮ 个位点ଫ潜在位点为苏氨酸 构中组分含量从大到小排序均为无规则卷曲ᢦም᥋

ྉఋɯ数量最多的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟᎮँԡ঎ϟᖔ达到了 ԰࿗ 个 螺旋ᢦ延伸链ᢦᏇ᥋转角ᖔ其中无规则卷曲和 ም᥋螺旋
位点ᖔ数量最少的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡԡጢጢԡ঎ϟᖔ仅含有 ࿗ 个 的占比较大ᖔ推测其空间结构较小ᖔ且受到侧链间
位点ଫ 潜在位点为络氨酸 ྉɟɯ 数量最多的是 相互作用较大的影响ྉ 王月ᖔ԰ԡϟᎮɯᤥ 基因二级结

ᣮ۪ᡸԡϟϟሕँᤃԡϟϟ঎ϟ和 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟँԡ࿗঎ϟᖔ都达到了 ጢᖔ 构组分中 ም᥋螺旋值最大的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡԡጢጢԡ঎ϟᖔ占
数量最少的是 ᣮ۪ ᡸԡϟϟሕँऐϟጢऐ঎ϟᖔ仅 ϟ 个位点ྉ 表 比达到 ࿗ԡ঎ԡԡᠮᖔም᥋螺旋值最小的是 ᣮ۪ᡸԡϟϟሕँᤃԡϟϟ঎ϟᖔ

࿗ɯᤥ 在第 ࿗ 个分支 ᣮ۪ ᡸԡϟϟ࿗ԡԡሕϟँ঎ ϟ 中ᖔ 第 ϟᤃ࿗ 其占比为 ԰ᤃ঎ԡ࿗ᠮଫ该蛋白三级结构组分中延伸链占
位ܦ第 ԰ϟऐ 位的苏氨酸ᖔ第 ϟ࿗԰ 位ܦ第 ϟᤃԡ 位丝氨酸 比最大为 ᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡԡሕϟँ঎ϟᖔ达 ϟᤃ঎԰԰ᠮᖔ其延伸链最小
以及第 ԰ᤃऐ 位络氨酸可能是潜在的磷酸化位点ᖔ 占比为 ᣮ۪ᡸԡϟϟሕँᤃϟ԰Ꭾ঎ϟᖔ达 ϟԡ঎࿗ԡᠮଫ该组分中 Ꮗ᥋转角
其中最有可能是潜在磷酸化位点的是第 ϟ࿗԰ 位和 值为 ሕ঎ ᤃ࿗ᠮ ྉ ᣮ۪ ᡸ ԡϟϟሕँጢᤃ࿗ᤃ঎ ϟ ɯ ጲ ऐ঎ ᤃ࿗ᠮ
第 ϟᤃԡ 位的丝氨酸ᖔ其值均已达到 ԡ঎ँँऐᖔ远超标 ྉᣮ۪ᡸԡϟϟሕँऐϟጢऐ঎ϟɯଫ其结构组分中无规则卷曲值
准值 ԡ঎ጢᖔ同时也说明蛋白质可能通过丝氨酸磷酸 为 ࿗ԡ঎ ԡԡᠮ ྉ ᣮ۪ ᡸ ԡϟϟ࿗ԡԡጢጢԡ঎ ϟ ɯ ጲ ጢ࿗঎ ጢጢᠮ

化位点来实现其功能的调控ྉ表 ࿗ɯᤥ ྉᣮ۪ᡸԡϟϟ࿗ԡϟँԡ࿗঎ϟɯྉ 表 ጢɯᤥ 由此可推断ᖔ在原始