Page 128 - 《广西植物》2021年第12期
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ԡ Ꭾ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
表 ԣই 紫花苜蓿叶绿体基因组中相关参数的相关性分析 布或位于标准曲线附近ྉ 图 ɯᤥ 为了进一步反映
ఋᑕᤦᔀ জ ऊᆍʢʢᔀᑕᡷᔽᆍႿ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ʢᔀᑕᡷᔀʛ ᡱᑕʢᑕቝᔀᡷᔀʢ༁ ᆍႿ 差异ᖔ根据 ጶશऊ 公式求出 ጶશऊ 的理论值ᖔ再根据
ዹၤᆍʢᆍᡱᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᆍ ᤹ᓣʐᔠዞᐹᅳ ᐹᡙᔠצᐹ ᔀᡱ
公式 ጶશऊ ᢉ ྉጶશऊ ͱ ጶશऊ ɯᣰ ጶશऊ 求算 出
ʢᑕᡷᔽᆍ ᔀᡱ ᆍᤦ༁ ᔀᡱ
ጶશऊ 比值ᤥ 在此基础上分析所有参与研究基因的
᥈ऊϟ ᥈ऊ ᥈ऊሕ ᥈ऊᑕ ጶશऊ
ጶશऊ 频数分布ྉ 表 ሕɯᤥ 统计结果表明ᖔ大多数基
᥈ऊ ԡጢँँ᥍᥍ ԡϟԡᤃ ԡऐ࿗ऐ᥍᥍ ͱԡϟᎮᎮ
因的 ጶશऊ 比值分布在ͱԡԡጢ ጲ ԡϟጢ 之间ᖔ该范围内
᥈ऊሕ ԡԡँᎮ ԡϟԡᤃ ԡሕँ࿗᥍᥍ ԡ ࿗ ϟ ԡ ᥍ ᥍
实际 ጶશऊ 与期望 ጶશऊ 值相差较小ᤥ 因此ᖔ这说明
᥈ऊᑕ ԡऐᤃጢ᥍᥍ ԡ ऐ ࿗ ऐ ᥍ ᥍ ԡሕँ࿗᥍᥍ ԡ ԡ ԡ
突变对紫花苜蓿叶绿体基因组的部分基因密码子
ጶશऊ ͱԡጢጢԡ ͱԡϟᎮᎮ ԡ࿗ϟԡ᥍᥍ԡԡԡ
偏好性的形成影响较大ᤥ
জ 注᧥᥍᥍ 表示在 ԡԡϟ 水平上显著相关ᤥ
জશᆍᡷᔀ᧥ ᥍᥍ ቝᔀᑕႿ༁ ༁ᔽ੫ႿᔽᔽዹᑕႿᡷ ʛᔽᔀʢᔀႿዹᔀ༁ ᑕᡷ ᡷၤᔀ ԡԡϟ ᔀᔀ
表 ᇺই ጛટࣷ 比值频数分布
ఋᑕᤦᔀ ሕজ ᧕ᔽ༁ᡷʢᔽᤦࣼᡷᔽᆍႿ ᆍ ጶશऊ ʢᑕᡷᔽᆍ
组中值
组限 组数 组频
ऊᑕ༁༁ ቝᔽʛʛᔀ
ऊᑕ༁༁ ᤦᆍࣼႿʛᑕʢᢃ શࣼቝᤦᔀʢ èʢᔀीࣼᔀႿዹᢃ
ᑕࣼᔀ
ͱԡϟጢጲ ͱԡԡጢ ͱԡϟ ࿗ ԡԡऐϟ ᤃ
ͱԡԡጢ ጲ ԡԡጢ ԡ ँ ԡጢँϟ ऐ
ԡԡጢጲ ԡϟጢ ԡϟ ϟጢ ԡሕԡᤃ ϟ
ԡϟጢጲ ԡጢ ԡ ϟ ԡԡԡ ࿗
ԣॹ ۗቴԣᡓᤀᅳᡙ 分析
图 ϟজ 紫花苜蓿叶绿体基因中性绘图分析 利用 ۪᥋ᡱᆍᡷ 绘图分析了紫花苜蓿叶绿体基
èᔽ੫ ϟজ શᔀࣼᡷʢᑕᔽᡷᢃ ᡱᆍᡷ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ዹၤᆍʢᆍᡱᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᔀ༁ 因组中部分氨基酸家族中密码子第三位碱基 ዶ 与
ᆍ ᤹ᓣʐᔠዞᐹᅳ ᐹᡙᔠצᐹ ఋܦऊ 与 ᥈ 之间的关系ྉ 图 ሕɯᤥ 结果显示ᖔ大部分
基因分布在图的右下方ᖔ表明密码子第三位碱基 ఋ
的使用频率高于 ዶᖔ᥈ 的使用频率高于 ऊᤥ 如果密
码子使用模式仅受到突变的影响ᖔ则 ዶ 和 ఋܦ᥈ 和
ऊ 的碱基使用频率理论上应该相等ᤥ 但本研究的
图 জ 紫花苜蓿叶绿体基因的 ጶશऊ᥋ᡱᆍᡷ 分析
èᔽ੫ জ ጶશऊ᥋ᡱᆍᡷ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ዹၤᆍʢᆍᡱᑕ༁ᡷ
੫ᔀႿᔀ༁ ᆍ ᤹ᓣʐᔠዞᐹᅳ ᐹᡙᔠצᐹ
图 ሕজ 紫花苜蓿叶绿体基因的 ۪᥋ᡱᆍᡷ 分析
᥈ऊሕ༁ 为横坐标ᖔ定位所有基因的坐标系ᖔ同时添 èᔽ੫ ሕজ ۪᥋ᡱᆍᡷ ᑕႿᑕᢃ༁ᔽ༁ ᆍ ዹၤᆍʢᆍᡱᑕ༁ᡷ
加标准曲线ᤥ 结果显示大部分基因沿标准曲线分 ੫ᔀႿᔀ༁ ᆍ ᤹ᓣʐᔠዞᐹᅳ ᐹᡙᔠצᐹ