Page 130 - 《广西植物》2021年第12期

԰ ԡ Ꭾ ࿗ 广জ 西জ 植জ 物 ࿗ϟ 卷
高表达密码子ྉ表 ጢ 中᥍标明ɯᤥ 选取表 ጢ 中的高 ྉ В᥈ВܦВВዶܦऊऊВܦऊऊዶܦ ऊዶዶܦ ऊ᥈Вܦ ዶऊВܦ ዶऊዶܦ
表达密码子和表 ࿗ 中的高频密码子相结合进行分 ዶዶዶܦዶ᥈ዶܦ ᥈ВВܦ ᥈Вዶܦ ᥈ऊВܦ ᥈ዶВܦ ᥈ዶዶܦ ᥈᥈В 和
析ᖔ将其共有密码子定义为最优密码子ᤥ 最终确 Вዶዶɯᖔ在这 ϟᎮ 个最优密码子中ᖔ全以 ዶ 或 В 结
定了紫花苜蓿叶绿体基因组的最优密码子 ϟᎮ 个 尾ᖔ此结果与 ᥈ऊᑕ᤟᤟ 和 ᥈ऊሕ 的高 ዶܦఋ 含量一致ᤥ

表 ጇই 紫花苜蓿叶绿体基因组最优密码子分析
ఋᑕᤦ᤟ᔀ ጢজ ዶႿᑕ᤟ᢃ༁ᔽ༁ ᆍ஦ ᡷၤᔀ ᆍᡱᡷᔽቝᑕ᤟ ዹᆍʛᆍႿ༁ ᔽႿ ዹၤ᤟ᆍʢᆍᡱ᤟ᑕ༁ᡷ ੫ᔀႿᆍቝᔀ ᆍ஦ ᤹ᓣʐᔠዞᐹ੖ᅳ ໧ᐹᡙᔠצᐹ
高表达基因 低表达基因 高表达基因 低表达基因
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氨基酸 氨基酸
密码子 ੫ᔀႿᔀ ੫ᔀႿᔀ 密码子 ੫ᔀႿᔀ ੫ᔀႿᔀ
ዶቝᔽႿᆍ σ኏୩ऊВ ዶቝᔽႿᆍ σ኏୩ऊВ
ऊᆍʛᆍႿ ऊᆍʛᆍႿ
ᑕዹᔽʛ ᑕዹᔽʛ 数目 数目
数目 数目
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苯丙氨酸 ВВВ ࿗ऐ ϟ঎԰ऐ ϟԡϟ ϟ঎԰ԡ ԡ঎ԡऐ 苏氨酸 ዶऊВ᥍ ϟᎮ ϟ঎࿗ጢ ࿗ϟ ϟ঎ሕϟ ԡ঎ϟ࿗
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丝氨酸 ВऊВ᥍ ሕᎮ ԰঎԰࿗ ᤃऐ ϟ঎Ꭾጢ ԡ঎࿗ँ ዶऊዶ᥍ ϟᎮ ϟ঎࿗ጢ ࿗԰ ϟ঎ሕ࿗ ԡ঎ϟϟ
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酪氨酸 ВዶВ ሕԡ ϟ঎࿗ሕ ँँ ϟ঎ᤃᤃ ͱԡ঎԰ሕ 赖氨酸 ዶዶዶ᥍ ሕጢ ϟ঎Ꭾँ ϟሕሕ ϟ঎ሕᎮ ԡ঎࿗԰
ఋᢃʢ ᓂᢃ༁
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色氨酸 ఋʢᡱ В᥈᥈᥍ ԰ᤃ ԰঎ԡԡ ࿗ԡ ϟ঎ँԡ ԡ঎ϟԡ 丝氨酸 ዶ᥈В ϟऐ ϟ঎ԡँ ࿗Ꭾ ϟ঎԰ϟ ͱԡ঎ϟ԰
୩ᔀʢ
半胱氨酸 В᥈В᥍ ࿗ ԰঎ԡԡ ԰ϟ ϟ঎ሕጢ ԡ঎ᤃጢ ዶ᥈ऊ᥍ ጢ ԡ঎ሕԡ ऐ ԡ঎԰ϟ ԡ঎ԡँ
ऊᢃ༁
В᥈ऊ ԡ ԡ঎ԡԡ ϟԡ ԡ঎ᤃጢ ͱԡ঎ᤃጢ 精氨酸 ዶ᥈ዶ᥍ ϟᤃ ԰঎ጢᤃ ጢ࿗ ԰঎ሕԡ ԡ঎԰ᤃ
ዶʢ੫
亮氨酸 ВВዶ᥍ ࿗ԡ ԰঎ԡԡ ऐሕ ϟ঎ᤃऐ ԡ঎ሕ԰ ዶ᥈᥈ ࿗ ԡ঎ᤃ࿗ ሕᎮ ϟ঎ጢᎮ ͱԡ঎ँሕ
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ВВ᥈ ԰ԡ ϟ঎ԡԡ ᤃጢ ϟ঎ሕ԰ ͱԡ঎ሕ԰ 缬氨酸 ᥈ВВ᥍ ሕԡ ϟ঎ऐ԰ ࿗࿗ ϟ঎ᤃ࿗ ԡ঎ϟऐ
჆ᑕ᤟
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ऊВऊ ሕ ԡ঎ϟጢ ϟँ ԡ঎ሕँ ͱԡ঎԰࿗ ᥈Вዶ᥍ ԰ᤃ ϟ঎ጢऐ ሕϟ ϟ঎ϟᤃ ԡ঎࿗԰
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ऊВ᥈ ሕ ԡ঎ϟጢ ԰ϟ ԡ঎࿗ሕ ͱԡ঎԰ऐ 丙氨酸 ᥈ऊВ᥍ ࿗԰ ϟ঎࿗Ꭾ ሕᎮ ϟ঎࿗Ꭾ ԡ঎ऐሕ
ዶ᤟ᑕ
脯氨酸 ऊऊВ᥍ ԰࿗ ԰঎ԡ࿗ ࿗ሕ ϟ঎ᤃϟ ԡ঎࿗ሕ ᥈ऊऊ ሕ ԡ঎Ꭾँ ԰ԡ ԡ঎Ꭾँ ͱԡ঎ᤃሕ
۪ʢᆍ
ऊऊऊ ᤃ ԡ঎ጢϟ ԰ϟ ԡ঎Ꭾँ ͱԡ঎԰ऐ ᥈ऊዶ ԰ϟ ϟ঎ԡᎮ ԰Ꭾ ϟ঎ԡᎮ ԡ঎ԡऐ
ऊऊዶ᥍ ϟሕ ϟ঎ϟϟ ԰ጢ ԡ঎ँሕ ԡ঎ϟऐ ᥈ऊ᥈ Ꭾ ԡ঎ᤃᎮ ϟᎮ ԡ঎ᤃᎮ ͱԡ঎԰ँ
ऊऊ᥈ ࿗ ԡ঎ሕ࿗ ϟऐ ԡ঎ᤃᎮ ͱԡ঎ሕሕ 天冬氨酸 ᥈ዶВ᥍ ԰ሕ ϟ঎ᎮᎮ ϟ԰ԡ ϟ঎ᤃᤃ ԡ঎ϟϟ
组氨酸 ऊዶВ Ꭾ ϟ঎԰Ꭾ ጢ԰ ϟ঎ጢϟ ͱԡ঎԰࿗ ዶ༁ᡱ ᥈ዶऊ ሕ ԡ঎԰ሕ ԰ጢ ԡ঎ሕ࿗ ͱԡ঎ϟϟ
̀ᔽ༁
ऊዶऊ᥍ ࿗ ԡ঎Ꭾሕ ϟᎮ ԡ঎࿗ँ ԡ঎԰࿗ 谷氨酸 ᥈ዶዶ᥍ ࿗ሕ ϟ঎ጢँ ϟԡᤃ ϟ঎԰Ꭾ ԡ঎ሕ԰
᥈᤟ࣼ
谷氨酰胺 ऊዶዶ᥍ ԰ᤃ ϟ঎Ꭾँ ᤃऐ ϟ঎࿗ԡ ԡ঎ሕँ ᥈ዶ᥈ ϟϟ ԡ঎࿗ϟ ᤃϟ ԡ঎Ꭾሕ ͱԡ঎ሕ԰
᥈᤟Ⴟ
ऊዶ᥈ ሕ ԡ঎԰ϟ ԰ँ ԡ঎ᤃԡ ͱԡ঎ሕँ 甘氨酸 ᥈᥈В᥍ ࿗ԡ ϟ঎ँԡ ሕ࿗ ԡ঎ँᤃ ԡ঎ँ࿗
᥈᤟ᢃ
精氨酸 ऊ᥈В᥍ ϟऐ ϟ঎ऐጢ ԰ᤃ ϟ঎ϟϟ ԡ঎Ꭾ࿗ ᥈᥈ऊ ᤃ ԡ঎԰ँ ϟጢ ԡ঎࿗԰ ͱԡ঎ϟሕ
ዶʢ੫
ऊ᥈ऊ ᤃ ԡ঎ᤃ԰ ϟሕ ԡ঎ጢጢ ԡ঎ԡᎮ ᥈᥈ዶ ԰ँ ϟ঎ሕऐ ᤃ࿗ ϟ঎ऐԡ ͱԡ঎࿗԰
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ऊ᥈᥈ ԰ ԡ঎԰ϟ ϟ࿗ ԡ঎ᤃԡ ͱԡ঎ሕँ 甲硫氨酸 ዶВ᥈᥍ ԰ऐ ԡ঎ँᎮ ጢԡ ԡ঎ऐϟ ԡ঎ϟᤃ
ᥘᔀᡷ
异亮氨酸 ዶВВ ጢऐ ϟ঎࿗ሕ ँሕ ϟ঎࿗ሕ ԡ঎ԡԡ 终止密码子 Вዶዶ᥍ ࿗ ԡ঎ᤃ࿗ ԰ ԡ঎ԡँ ԡ঎ጢጢ
᧧᤟ᔀ ఋጶ኏
ዶВऊ ԰ሕ ԡ঎ጢᎮ ሕᎮ ԡ঎ጢᎮ ԡ঎ԡԡ Вዶ᥈᥍ ϟ ԡ঎ϟᤃ ϟ ԡ঎ԡ࿗ ԡ঎ϟ԰
ዶВዶ ሕԡ ϟ঎ԡሕ Ꭾ࿗ ϟ঎ϟँ ͱԡ঎ϟᤃ В᥈ዶ ԡ ԡ঎ԡԡ ԰ ԡ঎ϟԡ ͱԡ঎ϟԡ

জ 注᧥᥍ 表示高表达密码子ᤥ
জ શᆍᡷᔀ᧥ ᥍ ቝᔀᑕႿ༁ ၤᔽ੫ၤ ᔀ଴ᡱʢᔀ༁༁ᔽᆍႿ ዹᆍʛᆍႿ༁঎