Page 142 - 《广西植物》2023年第10期
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１ ８ ９ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
表 ２ 用于系统发育树构建的已发表物种名录及其信息 主要有光系统 Ｉ 基因、光系统 ＩＩ 基因、ＮＡＤ( Ｐ) Ｈ
Ｔａｂｌｅ ２ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｄ ｓｐｅｃｉｅｓ ｌｉｓｔ ａｎｄ ｉｔｓ ｉｎｆｏｒｍａｔｉｏｎ 氧化还原酶基因、细胞色素 ｂ / ｆ 复合体基因、ＡＴＰ
ｆｏｒ ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅ ｃｏｎｓｔｒｕｃｔｉｏｎ 酶基因和二磷酸核酮糖羧化酶大亚基基因ꎬ其中
光合作用系统基因数量最多ꎻ其他基因共 ６ 个ꎻ未
ＧｅｎＢａｎｋ
种中文名 种拉丁名 序列号
属名 知功能基因 ８ 个ꎮ 在这些基因中含有 ２１ 个双拷贝
Ｃｈｉｎｅｓｅ ｎａｍｅ Ｌａｔｉｎ ｎａｍｅ ＧｅｎＢａｎｋ
Ｇｅｎｕｓ
ｏｆ ｓｐｅｃｉｅｓ ｏｆ ｓｐｅｃｉｅｓ ａｃｃｅｓｓｉｏｎ 基因ꎬ包括 ２ 个核糖体大亚基( ｒｐｌ２、ｒｐｌ２３)、２ 个核
ｎｕｍｂｅｒ
糖体小亚基( ｒｐｓ７、ｒｐｓ１２)、４ 个 ｒＲＮＡ 基因( ｒｒｎ４.５、
乌头属 黄草乌 Ａ. ｖｉｌｍｏｒｉｎｉａｎｕｍ ＮＣ＿０３８０９４
Ａｃｏｎｉｔｕｍ ｒｒｎ５、ｒｒｎ１６、ｒｒｎ２３)、７ 个 ｔＲＮＡ 基因( ｔｒｎＡ￣ＵＧＣ、ｔｒｎＩ￣
瓜叶乌头 Ａ. ｈｅｍｓｌｅｙａｎｕｍ ＮＣ＿０３８０９５
ＣＡＵ、ｔｒｎＩ￣ＧＡＵ、ｔｒｎＬ￣ＣＡＡ、ｔｒｎＮ￣ＧＵＵ、ｔｒｎＲ￣ＡＣＧ、ｔｒｎＶ￣
马耳山乌头 Ａ. ｄｅｌａｖａｙｉ ＮＣ＿０３８０９７
ＧＡＣ)、１ 个 ＮＡＤＨ 脱氢酶(ｎｄｈＢ)、３ 个未知功能基
丽江乌头 Ａ. ｆｏｒｒｅｓｔｉｉ ＭＺ９５９０４４
西南乌头 Ａ. ｅｐｉｓｃｏｐａｌｅ ＮＣ＿０３８０９６ 因(ｙｃｆ１、ｙｃｆ２、ｙｃｆ１５)(表 ４)ꎮ
多枝乌头 Ａ. ｒａｍｕｌｏｓｕｍ ＯＭ２８９０５９ ２.２ 全叶绿体基因组 ＳＳＲ 分析
滇西乌头 Ａ. ｂｕｌｌｅｙａｎｕｍ ＯＫ３２３９４９ １０ 个栽培品的叶绿体基因组中共发现 ６０ 个
德钦乌头 Ａ. ｏｕｖｒａｒｄｉａｎｕｍ ＯＭ２８９０５７ (ＬＪ￣１￣２) ~ ７３ 个(ＪＳ￣１￣４) ＳＳＲ 位点( 图 ２:Ａ)ꎬ包括
滇南草乌 Ａ. ａｕｓｔｒｏｙｕｎｎａｎｅｎｓｅ ＭＮ６３５７４５ ２８ ~ ３７ 个单核苷酸 ＳＳＲ 位点、１３ ~ １６ 个二核苷酸
铁棒锤 Ａ. ｐｅｎｄｕｌｕｍ ＮＣ＿０５３８４８
ＳＳＲ 位点、６ ~ ９ 个三核苷酸 ＳＳＲ 位点、６ ~ ９ 个四核
伏毛铁棒锤 Ａ. ｆｌａｖｕｍ ＮＣ＿０５６２８０
苷酸 ＳＳＲ 位点、２ ~ ５ 个五核苷酸 ＳＳＲ 位点ꎬ未发现
宾川乌头 Ａ. ｄｕｃｌｏｕｘｉｉ ＯＭ３２８０７０
六核 苷 酸 ＳＳＲ 位 点ꎬ 单 核 苷 酸 重 复 占 比 最 大
显柱乌头 Ａ. ｓｔｙｌｏｓｕｍ ＯＭ３２８０７１
苍山乌头 Ａ. ｃｏｎｔｏｒｔｕｍ ＮＣ＿０３８０９８ (４４.４％ ~ ５１.５％)ꎮ 单碱基重复单元 Ａ / Ｔ、Ｃ / Ｇꎬ二
— Ａ. ｃｉｌｉａｒｅ ＮＣ＿０３１４２０ 碱基重复单元 ＡＴ / ＴＡꎬ三碱基重复单元 ＡＡＴ / ＡＴＴ、
— Ａ. ｊａｌｕｅｎｓｅ ｓｕｂｓｐ. ＫＴ８２０６６８ ＡＴＣ / ＡＴＧꎬ四碱基重复单元 ＡＡＡＧ / ＣＴＴＴ、ＡＡＡＴ /
ｊａｌｕｅｎｓｅ
萝卜乌头 Ａ. ｊａｐｏｎｉｃｕｍ ｓｕｂｓｐ. ＫＴ８２０６７０ ＡＴＴＴ 和 ＡＡＴＧ / ＡＴＴＣ、ＡＡＴＴ / ＴＴＡＡꎬ五碱基重复单
ｎａｐｉｆｏｒｍｅ
元 ＡＡＴＡＴ / ＡＴＡＴＴ 是 １０ 个样品共有的 ＳＳＲ( 图 ２:
北乌头 Ａ. ｋｕｓｎｅｚｏｆｆｉｉ ＮＣ＿０３１４２２
Ｂ)ꎮ １０ 个栽培品的叶绿体基因组中 ＳＳＲｓ 的分布
乌头 Ａ. ｃａｒｍｉｃｈａｅｌｉｉ ＮＣ＿０３０７６１
蔓乌头 Ａ. ｖｏｌｕｂｉｌｅ ＫＵ５５６６９０ 有所不同( 图 ２:Ｃ)ꎬＬＳＣ 区含有 ５３４ 个 ＳＳＲｓꎬＳＳＣ
区含有 ４２ 个 ＳＳＲｓꎬＩＲ 区含有 ８８ 个 ＳＳＲｓꎬ不同样
— Ａ. ｃｈｉｉｓａｎｅｎｓｅ ＮＣ＿０２９８２９
— Ａ. ａｕｓｔｒｏｋｏｒｅｅｎｓｅ ＫＴ８２０６６３ 品 ＳＳＲｓ 在 ３ 个区域的占比也不尽相同:ＬＳＣ 区为
高山乌头 Ａ. ｍｏｎａｎｔｈｕｍ ＮＣ＿０３１４２３ ７８.６％ ~ ８３.１％ꎬＳＳＣ 区为 １０.８％ ~ １４.７％ꎬＩＲ 区为
黄花乌头 Ａ. ｃｏｒｅａｎｕｍ ＮＣ＿０３１４２１ ５.６％ ~ ８.６％ꎮ
— Ａ. ｐｓｅｕｄｏｌａｅｖｅ ＮＣ＿０３５８９２
２.３ ＩＲ 边界扩张和收缩分析
赣皖乌头 Ａ. ｆｉｎｅｔｉａｎｕｍ ＮＣ＿０３６３５８
本研究比较了 １０ 个栽培品叶绿体基因组的
高帽乌头 Ａ. ｌｏｎｇｅｃａｓｓｉｄａｔｕｍ ＮＣ＿０３５８９４
ＩＲ 区边界ꎬ结果见图 ３ꎮ １０ 个样品的叶绿体基因
— Ａ. ａｎｇｕｓｔｉｕｓ ＮＣ＿０３６３５７
组长度在 １５５ ７４４ ｂｐ(ＬＪ￣１￣２) ~ １５５ ９３７ ｂｐ( ＤＣ￣２￣
— Ａ. ｒｅｃｌｉｎａｔｕｍ ＭＦ１８６５９３
高乌头 Ａ. ｓｉｎｏｍｏｎｔａｎｕｍ ＮＣ＿０３６３５９ ２)之间ꎬＩＲ 区域的长度为 ２６ １２７ ｂｐ( ＤＣ￣２￣２) ~
２６ １７０ ｂｐ( ＪＳ￣１￣４、ＱＪ￣１￣２、ＬＸ￣１￣３、ＬＪ￣４￣３)ꎬＬＳＣ 区
牛扁 Ａ. ｂａｒｂａｔｕｍ ｖａｒ. ＫＴ９６４６９８
ｐｕｂｅｒｕｌｕｍ 域的长度为 ８６ ４９６ ｂｐ(ＬＪ￣１￣２) ~ ８６ ６８０ ｂｐ( ＤＣ￣２￣
— Ｇｙｍｎａｃｏｎｉｔｕｍ ＮＣ＿０３３３４１
ｇｙｍｎａｎｄｒｕｍ ２)ꎬＳＳＣ 区域的长度为 １６ ９２１ ｂｐ(ＬＪ￣３￣２) ~ １７ ００７
飞燕草属 — Ｃ. ｏｒｉｅｎｔａｌｉｓ ＮＣ＿０４７２９２ ｂｐ(ＬＱ￣１￣３、ＧＪ￣１￣３、ＮＬ￣１￣３、ＤＣ￣２￣２)ꎬ所有样品的
Ｃｏｎｓｏｌｉｄａ
翠雀属 还亮草 Ｄ. ａｎｔｈｒｉｓｃｉｆｏｌｉｕｍ ＭＫ２５３４６１ ＬＳＣ、ＳＳＣ 和 ＩＲ 区域的大小相似ꎬＩＲ 区与 ＳＣ 区边
Ｄｅｌｐｈｉｎｉｕｍ
界高度保守ꎬ但各样品叶绿体基因组的 ＩＲ 区和其
注: — 表示在电子版«中国植物志» 中找不到该物种的种中 他样品间仍略有差异ꎮ １０ 个样品的 ｒｐｓ１９ 基因均
文名ꎮ
距离 ＩＲｂ 区 ６３ ｂｐꎻ除 ＬＱ￣１￣３、ＧＪ￣１￣３、ＮＬ￣１￣３、ＤＣ￣
Ｎｏｔｅ: — ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｈａｔ ｔｈｅ Ｃｈｉｎｅｓｅ ｎａｍｅ ｏｆ ｔｈｉｓ ｓｐｅｃｉｅｓ ｃａｎ ｎｏｔ ｂｅ
ｆｏｕｎｄ ｉｎ ｔｈｅ ｅｌｅｃｔｒｏｎｉｃ Ｆｌｏｒａ Ｒｅｉｐｕｂｌｉｃａｅ Ｐｏｐｕｌａｒｉｓ Ｓｉｎｉｃａｅ. ２￣２ ４ 个样品的 ｒｐｌ２ 长度为 １ ４８６ ｂｐ 外ꎬ 其余样品
