Page 112 - 《广西植物》2023年第11期
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0.653 4ꎬπ = 0.000 65) 的遗传多样性显著低于高
源等(2020)采用 4 段叶绿体拼接序列对苹果属植
物的结果(Hd = 0.879ꎬπ = 0.009 52)ꎬ刘晶(2013)
对蔷薇科豆梨( cpDNA:Hd = 0.719ꎬπ = 0.001 05)
和川梨( cpDNA:Hd = 0. 718ꎬπ = 0. 000 85) 的 结
果ꎬ同时还低于张怀山(2017) 对刺梨 cpDNA 的研
究结果(Hd = 0.829ꎬπ = 0.001 31)ꎬ但高于其 ITS
序列的结果(Hd = 0.247ꎬπ = 0.000 40)ꎮ 本研究结
果表明ꎬ刺梨具有较低的遗传多样性ꎮ 西南地区
刺梨的遗传多样性偏低ꎬ可能与本研究所用 3 个
cpDNA 间隔区序列的进化速率有关ꎬ选用的叶绿
体基因序列较为保守ꎬ需要更加精准的结果时则
圆圈大小代表频率ꎮ 下同ꎮ
Circle size represents frequency. The same below. 需要 结 合 其 他 cpDNA 间 隔 区 序 列 ( 王 崇 等ꎬ
图 2 基于刺梨单拷贝核基因构建的单倍型网络图 2021)ꎻ也可能是标记的基因、自身属性以及有效
Fig.2 Network diagram of Rosa roxburghii 群体大小不同等因素所导致ꎮ 因为野生刺梨在进
single ̄copy nuclear gene haplotype 化过程中由少数种群产生的建立者效应或者近期
发生过瓶颈效应ꎬ造成遗传变异大量丢失ꎬ遗传多
0.61ꎬ遗传距离为 0 ~ 0.005ꎬ群体间遗传分化系数 样性结果较低( 何文等ꎬ2014)ꎮ 刺梨每个居群间
为 G = 0.273 < N = 0.308 (P>0.05)ꎮ 的单倍型多样性( Hd) 表现不同ꎬ推测可能是西南
ST ST
利用 DnaSP 6 软件分别基于单拷贝核基因和 地区的地形十分复杂ꎬ使各居群所在的环境条件
叶绿体基因的拼接序列对 320 个刺梨材料进行中 具有差异ꎬ经过长期不同的生态环境和自然选择ꎬ
性 检 测ꎬ 结 果 显 示ꎬ Tajima’ s D 统 计 值 分 别 为 会导致具有一定地理隔离的刺梨居群的遗传多样
-1.575 16 ( 0. 01 < P < 0. 05) 和 - 1. 201 85 ( P > 性存在差异ꎮ
0.01)ꎬ均不显著ꎬ符合中性进化模型ꎮ 这说明刺 3.2 刺梨居群的遗传结构分析
梨受到环境变化、人为因素的影响较低ꎬ进化方式 种群在进化过程中ꎬ遗传漂变、自然选择、种
为 平 衡 选 择ꎮ Fu ’ s Fs 值 分 别 是 -11.003 和 群历史和突变等因素的影响导致其遗传结构产生
-12.066ꎬ均为显著负值ꎬ说明刺梨居群发生过扩 复杂的构成( 任婧等ꎬ2019)ꎮ 通过对单拷贝核基
张ꎮ 为了进一步验证 27 个刺梨居群是否经历扩 因 的 研 究 发 现ꎬ 遗 传 分 化 系 数 较 低 ( F =
ST
张ꎬ对其进行失配分析(李楠玉等ꎬ2021)ꎮ 失配分 0.094 87)ꎬ遗传系数为 N = 0.076 > G = 0.056
ST ST
析是检测物种居群的历史动态ꎬ如果呈单峰分布ꎬ (P> 0. 05)ꎬ 虽 然 P 值 显 著ꎬ 但 是 低 于 Petit 等
说明该种群经历了扩张ꎬ呈双峰或多峰分布时ꎬ则 (2005)总结的基于核基因标记的 22 种植物的平
认为该居群持续处于动态平衡或缓慢下降状态 均遗传分化程度(G = 0.15)ꎮ 从两个基因的单倍
ST
(莫忠妹等ꎬ2022)ꎮ 由图 6 可知ꎬ叶绿体基因的失 型网络图可以看出ꎬ高频率的单倍型分布到多数
配分布图呈双峰ꎬ而单拷贝核基因的失配分布曲 种群中ꎬ存在明显网状结构ꎬ但同时各单倍型在种
线呈单峰ꎬ推测刺梨居群只是在小范围内经历过 群中交织分布ꎬ与种群的地理分布没有明显联系ꎬ
扩张ꎬ但总体上维持稳定状态ꎮ 这也与种群间基因交流广泛ꎬ缺乏种群特有的高
频率的单倍型有关ꎮ 此外ꎬ刺梨种群的不同居群
3 讨论与结论 间出现了大量亲缘关系靠近的单倍型ꎬ表明刺梨
群体间不存在明显的谱系地理结构ꎮ 不同于叶绿
3.1 刺梨居群的遗传多样性分析 体基因仅有的母系遗传ꎬ核基因还存在花粉流ꎬ导
刺梨单拷贝核基因 GAPDH 和 ncpGS 联合序 致刺梨 种 群 间 基 因 交 流 更 频 繁ꎬ 基 因 流 ( Nm =
列(Hd = 0.469 2ꎬπ = 0.000 49) 以及叶绿体基因 2.44)较高ꎮ 植物居群间遗传结构存在较大的差
atpF-trnH、trnL-trnF 和 trnG-trnS 联合序列( Hd = 异性ꎬ主要是地理上的隔离、突变、动荡等环境因