Page 109 - 《广西植物》2023年第11期
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１１ 期 吴诗琪等: 西南地区野生刺梨的遗传多样性和遗传结构研究 ２ ０ ６ ９
图 １ 刺梨采样照片
Ｆｉｇ. １ Ｐｈｏｔｏｓ ｏｆ ｃｏｌｌｅｃｔｅｄ Ｒｏｓａ ｒｏｘｂｕｒｇｈｉｉ
表 ２ 引物名称、序列及参考文献 表 ３ ３２０ 个刺梨材料基于单拷贝核基因和
Ｔａｂｌｅ ２ Ｐｒｉｍｅｒ ｎａｍｅꎬ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ａｎｄ ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ 叶绿体基因的多态分析
引物名称 引物序列 Ｔａｂｌｅ ３ Ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｓｉｎｇｌｅ￣ｃｏｐｙ ｎｕｃｌｅａｒ
参考文献
Ｐｒｉｍｅｒ Ｐｒｉｍｅｒ ｇｅｎｅ ａｎｄ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｅ ｉｎ ３２０ Ｒｏｓａ ｒｏｘｂｕｒｇｈｉｉ ｓａｍｐｌｅｓ
Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ
ｎａｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅ
单一 简约信息
Ｆ: ＧＡＴＧＣＴＣＡＣＴＡＣＡＡＧＧＣＴＴＧ Ｅｍｓｈｗｉｌｌｅｒ 变异 突变 位点数 核苷酸
ｎｃｐＧＳ 单倍型
ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９９ 位点数 位点数 Ｐａｒｓｉｍｏｎｙ 多样性
Ｒ: ＡＡＴＧＴＧＣＴＣＴＴＴＧＴＧＧＣＧＡＡＧ 长度 样性
基因 Ｖａｒｉａｂｌｅ Ｓｉｎｇｌｅ ｉｎ Ｎｕｃｌｅｏ￣
Ｌｅｎｇｔｈ Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ
Ｆ: ＧＡＴＡＧＡＴＴＴＧＧＡＡＴＴＧＴＴＧＡＧＧ Ｇｅｎｅ ｓｉｔｅ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｆｏｒｍａｔｉｖｅ ｔｉｄｅ
Ｊｏｌｙ ｅｔ ａｌ.ꎬ (ｂｐ) ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ
ＧＡＰＤＨ ｎｕｍｂｅｒ ｓｉｔｅ ｓｉｔｅ ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ
２００６ａｍ (Ｈｄ)
Ｒ: ＧＡＣＡＴＴＧＡＡＴＧＡＧＡＴＡＡＡＣＣ (Ｖｓ) ｎｕｍｂｅｒ ｎｕｍｂｅｒ (π)
(Ｓｓ) (Ｐｓ)
Ｆ: ＡＣＴＣＧＣＡＣＡＣＡＣＴＣＣＣＴＴＴＣＣ
Ｌａｈａｙｅ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ａｔｐＦ－ｔｒｎＨ ｓｃｎＤＮＡ １ ２９４ ８ ３ ５ ０.０００ ４７ ０.４４９ ０
２００８
Ｒ: ＧＣＴＴＴＴＡＴＧＧＡＡＧＣＴＴＴＡＡＣＡＡＴ
ｃｐＤＮＡ １ ８６５ ２０ １２ ８ ０.０００ ６５ ０.６５３ ４
Ｆ: ＴＴＡＴＴＣＧＡＴＣＣＡＡＴＣＧＴＡＣＣＡＣ
Ｔａｂｅｒｌｅｔ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ｔｒｎＬ－ｔｒｎＦ
１９９１
Ｒ: ＡＧＡＡＧＣＣＡＴＴＧＣＡＡＴＴＧＣＣＧＧＡＡＡ
Ｆ: ＧＡＡＴＣＧＡＡＣＣＣＧＣＡＴＣＧＴＴＡＧ
Ｓｍａｌｌ ｅｔ ａｌ.ꎬ
ｔｒｎＧ－ｔｒｎＳ ２ 结果与分析
１９９８
Ｒ: ＡＡＣＴＣＧＴＡＣＡＡＣＧＧＡＴＴＡＧＣＡＡＴＣ
２.１ 遗传多样性分析
用 Ｍｅｇａ ６ 软件( Ｔａｍｕｒａ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０１３) 计算遗传距 如表 ３ 所 示ꎬ２ 段 单 拷 贝 核 基 因 ＧＡＰＤＨ 和
离矩阵ꎬ利用 Ｎｅｔｗｏｒｋ 软件( Ｂａｎｄｅｌｔ ｅｔ ａｌ.ꎬ １９９９) ｎｃｐＧＳ 拼接后的总长度为１ ２９４ ｂｐꎮ 其中ꎬＡＴ 含量
基于简约性原则采用 ＭＪ 法构建单倍型网络图( 潘 为 ５８.８８％ ~ ５９.１２％ꎬ与 ＧＣ 含量相差不大ꎮ 共检
凤等ꎬ２０２１)ꎻ用 ＡｒｃＧｉｓ 软件( 张智慧ꎬ２０１７) 绘制 测到 ８ 个核苷酸变异位点ꎬ其中简约性的信息位
单倍型在地理上的分布ꎮ 点 ５ 个ꎬ 单 一 突 变 位 点 ３ 个ꎮ 变 异 位 点 分 别 为
