Page 110 - 《广西植物》2023年第11期
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２ ０ ７ ０ 广 西 植 物 ４３ 卷
１０７、１５４、５９２、１ ０９６、１ １３１、１ １８０、１ １８２ 和１ ２２５ꎮ ＡＳＰＤ 居 群 中ꎬ 单 倍 型 Ｒ￣１１ 只 分 布 在 遵 义 湄 潭
将序 列 提 交 至 ＧｅｎｅＢａｎｋꎬ 序 列 号 为 ＯＰ５２６９９５ ~ ＺＹＭＴ 居群中ꎬＲ￣１３ 只分布于黔东南黄平 ＱＤＮＨＰ
ＯＰ５２７０２４ꎮ 拼接序列检测到 １５ 个单倍型ꎮ 单拷 居群中ꎬＲ￣１５ 六盘水盘县 ＬＰＳＰＸ 居群中ꎮ 其余单
贝核基因拼接序列的遗传多样性水平较低( Ｈｄ ＝ 倍型均分布在多个居群中(表 ４)ꎮ
０.４４９ ０ꎬπ ＝ ０.０００ ４７)ꎬ但不同刺梨居群间存在较 基于叶绿体基因的拼接序列ꎬ在 ２７ 个刺梨居
大差异(Ｈｄ ＝ ０ ~ ０.８００ ０ꎬπ ＝ ０ ~ ０.０００ ８４)ꎬ２７ 个 群中得到 ２０ 个单倍型ꎬ其中单倍型 Ｈ￣１ 分布最
居群中ꎬ黔西南贞丰 ＱＸＮＺＦ 居群( Ｈｄ ＝ ０.８００ ０ꎬ 广ꎬ在 ２６ 个居群中广泛分布ꎬ意味着单倍型 Ｈ￣１
π ＝ ０.０００ ７８)、毕节纳雍 ＢＪＮＹ 居群(Ｈｄ ＝ ０.７１４ ３ꎬ 是群体遗传构成的最主要单倍型ꎬ推测 Ｈ￣１ 为古
π ＝ ０.０００ ８４) 和毕节黔西 ＢＪＱＸ 居群( Ｈｄ ＝ ０.６７０ 老单倍型ꎻ其次是单倍型 Ｈ￣６ꎬ在 １６ 个居群中广泛
３ꎬπ ＝ ０.０００ ８４) 表现出较高的遗传多样性ꎮ 遗传 分布ꎮ 单倍型 Ｈ￣４ 和单倍型 Ｈ￣５ 均是安顺普 定
多样性水平最低的是云南曲靖 ＹＮＱＪ 居群和黔东 ＡＳＰＤ 居群和毕节织金 ＢＪＺＪ 居群共有ꎻ单倍型 Ｈ￣３
南雷山 ＱＤＮＬＳ 居群(Ｈｄ、π 均为 ０)ꎮ 只分 布 在 安 顺 紫 云 ＡＳＺＹ 居 群 中ꎬ 毕 节 七 星 关
对 ３ 段叶绿体基因 ( ａｔｐＦ － ｔｒｎＨ、ｔｒｎＬ － ｔｒｎＦ 和 ＢＪＱＸＧ 拥有最多的特有单倍型( Ｈ￣８、Ｈ￣１０、Ｈ￣１１
ｔｒｎＧ－ｔｒｎＳ) 序列进行拼接后的总长度为 １ ８６５ ｂｐꎬ 和 Ｈ￣１２ꎬ共 ４ 个特有单倍型)ꎬ单倍型 Ｈ￣１３ 分布在
ＡＴ 含量为 ７１.９２％ ~ ７２.２２％ꎬ碱基组成具有明显的 遵义湄潭 ＺＹＭＴ 居群中ꎬ重庆酉阳 ＣＱＹＹ 居群存
Ａ/ Ｔ 偏好性ꎬ这与大多数叶绿体基因的碱基组成成 在特有单倍型 Ｈ￣１４ꎬ单倍型 Ｈ￣１５ 只分布在云南大
分一致ꎮ 其中ꎬ共检测到 ２０ 个核苷酸变异位点ꎬ简 理 ＹＮＤＬ 居群中ꎬ黔东南黄平 ＱＤＮＨＰ 居群存在特
约性的信息位点 １２ 个ꎬ单一突变位点 ８ 个ꎮ 变异位 有单倍型 Ｈ￣１６ꎬ单倍型 Ｈ￣１７ 分布在毕节金沙 ＢＪＪＳ
点分别为 ５５、８８、１４２、１７５、２０９、３４４、４１５、４２３、４３０、 居群中ꎬ单倍型 Ｈ￣１８ 分布在毕节大方 ＢＪＤＦ 居群
５４５、５５６、５７３、５９０、５９１、６５６、６９６、９６７、１ ２２７、１ ５９２ 中ꎬ毕节纳雍 ＢＪＮＹ 居群存在 ２ 个特有单倍型 Ｈ￣１９
和 １ ７４０ꎮ 将 序 列 提 交 至 ＧｅｎｅＢａｎｋꎬ 序 列 号 为 和 Ｈ￣２０ꎮ 其余单倍型均分布在多个居群中(表 ４)ꎮ
ＯＰ５２６９７５~ ＯＰ５２６９９４ꎬＯＰ５４５８８３~ ＯＰ５４５９２２ꎮ 拼接 基于单拷贝核基因检测到的 １５ 个单倍型构建
序列检测到单倍型数量(Ｈ) ２０ 个ꎮ 总体的遗传多 单倍型网络图( 图 ２ꎬ图 ３)ꎮ 由图 ２ 可知ꎬ以单倍
样性水平不高(Ｈｄ ＝ ０.６５３ ４ꎬπ ＝ ０.０００ ６５)ꎬ但不同 型 Ｒ￣１ 为中心向四周发散ꎬ与单倍型 Ｒ￣３、Ｒ￣４、Ｒ￣
刺梨居群间存在较大差异(Ｈｄ ＝ ０ ~ ０.８００ ０ꎬπ ＝ ０ ~ ６、Ｒ￣８、Ｒ￣１０ 和 Ｒ￣１３ 以一种突变步的方式直接相
０.００１ ２９)ꎬ在所有居群中毕节纳雍 ＢＪＮＹ 居群(Ｈｄ ＝ 连ꎬ又各自发生分化ꎬ构成一个四边形ꎮ 单倍型 Ｒ￣
０.８００ ０ꎬπ ＝ ０.０００ ８６)、毕节大方 ＢＪＤＦ 居群( Ｈｄ ＝ １０ 分化出 Ｒ￣１２ 和 Ｒ￣１５ 分别与 Ｒ￣３ 和 Ｒ￣８ 相连ꎮ
０.７３６ ３ꎬπ ＝ ０.０００ ７４) 和毕节七星关 ＢＪＱＸＧ 居群 单倍型 Ｒ￣７ 单独分化出 Ｒ￣２ꎮ 同时ꎬ网状进化图出
(Ｈｄ ＝ ０.６９２ ３ꎬπ ＝ ０.００１ ２９) 的遗传多样性水平较 现多个环状结构ꎬ说明核基因重组事件的发生ꎮ
高ꎮ 由此可见在西南地区中ꎬ毕节地区刺梨的遗传 基于叶绿体基因所检测到的 ２０ 个单倍型进行
多样性较高ꎬ表明该地区野生刺梨的遗传信息较丰 单倍型网络分析( 图 ４ꎬ图 ５)ꎮ 由图 ４ 可知ꎬ２０ 个
富ꎮ 遗传多样性水平最低的是湖北宜昌 ＨＢＹＣ 居 单倍型在单倍型网络构建图中呈散射分布ꎬ可分
群和四川凉山 ＳＣＬＳ 居群(Ｈｄ、π 均为 ０)ꎮ 为 Ｈ￣１ 和 Ｈ￣９ 两个分支ꎬ每个分支又各自分化ꎮ
２.２ 单倍型多样性分析 一支以单倍型 Ｈ￣１ 为中心ꎬ与单倍型 Ｈ￣３、Ｈ￣４、Ｈ￣
基于单拷贝核基因的拼接序列ꎬ２７ 个居群得到 ５、Ｈ￣７、Ｈ￣１３、Ｈ￣１４ 和 Ｈ￣１６ 以一种突变步的方式
１５ 个单倍型ꎮ 其中ꎬ单倍型 Ｒ￣１ 分布最广ꎬ在所有 直接相连并聚为一类ꎻ另一支以 Ｈ￣９ 为中心ꎬ与 Ｈ￣
居群中均有分布ꎬ意味着单倍型 Ｒ￣１ 是主要单倍型ꎬ ２、Ｈ￣６、Ｈ￣８、 Ｈ￣１０、 Ｈ￣１１、 Ｈ￣１２、 Ｈ￣１４、 Ｈ￣１５、 Ｈ￣１８、
推测 Ｒ￣１ 为古老单倍型ꎬ其次为单倍型 Ｒ￣３ꎬ分布在 Ｈ￣１９ 和 Ｈ￣２０ 聚 类 在 一 起ꎬ 包 括 毕 节 七 星 关
１５ 个群体中ꎬ为优势单倍型ꎮ 安顺平坝 ＡＳＰＢ 居群 ＢＪＱＸＧ、毕节大方 ＢＪＤＦ 和毕节纳雍 ＢＪＮＹ 居群的
和毕节黔西 ＢＪＱＸ 居群共有单倍型 Ｒ￣７ꎬ单倍型 Ｒ￣９ 特有单倍型ꎬ表明这一支主要以毕节地区为主ꎮ
为分布在居群毕节纳雍 ＢＪＮＹ 和铜仁梵净山 ＴＲＦＪＳ 特有单倍型主要位于图的外侧ꎬ说明是最晚发生
中ꎬ毕节纳雍 ＢＪＮＹ 居群与黔东南黄平 ＱＤＮＨＰ 居群 突变的单倍型ꎬ并且还存在缺失单倍型ꎬ可能是未
共有单倍型 Ｒ￣１２ꎮ 单倍型 Ｒ￣５ 只分布在安顺普定 收集到或在进化过程中丢失ꎮ
