Page 62 - 《广西植物》2023年第11期
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2 0 2 2 广 西 植 物 43 卷
表 8 桃叶珊瑚属 6 种植物叶绿体 叶珊瑚属植物系统全面的属下分类系统的构建和
基因组 10 个高变区信息 属下种间关系的解决有赖于更广泛的采样ꎬ更多
Table 8 Ten hypervariable regions information of 的性状证据(尤其是染色体数据) 和更丰富的具足
chloroplast genomes of six Aucuba species 够变异位点的单拷贝核基因和叶绿体基因组的联
片段长度 核苷酸 分布区域 合分析建树ꎬ来共同厘清桃叶珊瑚属的属下分类
序号 片段
Fragment 多样性 Distribution
Number Fragment 问题ꎬ为以后深入研究桃叶珊瑚属植物的药用和
size (bp) P i region
园艺用途等奠定分类学基础ꎮ
1 rps16 1 132 ~ 1 139 0.017 22 LSC
致谢 特别感谢河北师范大学石硕老师在黄
2 rps16 ̄trnQ ̄UUG 1 739 ~ 1 794 0.012 22 LSC
杨叶 丝 缨 花 分 子 样 品 收 集 工 作 中 给 予 的 大 力
3 rpoB ̄trnC ̄GCA 1 251 ~ 1 267 0.011 78 LSC
帮助ꎮ
4 petN ̄psbM 1 152 ~ 1 172 0.014 78 LSC
5 trnC ̄GCA ̄petN 700 ~ 830 0.011 33 SSC
参考文献:
6 psbM ̄trnD ̄GUC 1 172 ~ 1 192 0.010 33 LSC
7 accD ̄psaI 685 ~ 704 0.012 56 LSC
ADEYEMO OAꎬ AYODELE OOꎬ AJISAFE MOꎬ et al.ꎬ
8 ndhE 306 0.016 67 SSC
2021. Evaluation of dark jute SSR markers and morphological
9 ndhE ̄ndhG 227 0.010 78 SSC traits in genetic diversity assessment of jute mallow
(Corchorus olitorius L.) cultivars [J]. S Afr J Botꎬ 137:
10 ycf1 5 670 ~ 5 691 0.018 89 SSC
290-297.
分支上的数字分别为自展支持率和贝叶斯后验概率ꎮ
Numbers above the branches are the bootstrap values and Bayesian posterior probabilities.
图 8 基于丝缨花目 9 条叶绿体全基因组构建的系统发育树(ML 和 BI)
Fig. 8 Phylogenetic relationships inferred from maximum likelihood and Bayesian inference
based on nine Garryales chloroplast genome datasets
AI TMꎬ 2013. Medicinal flora of China [M]. Beijing: Peking angiosperm phylogeny group classification for the orders and
University Medicinal Pressꎬ 7: 279 - 287. [ 艾 铁 民ꎬ families of flowering plants: APG IV [J]. Bot J Linn Socꎬ
2013. 中国药用植物志 [M]. 北京: 北京大学医学出版 181(1): 1-20.
社ꎬ 7: 279-287.] BASIC Gꎬ 2012. An integrated and extendable desktop software
ALI AMIRYOUSEFIꎬ JAAKKO HYVÖNENꎬ et al.ꎬ 2018. platform for the organization and analysis of sequence data
IRscope: an online program to visualize the junction sites of [J]. Bioinformaticsꎬ 28(12): 1647-1649.
chloroplast genomes [ J ]. Bioinformaticsꎬ 17(34): BEIER Sꎬ THIEL Tꎬ MÜNCH Tꎬ et al.ꎬ 2017. MISA ̄web: a
3030-3031. web server for microsatellite prediction [J]. Bioinformaticsꎬ
ANGIOSPERM PHYLOGENY GROUPꎬ CHASE MWꎬ 33(16): 2583-2585.
CHRISTENHUSZ MJMꎬ et al.ꎬ 2016. An update of the BENSON Gꎬ 1999. Tandem repeats finder: a program to analyze