Page 59 - 《广西植物》2023年第11期

１１ 期 李娟等: 桃叶珊瑚属植物的叶绿体基因组结构特征及系统发育分析 ２ ０ １ ９

图 ４ 桃叶珊瑚属 ６ 种植物叶绿体基因组 ＬＳＣ、ＩＲ 和 ＳＳＣ 边界比较示意图
Ｆｉｇ. ４ Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ＬＳＣꎬ ＩＲ ａｎｄ ＳＳＣ ｂｏｕｎｄａｒｉｅｓ ｉｎ ｃｈｌｏｒｏｐｌａｓｔ ｇｅｎｏｍｅｓ ｏｆ ｓｉｘ Ａｕｃｕｂａ ｓｐｅｃｉｅｓ

４.２ 叶绿体基因组的结构比较分析 支ꎬ峨眉桃叶珊瑚、密花桃叶珊瑚以及桃叶珊瑚共
比较基因组学分析结果表明ꎬ桃叶珊瑚属叶 同组成进化支Ⅰꎬ共同的特征为乔木、花绿色ꎻ花
绿体基因组序列具有高度的相似性ꎬ单拷贝区比 叶青木、青木、纤尾桃叶珊瑚以及窄斑叶珊瑚共同
反向重复区更为保守ꎬ编码区比非编码区更为保 组成进化支Ⅱꎬ共同的特征为灌木、花红色ꎮ 这两
守ꎻ叶绿体基因组 ＩＲ / ＳＣ 边界分布的基因类型完 组特征是否分别稳定地成为两个进化支的共衍特
全相同ꎻ基因组基因结构和排列顺序整体上相似ꎬ 征ꎬ还需该属更多种类和居群的支持ꎮ 在进化支
所有基因的种类、数量和排列顺序均高度一致ꎬ６ Ⅱ内部ꎬ花叶青木和青木聚为一支ꎬ亲缘关系较
条序列完全共线ꎬ没有重排重组现象发生ꎻ根据课 近ꎮ 通过回溯花叶青木与青木的叶绿体全基因组
题组前期研究(未发表) 发现ꎬ目前通用的 ＤＮＡ 条 序列ꎬ发现这两条叶绿体基因组序列ꎬ无论是基因
形码片段( ｐｓｂＡ－ｔｒｎＨꎬｒｂｃＬꎬｍａｔＫꎬＩＴＳꎬＩＴＳ２) 及其 数量还是基因位置ꎬ都保持高度一致ꎬ仅在基因间
片段组合的变异程度不理想ꎬ对桃叶珊瑚属植物 隔区存在 ４ 个碱基位点的变异ꎮ 这也在一定程度
的物种分辨率不高ꎬ不适合作为该属植物的通用 上印证了 Ｒａｎｎｅｙ 的观点———青木中表达的斑点叶
条形码ꎬ本文从桃叶珊瑚属叶绿体基因组 ＬＳＣ 区 性状很可能是一个具有多重等位基因和数量遗传
和 ＳＳＣ 区共筛选出 １０ 个变异率较高ꎬ长度适中的 的核基因ꎬ而不是严格的母系遗传ꎬ可能有多个具
高变片段ꎬ这些高变区可作为桃叶珊瑚属物种鉴 有不同遗传模式的基因可以产生桃叶珊瑚属植物
定的潜在条形码ꎬ可以进一步结合双亲遗传的核 带斑叶 的 性 状 ( Ｒａｎｎｅｙ ｅｔ ａｌ.ꎬ２０１８)ꎮ 因 此ꎬ “ 花
基因片段联合分析ꎬ为桃叶珊瑚属植物的物种鉴 叶”表现型ꎬ在桃叶珊瑚属类群中并不是一个稳定
定ꎬ杂交起源ꎬ多倍体物种的形成和系统进化分析 可靠的性状ꎬ基于“ 花叶” 特征建立的变种或新种
提供可靠的分子标记ꎮ 划分需格外谨慎ꎮ
４.３ 系统发育分析 向秋云在 ＦＯＣ 中将峨眉桃叶珊瑚归并入原变
系统发育分析结果表明ꎬ桃叶珊瑚属为一个 种桃叶珊瑚(Ｘｉａｎｇ ＆ Ｂｏｕｆｆｏｒｄꎬ ２００５)ꎬ本研究系统
支持率高的单系( ＢＳ ＝ １００％ꎬ ＰＰ ＝ １)ꎬ与丝缨花 发育分析结果表明峨眉桃叶珊瑚与密花桃叶珊瑚
属亲缘关系较近ꎬ共同构成丝缨花科ꎻ丝缨花科与 关系 更 近ꎬ 二 者 再 与 桃 叶 珊 瑚 构 成 姐 妹 群ꎮ

杜仲科关系较近ꎬ这与分类系统 ＡＰＧ Ⅳ和 Ｈｕａｎｇ Ｒａｎｎｅｙ 使用流式细胞仪对桃叶珊瑚属植物的相对
等(２０２２)的研究结果一致ꎮ 基因组大小进行了研究ꎬ发现峨眉桃叶珊瑚的 １Ｃｘ
桃叶珊瑚属属内分化为两个支持率高的进化 值 (１０.６ ｐｇ)显著高于包括桃叶珊瑚 (７.３７ ｐｇ)在