Page 92 - 《广西植物》2023年第11期
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Ｇｕｉｈａｉａ Ｎｏｖ. ２０２３ꎬ ４３(１１): ２０５２－２０６４
ＤＯＩ: １０.１１９３１/ ｇｕｉｈａｉａ.ｇｘｚｗ２０２２０７０４４
田怀志ꎬ 郭豪ꎬ 田浩ꎬ 等ꎬ ２０２３. 水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记开发 [ Ｊ]. 广西植物ꎬ ４３(１１):
２０５２－２０６４.
ＴＩＡＮ ＨＺꎬ ＧＵＯ Ｈꎬ ＴＩＡＮ Ｈꎬ ｅｔ ａｌ.ꎬ ２０２３. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｃａｐｓｉｃｕｍ
ａｎｎｕｕｍ ｕｎｄｅｒ ｗａｔｅｒｌｏｇｇｉｎｇ ｓｔｒｅｓｓ [Ｊ]. Ｇｕｉｈａｉａꎬ ４３(１１): ２０５２－２０６４.
水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记开发
田怀志 ꎬ 郭 豪 ꎬ 田 浩 ꎬ 熊兴伟 ꎬ 张素勤 ꎬ 耿广东 １ꎬ３∗
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( １. 贵州大学 农学院ꎬ 贵阳 ５５００２５ꎻ ２. 遵义市农业科学研究院ꎬ 贵州 遵义 ５６３０００ꎻ ３. 贵州大学辣椒产业技术研究院ꎬ 贵阳 ５５００２５ )
摘 要: 为开发适当的生物学工具以探索辣椒对水涝胁迫应答的分子机制ꎬ该研究对不同淹水处理的辣椒
样本进行转录组分析ꎬ获得了丰富的序列数据ꎬ并在此基础上对 ＳＳＲ 分子标记进行挖掘ꎮ 结果表明:(１)辣
椒转录组检测共获得 １２８ ９３９ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅꎬ其总长度、平均长度和 ＧＣ 含量分别是 ５５ ０８２ ７２５、１ １０１ ｂｐ 和
４０.５７％ꎮ 与七大功能数据库进行比较ꎬ分别有 １０２ １２３ 个(ＮＲꎬ ７９.２０％)、１１０ １５７ 个(ＮＴꎬ ８５.４３％)、７０ ２０３
个(ＳｗｉｓｓＰｒｏｔꎬ ５４.４５％)、７３ ５３９ 个(ＫＯＧꎬ ５７.０３％)、７７ ６４６ 个(ＫＥＧＧꎬ ６０.２２％)、７７ ４４２ 个(ＧＯꎬ ６０.０６％)以
及 ６８ ２１６ 个(Ｐｆａｍꎬ ５２.９１％)Ｕｎｉｇｅｎｅ 获得功能注释ꎮ 发现脂质代谢、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、环境适
应、次级代谢物生物合成、信号转导和翻译等途径在辣椒水涝胁迫应答中起重要作用ꎮ (２)从辣椒转录组数
据中发掘到 ２６ ５７４ 个 ＳＳＲ 位点分布在 ２４ ８８９ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅ 中ꎮ ＳＳＲ 的出现频率为 ２０.６１％ꎬ其中单核苷酸重
复所占比例(３７.２６％)最高ꎬ其次是三核苷酸(３１.００％)和二核苷酸(２５.４４％) 重复类型ꎬ三者占 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 总
数的 ９３.７０％ꎮ 在单核苷酸与二核苷酸中最多的基序类型为 Ａ / Ｔ、ＡＧ / ＣＴ 和 ＴＣ / ＧＡꎬ其次是 ＡＴ 和 ＴＡꎻ三核
苷酸中最常见的基序类型是 ＴＴＧ / ＣＡＡ 和 ＡＣＡ / ＴＧＴꎮ (３)用 Ｐｒｉｍｅｒ ３ 在线工具设计了 １０ ００２ 对 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 引
物ꎬ随机选择 ３０ 对引物进行 ＰＣＲ 扩增ꎬ均可获得有效扩增ꎮ 对 ３ 份辣椒材料进行扩增ꎬ其中 ７ 对引物可以
扩增出目标条带ꎮ 综上所述ꎬ在辣椒中优势 ＳＳＲ 重复类型的基序结构和其他品种基本相近ꎬ并初步探索了
辣椒水涝胁迫应答的分子机制ꎬ开发了 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记ꎬ为辣椒耐涝遗传育种提供了参考ꎮ
关键词: 辣椒ꎬ 水涝胁迫ꎬ 响应机制ꎬ 转录组ꎬ ＥＳＴ￣ＳＳＲ
中图分类号: Ｑ９４３ 文献标识码: Ａ 文章编号: １０００￣３１４２(２０２３)１１￣２０５２￣１３
Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｏｍｅ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ａｎａｌｙｓｉｓ ａｎｄ ＥＳＴ￣ＳＳＲ ｍａｒｋｅｒ
ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｏｆ Ｃａｐｓｉｃｕｍ ａｎｎｕｕｍ ｕｎｄｅｒ ｗａｔｅｒｌｏｇｇｉｎｇ ｓｔｒｅｓｓ
１ １ ２ １
ＴＩＡＮ Ｈｕａｉｚｈｉ ꎬ ＧＵＯ Ｈａｏ ꎬ ＴＩＡＮ Ｈａｏ ꎬ ＸＩＯＮＧ Ｘｉｎｇｗｅｉ ꎬ
１ １ꎬ３∗
ＺＨＡＮＧ Ｓｕｑｉｎ ꎬ ＧＥＮＧ Ｇｕａｎｇｄｏｎｇ
( １. Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒｅꎬ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｇｕｉｙａｎｇ ５５００２５ꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ２. Ｚｕｎｙｉ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓꎬ Ｚｕｎｙｉ ５６３０００ꎬ
Ｇｕｉｚｈｏｕꎬ Ｃｈｉｎａꎻ ３. Ｉｎｄｕｓｔｒｉａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｐｅｐｐｅｒꎬ Ｇｕｉｚｈｏｕ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬ Ｇｕｉｙａｎｇ ５５００２５ꎬ Ｃｈｉｎａ )
收稿日期: ２０２２－１１－１０
基金项目: 国家自然科学基金(３２２６０７６０)ꎻ 贵州省科技计划资助项目(２０２２０５０ꎬ ２０２０１Ｚ００２ꎬ ２０２１０６３ꎬ ２０２０２１０２)ꎻ 贵州省农业
农村厅资助项目(黔财农[２０２２]８９ 号)ꎮ
第一作者: 田怀志(１９９６－)ꎬ硕士研究生ꎬ研究方向为蔬菜生理生态与生物技术ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｚｈｉｈｕａｉｔｉａｎ＠ １６３.ｃｏｍꎮ
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通信作者: 耿广东ꎬ博士ꎬ教授ꎬ研究方向为蔬菜生理生态与生物技术ꎬ(Ｅ￣ｍａｉｌ)ｇｅｎｇｇｄ２１３＠ １６３.ｃｏｍꎮ
