Page 96 - 《广西植物》2023年第11期
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２ ０ ５ ６ 广 西 植 物 ４３ 卷
将水涝胁迫与对照相比的 ＤＥＧｓ 进行 ＧＯ 功
能注释ꎮ 共有 ４３ ４４６ 个 ＤＥＧｓ 被注释在 ＧＯ 数据
库中(图 ２)ꎬ可分成分子功能、细胞组分以及生物
过程三大类ꎮ 分子功能中主要方面是结合、催化
活性及转运蛋白活性ꎮ 细胞组分中主要方面是细
胞解剖实体、细胞内以及蛋白质复合物ꎮ 在生物
过程中细胞过程占据主导地位ꎬ其次是代谢过程
和生物调节ꎮ １３ ７０２ 个 ＤＥＧｓ 被注释到 ＫＥＧＧ 通
路中( 图 ３)ꎮ 其中碳水化合物代谢、脂质代谢与
氨基酸代谢是主要的代谢途径ꎮ 与代谢相关的
ＤＥＧｓ 有 ８ ４０４ 个ꎬ包含碳水化合物(１６.５２％)、氨
１. 结合ꎻ ２. 催化活性ꎻ ３. 转运蛋白活性ꎻ ４. 结构分子活
基酸(９.２２％)、脂质(７.０３％)、其他次级代谢物的
性ꎻ ５. 转录调节活性ꎻ ６. 分子功能调节活性ꎻ ７. 抗氧化活
生物合成(６.０８％)以及能量代谢(４.９９％)等ꎻ在遗 性ꎻ ８. 翻 译 调 节 活 性ꎻ ９. 分 子 换 能 器 活 性ꎻ １０. 其 他ꎻ
传信息处理中ꎬ主要为翻译和折叠、分类和降解以 １１. 细胞解剖实体ꎻ １２. 细胞内ꎻ １３. 蛋白质复合物ꎻ １４. 细
及转录 ３ 个过程ꎻ在环境信息处理途径中主要是 胞过程ꎻ １５. 代谢过程ꎻ １６. 生物调节ꎻ １７. 对刺激的反应ꎻ
１８. 生物过程的调节ꎻ １９. 定位ꎻ ２０. 发育过程ꎻ ２１. 信号传
信号转导与跨膜运输ꎻ运输和分解代谢及环境适 导ꎻ ２２. 多细胞生物过程ꎻ ２３. 繁殖ꎻ ２４. 繁殖过程ꎻ ２５. 生
应是细胞过程和有机系统中的主要途径ꎮ 这说明 物过程负调节ꎻ ２６. 生物过程正 调 节ꎻ ２７. 多 生 物 过 程ꎻ
在淹水过程中辣椒受到碳水化合物代谢、脂质代 ２８. 生物间的相互作用ꎻ ２９. 增长ꎻ ３０. 其他ꎮ
１. Ｂｉｎｄｉｎｇꎻ ２. Ｃａｔａｌｙｔｉｃ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ３. Ｔｒａｎｓｐｏｒｔｅｒ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
谢、氨基酸代谢、信号转导等途径的协同作用ꎬ这
４. Ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｍｏｌｅｃｕｌｅ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ５. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
些通 路 可 能 在 辣 椒 水 涝 胁 迫 应 答 中 起 到 重 要 ６. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ７. Ａｎｔｉｏｘｉｄａｎｔ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
８. Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ ｒｅｇｕｌａｔｏｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ ９. Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｔｒａｎｓｄｕｃｅｒ ａｃｔｉｖｉｔｙꎻ
作用ꎮ
１０. Ｏｔｈｅｒꎻ １１. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ａｎａｔｏｍｉｃａｌ ｅｎｔｉｔｙꎻ １２. Ｉｎｔｒａｃｅｌｌｕｌａｒꎻ １３.
２.３ ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的长度统计
Ｐｒｏｔｅｉｎ ｃｏｍｐｌｅｘꎻ １４. Ｃｅｌｌｕｌａｒ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ １５. Ｍｅｔａｂｏｌｉｃ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ
ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的长度范围为 １２ ~１１０ ｂｐꎬ其中 １２ ｂｐ １６. Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎꎻ １７. Ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｓｔｉｍｕｌｕｓꎻ １８. Ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ
和 １５ ｂｐ 分布最多ꎬ分别有 ５ ３３１ 个(２０. ０６％) 和 ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ １９. Ｌｏｃａｌｉｚａｔｉｏｎꎻ ２０. Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ
２１. Ｓｉｇｎａｌｉｎｇꎻ ２２. Ｍｕｌｔｉｃｅｌｌｕｌａｒ ｏｒｇａｎｉｓｍａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ２３.
５ ５２３个(２０.７８％) ＳＳＲ 位点(图 ４)ꎮ 在单核苷酸和
Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｏｎꎻ ２４. Ｒｅｐｒｏｄｕｃｔｉｖｅ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ２５. Ｎｅｇａｔｉｖｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ
二核苷酸中ꎬ最常见的片段长度为 １２ ｂｐꎬ在单核苷 ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ ２６. Ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｒｅｇｕｌａｔｉｏｎ ｏｆ ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓꎻ
酸中有 ２ ９０９ 个(１０.９５％)位点ꎬ二核苷酸中有２ ４２２ ２７. Ｍｕｌｔｉｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ ｐｒｏｃｅｓｓｅｓꎻ ２８. Ｉｎｔｅｒｓｐｅｃｉｅｓ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ
ｏｒｇａｎｉｓｍｓꎻ ２９. Ｇｒｏｗｔｈꎻ ３０. Ｏｔｈｅｒ.
个(９.１１％)位点ꎮ 单核苷酸和二核苷酸最长的片段
分别是 １０２ ｂｐ 和 ９６ ｂｐꎮ 在三核苷酸中ꎬ主要长度 图 ２ 辣椒 ＤＥＧｓ 的 ＧＯ 注释
Ｆｉｇ. ２ ＧＯ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｈｏｔ ｐｅｐｐｅｒ ＤＥＧｓ
类 型 是 １５ ｂｐ 和 １８ ｂｐꎬ 二 者 分 别 有 ４ ５１０ 个
(１６.９７％)个和 １ ９４５ 个(７.３２％)位点ꎬ二者占三核
苷酸位点总数的 ７８.３６％ꎮ 四核苷酸及五核苷酸均 位点ꎬＳＳＲ 位点出现频率(ＳＳＲ 数目占 Ｕｎｉｇｅｎｅ 总数
以 ２０ ｂｐ 为主ꎬ 分别有 ２３５ 个 ( ０. ８８％) 和 ３４０ 个 百分 比) 为 ２０. ６１％ꎬ ＳＳＲ 发 生 频 率 ( 含 ＳＳＲ 的
(１.２８％)位点ꎮ 六核苷酸中最长的为 ９０ ｂｐꎬ检测到 Ｕｎｉｇｅｎｅ 数占 Ｕｎｉｇｅｎｅ 总数百分比) 为 １９.３０％ꎮ 从
４ 个位点ꎬ２４ ｂｐ 占绝大多数(５６８ꎬ２.１４％)ꎮ 在本研 表 ４ 可以看出ꎬ辣椒 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 序列主要以 ４ ~ １０ 次
究中ꎬＳＳＲ 有 ６ ０１８ 条 ＳＳＲ 的长度大于 ２０ ｂｐꎬ占 重复为主ꎬ共 １５ ４１１ 个ꎬ占总 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的 ５７.９９％ꎻ
ＳＳＲ 总数的 ２２.６５％ꎻ２０ ５５６ 条 ＳＳＲ 分布于 １２ ~ １９ 其次是 １１~２０ 次重复ꎬ共 １０ １２５ 个ꎬ占总 ＥＳＴ￣ＳＳＲ
的 ３８.１０％ꎻ２０ 次以上的重复较少ꎬ共 １ ０３８ 个ꎬ占总
ｂｐ 之间ꎬ占 ＳＳＲ 总数的 ７７.３５％ꎮ
２.４ ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的频率和分布特点 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 的 ３.９１％ꎮ 在已鉴定的 ＳＳＲ 中ꎬ单核苷酸
基序 ＳＳＲ 最丰富(９ ９０２ꎬ３７.２６％)ꎬ其次是三核苷酸
使用 ＭＩＳＡ Ｖ１.０ 在线软件对所有的 Ｕｎｉｇｅｎｅ
进行 ＳＳＲ 位点检测ꎬ共发现 ２６ ５７４ 个 ＳＳＲ 位点分 (８ ２３８ꎬ３１.００％)、二核苷酸(６ ７６０ꎬ２５.４４％)、六核
苷酸(８３８ꎬ３.１５％)、五核苷酸(４６６ꎬ１.７５％) 和四核
布在 ２４ ８８９ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅ 中ꎬ其中 ２３ ４５１ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅ
含有单一 ＳＳＲꎬ１ ４３８ 个 Ｕｎｉｇｅｎｅ 包含 ３ １２３ 个 ＳＳＲ 苷酸(３７０ꎬ１.３９％)的基序 ＳＳＲꎮ
