Page 97 - 《广西植物》2023年第11期

１１ 期 田怀志等: 水涝胁迫下辣椒转录组特征分析及 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 标记开发 ２ ０ ５ ７

１. 核苷酸代谢ꎻ ２. 聚糖生物合成和代谢ꎻ ３. 萜类和聚酮类的代谢ꎻ ４. 辅因子和维生素的代谢ꎻ ５. 其他氨基酸的代谢ꎻ ６. 能量代
谢ꎻ ７. 其他次级代谢产物的生物合成ꎻ ８. 脂质代谢ꎻ ９. 氨基酸代谢ꎻ １０. 碳水化合物代谢ꎻ １１. 全局和概览图ꎻ １２. 复制和修复ꎻ
１３. 转录ꎻ １４. 折叠、分类和降解ꎻ １５. 翻译ꎻ １６. 膜运输ꎻ １７. 信号转导ꎻ １８. 运输和分解代谢ꎻ １９. 环境适应ꎮ
１. Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ ２. Ｇｌｙｃａｎ ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ａｎｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ ３. Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｏｆ ｔｅｒｐｅｎｏｉｄｓ ａｎｄ ｐｏｌｙｋｅｔｉｄｅｓꎻ ４. Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｏｆ ｃｏｆａｃｔｏｒｓ ａｎｄ
ｖｉｔａｍｉｎｓꎻ ５. Ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍ ｏｆ ｏｔｈｅｒ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓꎻ ６. Ｅｎｅｒｇｙ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ ７. Ｂｉｏｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ ｏｔｈｅｒ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｍｅｔａｂｏｌｉｔｅｓꎻ ８. Ｌｉｐｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ
９. Ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ １０. Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ ｍｅｔａｂｏｌｉｓｍꎻ １１. Ｇｌｏｂａｌ ａｎｄ ｏｖｅｒｖｉｅｗ ｍａｐｓꎻ １２. Ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ ｒｅｐａｉｒꎻ １３. Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎꎻ
１４. Ｆｏｌｄｉｎｇꎬ ｓｏｒｔｉｎｇ ａｎｄ ｄｅｇｒａｄａｔｉｏｎꎻ １５. Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎꎻ １６. Ｍｅｍｂｒａｎｅ ｔｒａｎｓｐｏｒｔꎻ １７. Ｓｉｇｎａｌ ｔｒａｎｓｄｕｃｔｉｏｎꎻ １８. Ｔｒａｎｓｐｏｒｔ ａｎｄ ｃａｔａｂｏｌｉｓｍꎻ
１９. Ｅｎｖｉｒｏｎｍｅｎｔａｌ ａｄａｐｔａｔｉｏｎ.
图 ３ 辣椒 ＤＥＧｓ 的 ＫＥＧＧ 注释
Ｆｉｇ. ３ ＫＥＧＧ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ ｈｏｔ ｐｅｐｐｅｒ ＤＥＧｓ

表 ３ 单基因功能注释 ２.５ ＥＳＴ￣ＳＳＲ 基序重复类型和频率特征
Ｔａｂｌｅ ３ Ｆｕｎｃｔｉｏｎ ａｎｎｏｔａｔｉｏｎ ｏｆ Ｕｎｉｇｅｎｅ 从辣 椒 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 核 苷 酸 的 基 序 类 型 来 看ꎬ
数据库 基因数量 比例 ＥＳＴ￣ＳＳＲ 以单核苷酸为主要类型ꎬ约 ９ ９０２ 个ꎬ占
Ｄａｔａｂａｓｅ Ｎｕｍｂｅｒ ｏｆ ｇｅｎｅｓ Ｒａｔｉｏ (％)
总 ＳＳＲ 的 ３７. ２６％ꎬ 其 次 是 三 核 苷 酸 ８ ２３８ 个
ＮＲ １０２ １２３ ７９.２０
(３１.００％)和二核苷酸 ６ ７６０ 个(２５.４４％)ꎬ三者共
ＮＴ １１０ １５７ ８５.４３
占检测出的 ＳＳＲ 总数的 ９３.７０％ꎮ 在单核苷酸中ꎬ
ＳｗｉｓｓＰｒｏｔ ７０ ２０３ ５４.４５
Ａ / Ｔ 是主要类型ꎬ占全部单核苷酸的 ９５.５８％ꎬ其
ＫＯＧ ７３ ５３９ ５７.０３
次为三核苷酸ꎬ以 ＴＴＧ / ＣＡＡ、ＡＣＡ / ＴＧＴ 为主要类
ＫＥＧＧ ７７ ６４６ ６０.２２
型ꎬ分别占三核苷酸 ＳＳＲ 的 １８.１０％、１２.７１％ꎮ 在
ＧＯ ７７ ４４２ ６０.０６
Ｐｆａｍ ６８ ２１６ ５２.９１ 二核苷酸中ꎬ 以 ＡＧ / ＣＴ、ＴＣ / ＧＡ、ＡＴ 和 ＴＡ 的比例