Page 96 - 《广西植物》2024年第10期
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1 8 9 8                                广  西  植  物                                         44 卷
                                               表 1  样本测序数据及其质控
                                      Table 1  Sample sequencing data and its quality control
                                                                  序列平均长度
                                                        序列碱基数
                     样本            原始序列       有效序列       Number of   Average   质量值        GC 含量      利用率
                                                                    length of   Q20      GC content  Use efficiency
                     Sample        Raw reads  Clean reads  sequence
                                                                    sequence    (%)        (%)        (%)
                                                           bases
                                                                     (bp)
                细菌         Ab       83 359     80 054   32 126 180    401       78.12      55.19     96.05
              Bacterium
                           Aj       81 920     80 147   32 116 929    400       77.29      55.57     97.83
                           Bb       82 652     80 071   32 731 291    408       72.65      54.99     96.88
                           Bj       81 654     80 079   32 559 142    406       70.24      55.49     98.07
                           Cb       83 833     80 106   32 528 325    406       69.94      54.71     95.64
                           Cj       81 902     80 096   32 246 736    402       77.69      55.56     97.79
                真菌         Ab       74 998     74 697   20 947 741    280       77.86      57.71     99.60
               Fungus
                           Aj       57 883     57 698   17 025 787    295       76.90      59.28     99.68
                           Bb       79 268     77 455   19 019 860    246       77.37      52.51     97.82
                           Bj       68 573     68 346   19 933 811    292       76.76      59.16     99.68
                           Cb       81 101     80 085   18 928 691    236       79.87      52.31     98.76
                           Cj       62 886     62 601   17 935 754    284       74.93      58.16     99.53



                健康和病斑组织的真菌群落主要为子囊菌门                            (Plectosphaerella) 和锥盖伞属( Conocybe)ꎬ其病斑
            (Ascomycota) 和 担 子 菌 门 ( Basidiomycota) ( 图 3:     组织的相对丰度高于健康组织ꎬ但无显著性差异
            B)ꎮ 其相对丰度病斑组织高于健康组织ꎬ其中重                            (图 4:B)ꎬ而茎点霉属( Phoma) 在健康组织的相
            度病叶病斑组织与健康组织间子囊菌门相对丰度                              对丰度高于病斑组织ꎬ并且在轻度病叶中二者存
            存在显著性差异ꎮ 在轻度、中度和重度病叶病斑                             在显著性差异ꎮ
            组织 中ꎬ 子 囊 菌 门 的 相 对 丰 度 分 别 为 10. 25%、             2.2.3 OTU 属水平叶际群落结构  由图 5 可知ꎬ病
            25.86%和 32.22%ꎬ担子菌门的相对丰度分别为                        斑与健康组织样品共有的细菌和真菌 OTU 数目分
            4.52%、2.48%和 4.35%ꎮ 健康组织子囊菌门相对                     别为 9 和 190ꎬ其中共有的细菌 OTU 分别属于假
            丰度随病害程度的增加而减少( Aj、Bj 和 Cj 的相                       单胞菌属、泛菌属、立克次氏体目 Rickettsiales 等ꎬ
            对丰度分别为 6.31%、5.14%和 0.47%)ꎬ而担子菌                    共有的真菌 OTU 分别属于链格孢属、锥盖伞属、小
            门相对 丰 度 随 病 害 程 度 的 增 加 而 增 加 ( 分 别 为              不整球壳属、茎点霉属等ꎮ 病叶 Bb 和健叶 Bj 样品
            0.19%、0.30%和 0.47%)ꎮ                               细菌群落独有的 OTU 数目较其他烟叶样品高( 图
            2.2.2 属水平叶际群落结构  由图 4:A 可知ꎬ健康                      5:A)ꎻ病叶 Bb 样品真菌群落独有的 OTU 数目较
            与病斑组织的细菌群落在属水平上为假单胞菌属                              其他烟叶组织高(图 5:B)ꎮ
            ( Pseudomonas) 和 泛 菌 属 ( Pantoea)ꎮ 病 斑 组 织         2.3 叶际微生物群落 α 多样性
            Ab、Bb 和 Cb 假 单 胞 菌 属 的 相 对 丰 度 ( 分 别 为                 由表 3 可知ꎬ烟叶健康与病斑组织的覆盖度指
            39.47%、59.83%和 46.05%) 与健康组织 Aj、Bj 和               数均大于 0.997ꎬ表明测序结果包含绝大多数微生

            Cj 假单胞菌属的相对丰度( 分别为 0.57%、5.95%                     物群落ꎮ 供试 6 组样品细菌群落的 Simpson 指数、
            和 1.10%) 存在显著差异ꎮ 病斑组织泛菌属的相                         ACE 指数和覆盖度指数均无显著性差异ꎬ仅轻度
            对丰度随病害程度增加而逐级上升ꎬ与健康组织                              病斑组织的 Shannon 指数与健康组织存在显著性

            无显著性差异ꎮ                                            差异ꎬ中度病斑组织的 Chao1 指数显著高于轻度
                 烟叶健康和病斑组织的真菌群落优势属包括                           和重度病叶健康组织ꎮ 病斑组织细菌群落物种多
            链 格 孢 属 ( Alternaria )、 小 不 整 球 壳 属                样性 与 丰 富 度 高 于 健 康 组 织ꎬ Shannon 指 数 和
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