Page 96 - 《广西植物》2024年第10期
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表 1 样本测序数据及其质控
Table 1 Sample sequencing data and its quality control
序列平均长度
序列碱基数
样本 原始序列 有效序列 Number of Average 质量值 GC 含量 利用率
length of Q20 GC content Use efficiency
Sample Raw reads Clean reads sequence
sequence (%) (%) (%)
bases
(bp)
细菌 Ab 83 359 80 054 32 126 180 401 78.12 55.19 96.05
Bacterium
Aj 81 920 80 147 32 116 929 400 77.29 55.57 97.83
Bb 82 652 80 071 32 731 291 408 72.65 54.99 96.88
Bj 81 654 80 079 32 559 142 406 70.24 55.49 98.07
Cb 83 833 80 106 32 528 325 406 69.94 54.71 95.64
Cj 81 902 80 096 32 246 736 402 77.69 55.56 97.79
真菌 Ab 74 998 74 697 20 947 741 280 77.86 57.71 99.60
Fungus
Aj 57 883 57 698 17 025 787 295 76.90 59.28 99.68
Bb 79 268 77 455 19 019 860 246 77.37 52.51 97.82
Bj 68 573 68 346 19 933 811 292 76.76 59.16 99.68
Cb 81 101 80 085 18 928 691 236 79.87 52.31 98.76
Cj 62 886 62 601 17 935 754 284 74.93 58.16 99.53
健康和病斑组织的真菌群落主要为子囊菌门 (Plectosphaerella) 和锥盖伞属( Conocybe)ꎬ其病斑
(Ascomycota) 和 担 子 菌 门 ( Basidiomycota) ( 图 3: 组织的相对丰度高于健康组织ꎬ但无显著性差异
B)ꎮ 其相对丰度病斑组织高于健康组织ꎬ其中重 (图 4:B)ꎬ而茎点霉属( Phoma) 在健康组织的相
度病叶病斑组织与健康组织间子囊菌门相对丰度 对丰度高于病斑组织ꎬ并且在轻度病叶中二者存
存在显著性差异ꎮ 在轻度、中度和重度病叶病斑 在显著性差异ꎮ
组织 中ꎬ 子 囊 菌 门 的 相 对 丰 度 分 别 为 10. 25%、 2.2.3 OTU 属水平叶际群落结构 由图 5 可知ꎬ病
25.86%和 32.22%ꎬ担子菌门的相对丰度分别为 斑与健康组织样品共有的细菌和真菌 OTU 数目分
4.52%、2.48%和 4.35%ꎮ 健康组织子囊菌门相对 别为 9 和 190ꎬ其中共有的细菌 OTU 分别属于假
丰度随病害程度的增加而减少( Aj、Bj 和 Cj 的相 单胞菌属、泛菌属、立克次氏体目 Rickettsiales 等ꎬ
对丰度分别为 6.31%、5.14%和 0.47%)ꎬ而担子菌 共有的真菌 OTU 分别属于链格孢属、锥盖伞属、小
门相对 丰 度 随 病 害 程 度 的 增 加 而 增 加 ( 分 别 为 不整球壳属、茎点霉属等ꎮ 病叶 Bb 和健叶 Bj 样品
0.19%、0.30%和 0.47%)ꎮ 细菌群落独有的 OTU 数目较其他烟叶样品高( 图
2.2.2 属水平叶际群落结构 由图 4:A 可知ꎬ健康 5:A)ꎻ病叶 Bb 样品真菌群落独有的 OTU 数目较
与病斑组织的细菌群落在属水平上为假单胞菌属 其他烟叶组织高(图 5:B)ꎮ
( Pseudomonas) 和 泛 菌 属 ( Pantoea)ꎮ 病 斑 组 织 2.3 叶际微生物群落 α 多样性
Ab、Bb 和 Cb 假 单 胞 菌 属 的 相 对 丰 度 ( 分 别 为 由表 3 可知ꎬ烟叶健康与病斑组织的覆盖度指
39.47%、59.83%和 46.05%) 与健康组织 Aj、Bj 和 数均大于 0.997ꎬ表明测序结果包含绝大多数微生
Cj 假单胞菌属的相对丰度( 分别为 0.57%、5.95% 物群落ꎮ 供试 6 组样品细菌群落的 Simpson 指数、
和 1.10%) 存在显著差异ꎮ 病斑组织泛菌属的相 ACE 指数和覆盖度指数均无显著性差异ꎬ仅轻度
对丰度随病害程度增加而逐级上升ꎬ与健康组织 病斑组织的 Shannon 指数与健康组织存在显著性
无显著性差异ꎮ 差异ꎬ中度病斑组织的 Chao1 指数显著高于轻度
烟叶健康和病斑组织的真菌群落优势属包括 和重度病叶健康组织ꎮ 病斑组织细菌群落物种多
链 格 孢 属 ( Alternaria )、 小 不 整 球 壳 属 样性 与 丰 富 度 高 于 健 康 组 织ꎬ Shannon 指 数 和