Page 32 - 《广西植物》2024年第12期
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2 1 9 0 广 西 植 物 44 卷
1.3.4 植物激素处理 使用 pH = 8.0 的 50 mmol 上进行电泳检测ꎬ经切胶回收后连接于 pMD ̄18T
L 磷酸缓冲液将水杨酸甲酯( 美国 Sigma 公司) 和 载体(TaKaRa)ꎬ连接产物转入感受态大肠杆菌ꎬ并
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茉莉酸甲酯(美国 Sigma 公司) 分别配制成终浓度 涂布到含有氨苄青霉素( Amp) 的抗性平板上培养
为 70 μgmL 和 100 μgmL 的溶液ꎬ喷洒前分 过夜ꎬ挑取单菌落进行菌液 PCR 验证ꎬ最后将 PCR
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 ̄1
别加入终体积为 0.01%的吐温 20ꎮ 在 40 d 苗龄的 验证正确的菌液送至武汉禾泰青生物公司测序ꎮ
‘ZH11’水稻整株均匀喷洒 2 mL 上述水杨酸甲酯 利用 Jalview 软件将测序结果与‘ 日本晴’ OCPI2
或者茉莉酸甲酯溶液ꎮ 分别在处理 0、1、2、4、8、 基因 序 列 进 行 比 对ꎮ 使 用 在 线 软 件 ExPASy
12、24、48 h 后剪取水稻茎秆ꎬ立即浸入液氮速冻ꎬ ( https: / / web. expasy. org / cgi ̄bin / protparam /
然后置于-80 ℃ 超低温冰箱中保存ꎮ 以相同条件 protparam)预测 OCPI2 蛋白分子量、理论等电点等
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下喷洒 2 mL 的 50 mmol L 磷 酸 缓 冲 液 ( pH 理化 特 性ꎬ 分 别 使 用 SignalP 5. 0 ( http: / / www.
8.0)的水稻茎秆作为对照ꎬ每个处理设置 3 次生物 cbs.dtu. dk / services/ SignalP / ) 预 测 OCPI2 蛋 白 的
学重复ꎮ 信 号 肽 和 TMHMM Server 2. 0 ( http: / / www. cbs.
1.4 总 RNA 提取及 cDNA 合成 dtu.dk / services/ TMHMM / )预测 OCPI2 蛋白的跨膜
水稻茎秆组织采用液氮研磨处理后ꎬ取 100 结构ꎬ 以 及 使 用 Conserved Domain Search Service
mg 样 品 用 于 提 取 总 RNAꎬ 参 照 RNAiso Plus ( https: / / www. ncbi. nlm. nih. gov / Structure / cdd /
(TaKaRa)说明书进行ꎮ 提取的 RNA 经琼脂糖凝 wrpsb.cgi)对 OCPI2 蛋白进行结构域预测ꎮ
胶电 泳 检 测 确 认 无 降 解 后ꎬ 用 NanoDrop 2000
(Thermo Fisher Scientificꎬ USA) 检 测 其 浓 度 和 纯 表 1 本研究所用引物信息
TM Table 1 Information of primers used in this study
度ꎮ 以 1 μg 总 RNA 为模板ꎬ参照 PrimeScript RT
reagent Kit with gDNA Eraser ( Perfect Real Time) 引物 序列(5′→3′) 用途
(TaKaRa)试剂盒说明书合成 cDNAꎮ 该反应采用 Primer Sequence (5′→3′) Purpose
20 μL 反应体系ꎬ分两步进行:第一ꎬ去除基因组 OCPI2 ̄F GCTTCATTAATTTGCTGTGACC 基因克隆
Gene
DNAꎻ第二ꎬ再反转录成 cDNAꎮ 具体包括以下步 OCPI2 ̄R GATGCATGTTGTAATGTGATAAATA cloning
骤ꎬ第 一 步 反 应: 1 μg 总 RNAꎬ 2 μL 5 × gDNA qOCPI2 ̄F GCCAAGGCGAAAATCAAG 实时荧光
定量 PCR
Eraser Bufferꎬ 1 μL gDNA Eraserꎬ 加 RNase Free qOCPI2 ̄R CAATCTTGGGAATCTCGG qRT ̄PCR
dH O至 10 μLꎮ 反应条件:42 ℃ ꎬ 2 minꎬ 4 ℃ 终止
2 qOs18s ̄F CTACGTCCCTGCCCTTTGTACA
反应ꎮ 第二 步 反 应: 第 一 步 反 应 液 10 μLꎬ1 μL qOs18s ̄R ACACTTCACCGGACCATTCAA
PrimeScript RT Enzyme Mix Iꎬ1 μL RT Primer Mixꎬ
4 μL 5 × PrimeScript Buffer 2 ( for Real Time)ꎬ加
RNase Free dH O 至总体积 20 μLꎮ 反应条件:37 1.6 同源序列比对和系统发育分析
2
℃ 15 minꎬ85 ℃ 50 s 终止反应ꎮ 试验全程在超净 利用 NCBI 数据库 Blastp 工具获取其他禾本
工作台上完成ꎬ使用耗材均为 RNase Freeꎬ反应液 科植物同源基因氨基酸序列ꎬ分别使用 Jalview 和
的配置均在冰上完成ꎬ合成的 cDNA 保存于-20 ℃ MEGA 11 软件进行同源序列比对和系统发育树构
冰箱用于后续试验ꎮ 建ꎬ系统发育树构建采用邻接法( Neighbor ̄Joiningꎬ
1.5 水稻 OCPI2 基因克隆与序列分析 NJ)ꎬBootstrap 值设置为 1 000 次ꎮ
根 据 水 稻 基 因 组 数 据 库 ( Rice Genome 1.7 实时荧光定量 PCR
Annotation Projectꎬ RGAP)报道的‘日本晴’ ( Oryza 利用 CFX96 型实时荧光定量 PCR 仪( 美国
sativa spp. japonica ) OCPI2 基 因 ( LOC _ 伯乐公司) 检测 OCPI2 在不同处理下的表达ꎮ 采
Os01g42860)序列ꎬ用 Primer 5 软件设计包含该基 用 Primer 5 软件设计 OCPI2 基因特异性定量引
因全部 CDS 的上下游引物ꎬ引物序列见表 1ꎬ送至 物ꎬ引物序列见表 1ꎬ送至生工生物工程( 上海)
生工生物工程(上海)股份有限公司合成ꎮ 以二化 股份 有 限 公 司 合 成ꎮ 参 照 2X M5 HiPer SYBR
螟幼虫为害 24 h 的‘ ZH11’ 水稻茎秆 cDNA 为模 Premix Es Taq ( 聚 合 美) 说 明 书ꎬ 选 择 10 μL 的
板进行 PCR 扩增ꎬ将扩增产物在 1%的琼脂糖凝胶 PCR 反 应 体 系ꎬ 包 括 5 μL 的 SYBRꎬ 2 μL 的