Page 106 - 《广西植物》2024年第2期

３ ０ ８ 广 西 植 物 ４４ 卷

图 ３ ＲｇＯＡＴＷＳＤ 与其他植物 ＯＡＴＷＳＤ 蛋白系统进化树
Ｆｉｇ. ３ Ｐｈｙｌｏｇｅｎｅｔｉｃ ｔｒｅｅｓ ｏｆ ＲｇＯＡＴＷＳＤ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ＯＡＴＷＳＤ ｐｒｏｔｅｉｎｓ

图 ４ ＲｇＯＡＴＷＳＤ 二级结构预测
Ｆｉｇ. ４ Ｐｒｅｄｉｃｔｉｏｎ ｏｆ ｓｅｃｏｎｄａｒｙ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅｓ ｏｆ ＲｇＯＡＴＷＳＤ

利用 ＳｉｇｎａｌＰ￣４.１ 工具对编码氨基酸序列进行 延伸链和 ３.２４％的 β 转角共 ４ 种结构元件组成ꎬ

在线分析ꎬ结果表明 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 和 ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 其中 α 螺旋比例最大ꎻＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 由 ３９.３２％ 的
蛋白的信号肽无峰值出现ꎬ说明地黄 ＯＡＴＷＳＤ 蛋 α 螺旋、４１.０１％ 的无规卷曲、１６.４９％ 的延伸链和
白不存在信号肽ꎬ也说明该蛋白不属于分泌型蛋 ３.１７％的 β 转角共 ４ 种结构元件组成ꎬ其中无规卷
白ꎮ 利用 ＷｏＬＦ ＰＳＯＲＴ 工具对编码氨基酸序列进 曲的比例最大(图 ４)ꎮ
行亚 细 胞 定 位 分 析ꎬ 结 果 表 明 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 和 ２.４ ＲｇＯＡＴＷＳＤ 保守结构域预测
ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 蛋白均可能存在于内质网中ꎮ 应用 利用 ＮＣＢＩ 的 Ｃｏｎｓｅｒｖｅｄ Ｄｏｎｍａｉｎ Ｓｅａｒｃｈ 进行
ＳＯＰＭＡ 对 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 和 ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 蛋白进行 在线分析ꎬ发现 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 与 ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 均具
二 级 结 构 分 析ꎮ 结 果 发 现ꎬ ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 由 有 ａｃｙｌ＿ＷＳ＿ＤＧＡＴ 保守域与 ＤＵＦ１２９８ 超家族ꎬ前
３９.９６％的 α 螺旋、３９.０９％的无规卷曲、１７.７１％的 者分别覆盖 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 氨基酸序列的 ９２.６５％和