Page 104 - 《广西植物》2024年第2期

３ ０ ６ 广 西 植 物 ４４ 卷

∗表示终止密码ꎮ 方框中密码子为起始密码子ꎮ
∗ ｉｎｄｉｃａｔｅｓ ｔｅｒｍｉｎａｔｉｏｎ ｃｏｄｏｎ. Ｔｈｅ ｃｏｄｏｎ ｉｎ ｂｏｘ ｉｓ ｔｈｅ ｓｔａｒｔ ｃｏｄｏｎ.
图 １ ＲｇＯＡＴＷＳＤ 核苷酸序列及其编码蛋白质的氨基酸序列
Ｆｉｇ. １ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ＲｇＯＡＴＷＳＤ ａｎｄ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ ｉｔｓ ｃｏｄｉｎｇ ＲｇＯＡＴＷＳＤ ｐｒｏｔｅｉｎｓ

芝麻 [ Ｓｅｓａｍｕｍ ｉｎｄｉｃｕｍ ( ＸＰ ＿０１１０９２５５７.１)]、紫 子式为 Ｃ Ｈ Ｎ Ｏ Ｓ ꎬ 带 负 电 荷 残 基 总 数
２２８３ ３６９３ ６３９ ６４９ ２６
花 风 铃 木 [ Ｈａｎｄｒｏａｎｔｈｕｓ ｉｍｐｅｔｉｇｉｎｏｓｕｓ (Ａｓｐ＋Ｇｌｕ) ５０ 个与带正电荷残基总数( Ａｒｇ ＋Ｌｙｓ)
(ＰＩＭ９９６３５.１)] 的相似度较高ꎬ分别为 ８７. ７９％、 ５７ 个ꎬ理论等电点为 ８.８６ꎬ该蛋白不稳定指数预测
８３. ６２％、 ８２. ５１％ꎻ ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 与 白 花 泡 桐 结果是 ４５.１９ꎬ为不稳定蛋白ꎬ脂肪指数为 １０２.７６ꎬ总
(ＫＡＩ３４５７２２７.１)、芝麻( ＸＰ ＿０１１１００３６１. １)、松蒿 的亲 水 性 平 均 系 数 为 ０. ０４９ꎬ 属 于 疏 水 性 蛋 白ꎻ
[Ｐｈｔｈｅｉｒｏｓｐｅｒｍｕｍ ｊａｐｏｎｉｃｕｍ ( ＧＦＰ８６４０１. １)] 的 相 ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 由 ４７３ 个氨基酸残基组成ꎬ包括 ２０ 种
似度较高ꎬ分别为 ８３.０１％、７８.６９％、７７.７３％ꎮ 利 氨基酸ꎬ其中 Ｌｅｕ、Ｌｙｓ 和 Ｓｅｒ 含量多ꎬ分别为 １１.６％、
用 ＭＥＧＡ ６.０ 进行 ＯＡＴＷＳＤ 蛋白系统进化树的构 ７.６％和 ７.６％ꎬ相对分子质量为 ５２.４９ ｋＤꎬ化学分子
建ꎬ结果如图 ３ 所示ꎮ 由图 ３ 可知ꎬＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 式为 Ｃ Ｈ Ｎ Ｏ Ｓ ꎬ带负电荷残基总数(Ａｓｐ＋
２３５３ ３７９１ ６２９ ６７９ ２３
与白 花 泡 桐 聚 为 一 支ꎬ 进 化 上 亲 缘 关 系 最 近ꎬ Ｇｌｕ) ４４ 个与带正电荷残基总数(Ａｒｇ＋Ｌｙｓ) ５７ 个ꎬ
ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 与松蒿聚为一支ꎬ进化上亲缘关系最 理论等电点为 ９.３４ꎬ该蛋白不稳定指数预测结果是
近ꎬ其中白花泡桐与松蒿均属于玄参科ꎮ ４２.９３ꎬ为不稳定蛋白ꎬ脂肪指数为 ９２.９６ꎬ总的亲水
２.３ ＲｇＯＡＴＷＳＤ 理化学性质 性平均系数为－０.１４０ꎬ属于亲水性蛋白ꎮ
利 用 ＥｘＰＡＳｙ￣ＰｒｏｔＰａｒａｍ ｔｏｏｌ 在 线 工 具 对 利 用 ＮｅｔＰｈｏｓ ２. ０ 工 具 对 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 与
ＲｇＯＡＴＷＳＤ 进 行 化 学 性 质 分 析ꎮ 结 果 发 现ꎬ ＲｇＯＡＴＷＳＤ２ 编码的氨基酸序列进行在线分析ꎬ结
ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 由 ４６３ 个氨基酸残基组成ꎬ包括 ２０ 种 果表明分值大于 ０.５ 的各类磷酸化位点分别有 ４２
氨基酸ꎬ其中 Ａｌａ、Ｌｅｕ 和 Ｓｅｒ 含量高ꎬ分别为 ８.４％、 个和 ４４ 个ꎬ 并 均 匀 分 布 在 多 肽 链 中ꎮ 其 中ꎬ
１１.０％和 ８.２％ꎬ相对分子质量为 ５１. ３１ ｋＤꎬ化学分 ＲｇＯＡＴＷＳＤ１ 丝氨酸磷酸化位点有 ３７ 个ꎬ苏氨酸