Page 153 - 《广西植物》2024年第5期
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5 期 刘芳等: Pre ̄miR172 及 miR172 调控油菜 AP2 基因表达的规律分析 9 4 1
表 3 油菜 AP2 基因的选择压力分析
Table 3 Selection pressure analysis of rape AP2
类别 基因 1 基因 2 选择压力
ka ks ka / ks
Category Gene 1 Gene 2 Selection pressure
直系同源 Bra017809 XM_013887071 0 0 — —
Orthologous
Bra011741 XM_048778068 0.002 0 0.006 6 0.303 0 纯化选择
Purifying selection
KC584094 HQ637468 0.013 5 0 — —
KC584094 XM_048770445 0.025 0 0.085 8 0.291 3 纯化选择
Purifying selection
KC584094 XM_013887073 0.025 0 0.085 8 0.291 3 纯化选择
Purifying selection
KC584094 XM_048763426 0.006 2 0.048 6 0.127 5 纯化选择
Purifying selection
旁系同源 HQ637468 XM_048770445 0.025 0 0.085 8 0.291 3 纯化选择
Paralogous Purifying selection
HQ637468 XM_013887073 0.025 0 0.085 8 0.291 3 纯化选择
Purifying selection
HQ637468 XM_048763426 0.006 2 0.048 6 0.127 5 纯化选择
Purifying selection
XM_048770445 XM_013887073 0 0 — —
XM_048770445 XM_048763426 0.018 6 0.034 8 0.534 4 纯化选择
Purifying selection
XM_013887073 XM_048763426 0.018 6 0.034 8 0.534 4 纯化选择
Purifying selection
XM_048778068 XM_013887071.3 0.042 1 0.222 9 0.188 8 纯化选择
Purifying selection
2.3.4 AP2 蛋白基序分析 由图 2 可知ꎬ所有油菜 通过 qRT ̄PCR 检测 miR172 家族的表达水平ꎬ
AP2 蛋白候选序列均存在 3 个 保 守 基 序 ( 图 2: 结果如图 3:B-E 所示ꎬmiR172 家族在早熟和晚熟
A)ꎬ基序 1(Motif 1) 和基序 2( Motif 2) 高度保守ꎬ 油菜的根、叶和花中均有表达ꎬ而且花中的表达水
基序 3(Motif 3)有 3 个氨基酸位置保守性较低( 图 平普遍高于根和叶ꎬ只有 miR172d 在晚熟油菜花中
2: B)ꎬ说明不同油菜 AP2 基因功能的差异可能依 的 表 达 量 低 于 根 和 叶ꎮ miR172a、 miR172b 和
赖于基序 3 来发挥ꎮ miR172c 在早熟油菜不同组织中的表达规律和 AP2
2.4 miR172 家族与 AP2 表达水平及二者相关性分析 一致ꎬ 花 中 表 达 量 高 于 根 和 叶ꎬ 说 明 miR172a、
由图 3 可知ꎬAP2 在根和叶中的表达水平呈现 miR172b 和 miR172c 对于早熟油菜 AP2 基因有促
为早熟低于晚熟ꎬ但在花中则早熟明显高于晚熟 进 表 达 的 作 用ꎮ 在 晚 熟 油 菜 中ꎬ miR172a 和
(图 3:A)ꎮ 对于早熟油菜ꎬ根和叶中 AP2 表达量 miR172c 在花中表达水平显著高于非花组织ꎬ但差
明显低于花的表达量ꎻ对于晚熟油菜则相反ꎬ呈现 距较小ꎬ说明 miR172a 和 miR172c 对于 AP2 基因虽
根和叶中 AP2 表达量高于花的ꎮ 早熟油菜花中 表现为负调控ꎬ但作用较小ꎻmiR172b 在花中表达量
AP2 表达量显著高于晚熟油菜花ꎬ初步推测 AP2 高于非花组织ꎬ与 AP2 表达规律相反ꎬ说明在晚熟
基因的综合作用结果是促进开花ꎮ 油菜中 miR172b 对于 AP2 起到负调控的作用ꎮ 在
通过 miRBase 下载得到 4 条成熟油菜 miR172 早熟油菜中ꎬmiR172d 在不同组织之间表达量差异
家族成员ꎬ分别是 bna ̄miR172a、bna ̄miR172b、bna ̄ 不显著ꎬ在晚熟油菜中 miR172d 表达规律和 AP2 一
miR172c 和 bna ̄miR172dꎮ 经过多重比对 miR172 致ꎬ非花组织的表达量显著高于花的表达量ꎬ说明
家族成员和 AP2 基因ꎬ发现 4 个家族成员高度保 miR172d 对于晚熟油菜 AP2 可能起正调控作用ꎬ而
守ꎬ仅存在 1 个碱基的差异ꎬAP2 基因和 miR172 在早熟油菜中可能不发挥功能或作用微弱ꎮ
高度同源互补ꎬ仅有 1 ~ 3 个碱基的差异(图 3:F)ꎬ 为进一步确定 miR172 家族各成员与 AP2 基
初步推测这些 AP2 基因是 miR172 的靶基因ꎮ 因的关系ꎬ分析 AP2 和 miR172 家族各成员表达规