Page 153 - 《广西植物》2024年第5期
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5 期               刘芳等: Pre ̄miR172 及 miR172 调控油菜 AP2 基因表达的规律分析                               9 4 1

                                            表 3  油菜 AP2 基因的选择压力分析
                                         Table 3  Selection pressure analysis of rape AP2
                类别            基因 1             基因 2                                              选择压力
                                                               ka         ks        ka / ks
               Category       Gene 1           Gene 2                                          Selection pressure
               直系同源          Bra017809      XM_013887071       0          0          —             —
              Orthologous
                             Bra011741      XM_048778068     0.002 0    0.006 6    0.303 0       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                             KC584094         HQ637468       0.013 5      0          —             —
                             KC584094       XM_048770445     0.025 0    0.085 8    0.291 3       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                             KC584094       XM_013887073     0.025 0    0.085 8    0.291 3       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                             KC584094       XM_048763426     0.006 2    0.048 6    0.127 5       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
               旁系同源          HQ637468       XM_048770445     0.025 0    0.085 8    0.291 3       纯化选择
               Paralogous                                                                     Purifying selection
                             HQ637468       XM_013887073     0.025 0    0.085 8    0.291 3       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                             HQ637468       XM_048763426     0.006 2    0.048 6    0.127 5       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                           XM_048770445     XM_013887073       0          0          —             —

                           XM_048770445     XM_048763426     0.018 6    0.034 8    0.534 4       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                           XM_013887073     XM_048763426     0.018 6    0.034 8    0.534 4       纯化选择
                                                                                              Purifying selection
                           XM_048778068    XM_013887071.3    0.042 1    0.222 9    0.188 8       纯化选择
                                                                                              Purifying selection


            2.3.4 AP2 蛋白基序分析  由图 2 可知ꎬ所有油菜                         通过 qRT ̄PCR 检测 miR172 家族的表达水平ꎬ

            AP2 蛋白候选序列均存在 3 个 保 守 基 序 ( 图 2:                   结果如图 3:B-E 所示ꎬmiR172 家族在早熟和晚熟
            A)ꎬ基序 1(Motif 1) 和基序 2( Motif 2) 高度保守ꎬ             油菜的根、叶和花中均有表达ꎬ而且花中的表达水
            基序 3(Motif 3)有 3 个氨基酸位置保守性较低( 图                    平普遍高于根和叶ꎬ只有 miR172d 在晚熟油菜花中
            2: B)ꎬ说明不同油菜 AP2 基因功能的差异可能依                        的 表 达 量 低 于 根 和 叶ꎮ miR172a、 miR172b 和
            赖于基序 3 来发挥ꎮ                                        miR172c 在早熟油菜不同组织中的表达规律和 AP2
            2.4 miR172 家族与 AP2 表达水平及二者相关性分析                    一致ꎬ 花 中 表 达 量 高 于 根 和 叶ꎬ 说 明 miR172a、
                 由图 3 可知ꎬAP2 在根和叶中的表达水平呈现                      miR172b 和 miR172c 对于早熟油菜 AP2 基因有促
            为早熟低于晚熟ꎬ但在花中则早熟明显高于晚熟                              进 表 达 的 作 用ꎮ 在 晚 熟 油 菜 中ꎬ miR172a 和
            (图 3:A)ꎮ 对于早熟油菜ꎬ根和叶中 AP2 表达量                       miR172c 在花中表达水平显著高于非花组织ꎬ但差
            明显低于花的表达量ꎻ对于晚熟油菜则相反ꎬ呈现                             距较小ꎬ说明 miR172a 和 miR172c 对于 AP2 基因虽
            根和叶中 AP2 表达量高于花的ꎮ 早熟油菜花中                           表现为负调控ꎬ但作用较小ꎻmiR172b 在花中表达量
            AP2 表达量显著高于晚熟油菜花ꎬ初步推测 AP2                          高于非花组织ꎬ与 AP2 表达规律相反ꎬ说明在晚熟
            基因的综合作用结果是促进开花ꎮ                                    油菜中 miR172b 对于 AP2 起到负调控的作用ꎮ 在
                 通过 miRBase 下载得到 4 条成熟油菜 miR172                早熟油菜中ꎬmiR172d 在不同组织之间表达量差异
            家族成员ꎬ分别是 bna ̄miR172a、bna ̄miR172b、bna ̄              不显著ꎬ在晚熟油菜中 miR172d 表达规律和 AP2 一
            miR172c 和 bna ̄miR172dꎮ 经过多重比对 miR172               致ꎬ非花组织的表达量显著高于花的表达量ꎬ说明
            家族成员和 AP2 基因ꎬ发现 4 个家族成员高度保                         miR172d 对于晚熟油菜 AP2 可能起正调控作用ꎬ而

            守ꎬ仅存在 1 个碱基的差异ꎬAP2 基因和 miR172                      在早熟油菜中可能不发挥功能或作用微弱ꎮ
            高度同源互补ꎬ仅有 1 ~ 3 个碱基的差异(图 3:F)ꎬ                         为进一步确定 miR172 家族各成员与 AP2 基
            初步推测这些 AP2 基因是 miR172 的靶基因ꎮ                        因的关系ꎬ分析 AP2 和 miR172 家族各成员表达规
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