Page 154 - 《广西植物》2024年第5期
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A. AP2 基因的进化树分析ꎻ B. miR172 进化树分析ꎻ C. pre ̄miR172 进化树分析ꎮ
A. Phylogenetic analysis of AP2 geneꎻ B. Phylogenetic analysis of miR172ꎻ C. Phylogenetic analysis of pre ̄miR172.
图 1 AP2、miR172、pre ̄miR172 的进化树分析
Fig. 1 Phylogenetic analysis of AP2ꎬ miR72 and pre ̄miR172
律之间的相关系数(r 值)和差异显著性(P 值)ꎬ结 中欧洲油菜 pre ̄miR172c 的二级结构自由能最高ꎬ
果如表 4 所示ꎬ在早熟油菜中 miR172 家族各成员 欧洲油菜 pre ̄miR172a 的二级结构自由能最低ꎮ 由
与 AP2 均 呈 显 著 或 高 度 正 相 关ꎬ 在 晚 熟 油 菜 中 图 4 可知ꎬ白菜和甘蓝 pre ̄miR172a 二级结构一致ꎬ
miR172d 与 AP2 呈高度正相关ꎬ miR172b 与 AP2 但由于 5′端缺少 CGUU 4 个碱基ꎬ3′端缺少 CGACG
呈负相关ꎬmiR172a 和 miR172c 与 AP2 低度相关ꎬ 5 个碱基ꎬ导致其在油菜中的二级结构缺少 1 个环
说明在早熟油菜中 miR172 家族促进 AP2 表达ꎬ但 区和部分茎部碱基配对ꎬ致使自由能下降 3.1 kcal
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在晚熟油菜中 miR172b 抑制 AP2 表达ꎬmiR172d mol ꎻpre ̄miR172b 在白菜和甘蓝中的二级结构一
促进 AP2 表达ꎮ 致ꎬ但欧洲油菜中则由于碱基差异ꎬ导致其茎部碱
综上所述ꎬ油菜 AP2 基因可能促进开花ꎬ而且 基配对数目增加ꎬ同时ꎬ虽然同为 5 个环区ꎬ但欧洲
其功能的发挥受到 miR172 的靶向调控ꎮ 在早熟 油菜中的环更小ꎬ因此二级结构自由能增加ꎬ稳定
油菜中 miR172 家族促进 AP2 表达水平增加进而 性更强ꎮ 与白菜相比ꎬ欧洲油菜 pre ̄miR172c 整体
促进开花ꎬ但其中 miR172d 作用不明显ꎮ 在晚熟 碱基数更多ꎬ茎部配对数目更多ꎬ导致自由能更高ꎬ
油菜中ꎬmiR172a 和 miR172c 对于 AP2 的调控作 二级结构更稳定ꎻ欧洲油菜 pre ̄miR172d 相较于白
用较小ꎬmiR172b 和 miR172d 二者共同发挥作用 菜多形成了 1 个环区ꎬ自由能降低ꎬ二级结构稳定性
降低 AP2 的表达水平ꎬ从而抑制晚熟油菜的开花ꎮ 更弱一些ꎮ 欧洲油菜中 pre ̄miR172a 的稳定性最
2.5 Pre ̄miR172 的二级结构分析 低ꎬ 然 后 依 次 是 pre ̄miR172d、 pre ̄miR172bꎬ pre ̄
从 miRBase 下载到 4 个欧洲油菜 pre ̄miR172 miR172c 稳定性最强ꎮ
家族成员ꎬ4 个白菜 pre ̄miR172 家族成员ꎬ2 个甘蓝 2.6 miR172 与 pre ̄miR172 功能的相关性分析
pre ̄miR172 家族成员ꎮ 利用 RNAfold(3.2) 软件预 通过 qRT ̄PCR 检测 pre ̄miR172 家族 各 成 员
测油菜、白菜和甘蓝的 pre ̄miR172 家族基因二级结 的表达水平ꎬ将 pre ̄miR172 家族和 miR172 家族表
构ꎬ结果如表 5 所示ꎬpre ̄miR172 的基本二级结构均 达量进行对比ꎬ发现在早熟油菜和晚熟油菜花中
为茎环结构ꎬ其自由能为 40.3 ~ 67.7 kcalmol ꎬ其 pre ̄miR172a 表达量高于根和叶ꎬmiR172a 也随之
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