Page 67 - 《广西植物》2024年第5期
P. 67

5 期             成彦丽等: 皖北淮河平原幼龄‘中山杉 118’根际与非根际细菌特征分析                                         8 5 5

            Uparse version 7. 0. 1001 ( http: / / www. drive5. com /  Anosim 函数完成根际与非根际组间差异显著性检
            uparse / )软件先将 97%一致的有效数据进行聚类ꎬ                     测ꎬ组间差异程度用 R 值表示ꎬR>0 表示组间差异
            再采用 Mothur 方法( Edgarꎬ2013) 与 SILVA138 的            大于组内差异ꎬR<0 表示组间差异小于组内差异ꎬ
            SSUrRNA ( http: / / www. arb ̄silva. de / ) 数 据 库 对  P 值则 表 示 差 异 是 否 显 著ꎮ 用 Qiime 软 件 计 算

            OTUs 的序列进行物种注释ꎮ                                    Unifrac 距离ꎬ构 建 UPGMA 样 本 聚 类 树ꎮ 先 用 R
            1.2.3 数据分析  基于 R 软件对‘ 中山杉 118’ 根                   软件中 psych 包分析环境因子与微生物丰富度之

            际与非根际的土壤理化因子进行独立样本 t 检验ꎬ                           间 Spearman 相关系数ꎬ系数介于-1 ~ 1 之间ꎬ其大
            计量数据以 x±s 表示ꎬP<0.05 表示差异有统计学                       于 0 为 正 相 关ꎬ 而 小 于 0 则 为 负 相 关ꎬ 再 用
                           x
            意义ꎮ 通过根际富集率 E(enrichment ratio)反映养                 pheatmap 包对结果进行可视化ꎮ
            分的富集程度ꎬ计算公式为 E = [( 根际含量-非根
                                                               2  结果与分析
            际含量) / 非 根 际 含 量] × 100% ( 杨 阳 和 刘 秉 儒ꎬ
            2015ꎻ马源等ꎬ2019)ꎮ
                 使用 Qiime Version 1.9.1 软件统计各样本的多              2.1 根际与非根际土壤理化性质分析
            样性指数ꎬ通过 R 软件中的函数对根际与非根际                                由表 1 可知ꎬ宿州市植物园‘中山杉 118’种植
            的多样性差异进行秩和检验ꎮ 基于 R vegan 包的                        土壤为碱性土壤ꎬ 样品根际土壤( R) pH 值均略低


                                       表 1  ‘中山杉 118’根际 / 非根际土壤的理化性质
                       Table 1  Physicochemical properties of R and NR soils of Taxodium ‘Zhongshanshan 118’

                                                根际 R                             非根际 NR                富集率
            土壤类型和编号                                                                                      E
            Soil type and code                               平均值                               平均值
                                   R1    R2   R3   R4   R5           NR1  NR2  NR3  NR4  NR5            (%)
                                                             Mean                               Mean
            酸碱值 pH                 8.68  8.42  8.53  8.48  8.23  8.47±0.07a  8.71  8.51  8.72  8.56  8.32  8.56±0.07a  —
            电导率                    159.9  175.9  162.3  185.2  203  177.3±7.91a  158.5  162.6  146.7  169.3  183.1  164.0±6.02a  —
                               ̄1
            Electrical conductivity (μScm )
            干湿比 Dry/ wet (%)       99.16  97.55  98.69  98.12  96.34  97.97±0.49a  98.67  97.93  98.96  98.19  95.80  97.91±0.56a  —
            有机碳                    1.92  4.05  3.08  3.06  8.27  4.08±1.10a  2.46  3.21  1.48  3.53  8.17  3.77±1.16a  8.22
                            ̄1
            Soil organic carbon (gkg )
            有机质                    3.31  6.98  5.31  5.27  14.25  7.03±1.90a  4.25  5.53  2.56  5.09  14.08  6.50±2.01a  8.15
                            ̄1
            Soil organic matter (gkg )
            全氮                     0.26  0.48  0.33  0.19  0.97  0.44±0.14a  0.28  0.44  0.14  0.46  0.86  0.44±0.12a  0.00
                         ̄1
            Total nitrogen (gkg )
            全磷                     0.46  0.46  0.44  0.48  0.60  0.49±0.03a  0.40  0.48  0.43  0.45  0.54  0.46±0.02a  6.52
                           ̄1
            Total phosphorus (gkg )
            全钾                     18.98  19.79  20.10  20.44  20.74  20.01±0.30a  19.28  18.70  18.46  19.55  21.07  19.41±0.46a  3.09
                          ̄1
            Total potassium (gkg )
            水解性氮                   25.15  39.66  18.86  43.65  71.46  39.76±9.14a  26.86  40.74  26.91  27.01  81.65 40.63±10.60a  -2.14
                               ̄1
            Hydrolyzable nitrogen (mgkg )
            有效磷                    2.41  1.98  1.81  1.14  3.59  2.19±0.41a  5.87  3.60  1.40  1.95  3.89  3.34±0.79a  -34.43
                              ̄1
            Available phosphorus (mgkg )
            速效钾                    48.65  85.05  55.71  100.44 117.36 81.44±13.04a 56.32  87.84  50.56  76.58  121.27 78.51±12.63a  3.73
                              ̄1
            Available potassium (mgkg )
            有效铁                    11.10  19.42  17.51  17.26  34.38  19.93±3.87a  10.53  13.30  11.46  12.39  21.41  13.82±1.95a  44.21
                           ̄1
            Available iron (mgkg )
            有效锰                    10.98  8.44  8.47  10.42  11.46  9.95±0.63a  7.97  7.28  5.99  8.61  9.47  7.86±0.59b  26.59
                              ̄1
            Available manganese (mgkg )
            有效铜                    0.53  1.04  0.67  0.84  2.28  1.07±0.31a  0.53  0.83  0.61  0.75  1.47  0.84±0.17a  27.38
                            ̄1
            Available copper (mgkg )
            有效锌                    0.79  1.06  0.48  1.22  1.02  0.91±0.13a  2.82  0.54  0.80  0.52  0.66  1.07±0.44a  -14.95
                           ̄1
            Available zinc (mgkg )
            速效钠                    29.86  39.28  23.86  44.65  47.78  37.09±4.49a  24.22  25.78  22.80  37.26  39.60  29.93±3.52a  23.92
                            ̄1
            Available sodium (mgkg )
            速效钙                    3.92  4.87  4.17  4.58  6.04  4.71±0.37a  3.87  4.61  3.81  4.38  5.94  4.52±0.39a  4.20
                            ̄1
            Available calcium (gkg )
            速效镁                   230.17 341.17 232.49 391.12 437.54  326.61±  231.85 289.81 119.40 348.75 446.12  303.18±  7.73
                              ̄1
            Available magnesium (mgkg )                     41.74a                            54.90a
              注: 同行数据后不同小写字母表示差异显著 (P<0.05)ꎮ 下同ꎮ
              Note: Different lowercase letters indicate significant difference in the same row (P<0.05). The same below.
   62   63   64   65   66   67   68   69   70   71   72