Page 67 - 《广西植物》2024年第5期
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5 期 成彦丽等: 皖北淮河平原幼龄‘中山杉 118’根际与非根际细菌特征分析 8 5 5
Uparse version 7. 0. 1001 ( http: / / www. drive5. com / Anosim 函数完成根际与非根际组间差异显著性检
uparse / )软件先将 97%一致的有效数据进行聚类ꎬ 测ꎬ组间差异程度用 R 值表示ꎬR>0 表示组间差异
再采用 Mothur 方法( Edgarꎬ2013) 与 SILVA138 的 大于组内差异ꎬR<0 表示组间差异小于组内差异ꎬ
SSUrRNA ( http: / / www. arb ̄silva. de / ) 数 据 库 对 P 值则 表 示 差 异 是 否 显 著ꎮ 用 Qiime 软 件 计 算
OTUs 的序列进行物种注释ꎮ Unifrac 距离ꎬ构 建 UPGMA 样 本 聚 类 树ꎮ 先 用 R
1.2.3 数据分析 基于 R 软件对‘ 中山杉 118’ 根 软件中 psych 包分析环境因子与微生物丰富度之
际与非根际的土壤理化因子进行独立样本 t 检验ꎬ 间 Spearman 相关系数ꎬ系数介于-1 ~ 1 之间ꎬ其大
计量数据以 x±s 表示ꎬP<0.05 表示差异有统计学 于 0 为 正 相 关ꎬ 而 小 于 0 则 为 负 相 关ꎬ 再 用
x
意义ꎮ 通过根际富集率 E(enrichment ratio)反映养 pheatmap 包对结果进行可视化ꎮ
分的富集程度ꎬ计算公式为 E = [( 根际含量-非根
2 结果与分析
际含量) / 非 根 际 含 量] × 100% ( 杨 阳 和 刘 秉 儒ꎬ
2015ꎻ马源等ꎬ2019)ꎮ
使用 Qiime Version 1.9.1 软件统计各样本的多 2.1 根际与非根际土壤理化性质分析
样性指数ꎬ通过 R 软件中的函数对根际与非根际 由表 1 可知ꎬ宿州市植物园‘中山杉 118’种植
的多样性差异进行秩和检验ꎮ 基于 R vegan 包的 土壤为碱性土壤ꎬ 样品根际土壤( R) pH 值均略低
表 1 ‘中山杉 118’根际 / 非根际土壤的理化性质
Table 1 Physicochemical properties of R and NR soils of Taxodium ‘Zhongshanshan 118’
根际 R 非根际 NR 富集率
土壤类型和编号 E
Soil type and code 平均值 平均值
R1 R2 R3 R4 R5 NR1 NR2 NR3 NR4 NR5 (%)
Mean Mean
酸碱值 pH 8.68 8.42 8.53 8.48 8.23 8.47±0.07a 8.71 8.51 8.72 8.56 8.32 8.56±0.07a —
电导率 159.9 175.9 162.3 185.2 203 177.3±7.91a 158.5 162.6 146.7 169.3 183.1 164.0±6.02a —
 ̄1
Electrical conductivity (μScm )
干湿比 Dry/ wet (%) 99.16 97.55 98.69 98.12 96.34 97.97±0.49a 98.67 97.93 98.96 98.19 95.80 97.91±0.56a —
有机碳 1.92 4.05 3.08 3.06 8.27 4.08±1.10a 2.46 3.21 1.48 3.53 8.17 3.77±1.16a 8.22
 ̄1
Soil organic carbon (gkg )
有机质 3.31 6.98 5.31 5.27 14.25 7.03±1.90a 4.25 5.53 2.56 5.09 14.08 6.50±2.01a 8.15
 ̄1
Soil organic matter (gkg )
全氮 0.26 0.48 0.33 0.19 0.97 0.44±0.14a 0.28 0.44 0.14 0.46 0.86 0.44±0.12a 0.00
 ̄1
Total nitrogen (gkg )
全磷 0.46 0.46 0.44 0.48 0.60 0.49±0.03a 0.40 0.48 0.43 0.45 0.54 0.46±0.02a 6.52
 ̄1
Total phosphorus (gkg )
全钾 18.98 19.79 20.10 20.44 20.74 20.01±0.30a 19.28 18.70 18.46 19.55 21.07 19.41±0.46a 3.09
 ̄1
Total potassium (gkg )
水解性氮 25.15 39.66 18.86 43.65 71.46 39.76±9.14a 26.86 40.74 26.91 27.01 81.65 40.63±10.60a -2.14
 ̄1
Hydrolyzable nitrogen (mgkg )
有效磷 2.41 1.98 1.81 1.14 3.59 2.19±0.41a 5.87 3.60 1.40 1.95 3.89 3.34±0.79a -34.43
 ̄1
Available phosphorus (mgkg )
速效钾 48.65 85.05 55.71 100.44 117.36 81.44±13.04a 56.32 87.84 50.56 76.58 121.27 78.51±12.63a 3.73
 ̄1
Available potassium (mgkg )
有效铁 11.10 19.42 17.51 17.26 34.38 19.93±3.87a 10.53 13.30 11.46 12.39 21.41 13.82±1.95a 44.21
 ̄1
Available iron (mgkg )
有效锰 10.98 8.44 8.47 10.42 11.46 9.95±0.63a 7.97 7.28 5.99 8.61 9.47 7.86±0.59b 26.59
 ̄1
Available manganese (mgkg )
有效铜 0.53 1.04 0.67 0.84 2.28 1.07±0.31a 0.53 0.83 0.61 0.75 1.47 0.84±0.17a 27.38
 ̄1
Available copper (mgkg )
有效锌 0.79 1.06 0.48 1.22 1.02 0.91±0.13a 2.82 0.54 0.80 0.52 0.66 1.07±0.44a -14.95
 ̄1
Available zinc (mgkg )
速效钠 29.86 39.28 23.86 44.65 47.78 37.09±4.49a 24.22 25.78 22.80 37.26 39.60 29.93±3.52a 23.92
 ̄1
Available sodium (mgkg )
速效钙 3.92 4.87 4.17 4.58 6.04 4.71±0.37a 3.87 4.61 3.81 4.38 5.94 4.52±0.39a 4.20
 ̄1
Available calcium (gkg )
速效镁 230.17 341.17 232.49 391.12 437.54 326.61± 231.85 289.81 119.40 348.75 446.12 303.18± 7.73
 ̄1
Available magnesium (mgkg ) 41.74a 54.90a
注: 同行数据后不同小写字母表示差异显著 (P<0.05)ꎮ 下同ꎮ
Note: Different lowercase letters indicate significant difference in the same row (P<0.05). The same below.